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Journal Article
  1. [PITS-12] G. Pitson, R. Lynch, L. Claude, and D. Sarrut, "A critique of the IASLC lymph node map: a radiation oncology perspective", Journal of Thoracic Oncology, vol. 7, no. 3, pp. 478–480, 03/2012 .
  2. [FASSI-12] A. Fassi, M. Riboldi, G. Baroni, J. Schaerer, and D. Sarrut, "In Regard to Yang et al", International Journal of Radiation Oncology * Biology * Physics, vol. 84, no. 2, 2012 .  Téléchargement: Fassi et al._2012_In regard to Yang et al.pdf (45.89 Ko)
  3. [AYAD-11] M. Ayadi, G. Bouilhol, L. Imbert, C. Ginestet, and D. Sarrut, "[Scan acquisition parameter optimization for the treatment of moving tumors in radiotherapy.]", Cancer radiotherapie : journal de la Societe francaise de radiotherapie oncologique, vol. 15, no. 2, 2011 .
  4. [SARR-10] D. Sarrut, and J. Vandemeulebroucke, "B-LUT: Fast and low memory B-spline image interpolation", Comput Meth Prog Bio, vol. 99, no. 2, pp. 172-178, aug, 2010 .
  5. [ZAHR-10] N. Zahra, T. Frisson, L. Grevillot, P. Lautesse, and D. Sarrut, "Influence of Geant4 parameters on dose distribution and computation time for carbon ion therapy simulation", Physica Medica: European Journal of Medical Physics, vol. 26, no. 4, pp. 202-206, oct, 2010 .
  6. [SARR-06a] D. Sarrut, "Deformable Registration for Image-Guided Radiation Therapy", Zeitschrift für Medizinische Physik, vol. 16, pp. 285–297, dec, 2006 .
Conference Paper
  1. [DELM-14] V. Delmon, J. Vandemeulebroucke, R. Pinho, M. Oliva, D. Sarrut, and S. Rit, "In-room breathing motion estimation from limited projection views using a sliding deformation model", International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), vol. 489, no. 1, pp. 012026, 2014 . Abstract
  2. [BOUI-14] G. Bouilhol, M. Ayadi, R. Pinho, S. Rit, and D. Sarrut, "Motion artifact detection in four-dimensional computed tomography images", Journal of Physics: Conference Series, vol. 489, no. 1: IOP Publishing, pp. 012024, 2014 .
  3. [RIT-14] S. Rit, M. Vila Oliva, S. Brousmiche, R. Labarbe, D. Sarrut, and G. C. Sharp, "The Reconstruction Toolkit (RTK), an open-source cone-beam CT reconstruction toolkit based on the Insight Toolkit (ITK)", International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), vol. 489, no. 1, pp. 012079, 2014 .
  4. [RIT-12] S. Rit, N. Freud, D. Sarrut, and J. M. Létang, "Distance-driven binning for proton CT filtered backprojection along most likely paths", Second International Conference on Image Formation in X-Ray Computed Tomography, Salt Lake City, USA, 2012 .
  5. [SARR-12] D. Sarrut, L. Claude, S. Rit, R. Pinho, G. Pitson, and R. Lynch, "Investigating mediastinal lymph node stations segmentation on thoracic CT following experts guidelines", MICCAI, Proceedings of the First International Workshop on Image-Guidance and Multimodal Dose Planning in Radiation Therapy, Nice, France, 2012 .
  6. [DELM-11] V. Delmon, S. Rit, R. Pinho, and D. Sarrut, "Direction dependent B-splines decomposition for the registration of sliding objects", Proceedings of the Fourth International Workshop on Pulmonary Image Analysis, Toronto, Canada, pp. 45–55, 09/2011 .
  7. [PINH-11] R. Pinho, V. Delmon, J. Vandemeulebroucke, S. Rit, and D. Sarrut, "Keuhkot: a method for lung segmentation", Proceedings of the Fourth International Workshop on Pulmonary Image Analysis, Toronto, Canada, pp. 225–232, 09/2011 .
  8. [GREV-11c] L. Grevillot, D. Bertrand, F. Dessy, N. Freud, and D. Sarrut, "A Monte Carlo Pencil Beam Scanning model for proton TPS Quality Assurance using GATE/GEANT4", 50th International PTCOG meeting (Particle Therapy Co-Operative Group), Philadelphia, US, 2011 .  Téléchargement: Grevillot-ptcog2011-poster.pdf (2.33 Mo)
  9. [GUET-11b] P. Gueth, S. Camarasu-Pop, T. Glatard, L. Grevillot, and D. Sarrut, "PBS proton treatment plan simulation with the GATE-Lab", 50th International PTCOG meeting (Particle Therapy Co-Operative Group), Philadelphia, US, 2011 .
  10. [RIT-11b] S. Rit, R. Pinho, V. Delmon, M. Pech, G. Bouilhol, J. Schaerer, B. Navalpakkam, J. Vandemeulebroucke, P. Seroul, and D. Sarrut, "VV, a 4D slicer", Proceedings of the Fourth International Workshop on Pulmonary Image Analysis, Toronto, Canada, pp. 171–175, 09/2011 .
  11. [GREZ-10] L. Grèzes-Besset, J. Schaerer, P. Clarysse, and D. Sarrut, "Apparent motion clustering on Cone-Beam fluoroscopic images for thorax tracking", International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Amsterdam, The Netherlands, 06/2010.  Téléchargement: lgrezesb_paper.pdf (424.91 Ko)
  12. [VAND-10b] J. Vandemeulebroucke, O. Bernard, J. Kybic, P. Clarysse, and D. Sarrut, "Automatic motion mask extraction for deformable registration of the lungs", XVIth International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy, Amsterdam, 2010.  Téléchargement: vandemeulebroucke2010a.pdf (862.78 Ko)
  13. [VAND-10c] J. Vandemeulebroucke, S. Rit, J. Schaerer, and D. Sarrut, "Deformable image registration with automated motion-mask extraction", Medical Image Analysis for the Clinic: A Grand Challenge 2010 of the MICCAI Conference, Beijing, 2010 .
  14. [VAND-09b] J. Vandemeulebroucke, J. Kybic, P. Clarysse, and D. Sarrut, "Estimating breathing motion from cone-beam projections using a prior patient model", 10th Biennial ESTRO Meeting on Physics and Radiation Technology For Clinical Radiotherapy: Elsevier, pp. S185, 2009.
  15. [VAND-09] J. Vandemeulebroucke, J. Kybic, P. Clarysse, and D. Sarrut, "Respiratory motion estimation from cone-beam projections using a prior model", Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), London, UK, Springer, pp. 365-372, 2009 .
  16. [VAND-08] J. Vandemeulebroucke, P. Clarysse, J. Kybic, and D. Sarrut, "Estimating Respiratory Motion from Cone-Beam Projections", In Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention MICCAI'2008, The First International Workshop on Pulmonary Image Analysis, New York, sep, 2008 .
  17. [FRIS-08] T. Frisson, N. Zahra, L. Grevillot, L. Guigues, and D. Sarrut, "Extending GATE for dosimetry : radiotherapy and hadrontherapy applications.", Proceedings of IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference, Dresden, oct, 2008 .
  18. [SERO-08] P. Seroul, and D. Sarrut, "VV: a viewer for the evaluation of 4D image registration", In Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention MICCAI'2008, Workshop - Systems and Architectures for Computer Assisted Interventions, New York, sep, 2008 .
  19. [RIT-07b] S. Rit, C. Ginestet, and D. Sarrut, "Comparison of gated and dynamic cone-beam CT reconstruction methods", International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, jun, 2007 .
  20. [AYADI-07b] M. Ayadi, J. Vandemeulebroucke, S. Hlavacek, V. Boldea, C. Ginestet, and D. Sarrut, "Dosimetry on moving organs: static and dynamic dose distributions computed from 4DCT for lung cancer treatment", 9th Biennial ESTRO Meeting on Physics and Radiation Technology For Clinical Radiotherapy, pp. S77, 2007.
  21. [RIT-07c] S. Rit, D. Sarrut, and S. Miguet, "Gated cone-beam CT imaging of the thorax: a reconstruction study", SPIE Medical Imaging, San Diego, California, USA, feb, 2007.
  22. [ZAHR-07] N. Zahra, P. Lautesse, L. Guigues, T. Frisson, and D. Sarrut, "Geant4-based simulation of Carbon beam irradiation inside CT image : validation with radiochromic films", 11th HCBPM (Heavy Charged Particles in Biology & Medicine) IBIBAM (Ion Beams In Biology and Medicine), Heidelberg, sep, 2007 .
  23. [BOLD-07] V. Boldea, G. C. Sharp, S. B. Jiang, and D. Sarrut, "Lung motion modeling with deformable registration: non-linearity and hysteresis estimation and analysis", International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, jun, 2007 .
  24. [VAND-07] J. Vandemeulebroucke, D. Sarrut, and P. Clarysse, "Point-validated Pixel-based Breathing Thorax Model", International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, pp. 195-199, jun, 2007 .
  25. [BADE-07] J. N. Badel, D. Sarrut, and C. Ginestet, "Prediction of portal dose images with Monte Carlo simulation for dosimetric control in radiotherapy", International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, jun, 2007.
  26. [WU-07] Z. Wu, G. Sharp, E. Rietzel, V. Boldea, and D. Sarrut, "Validation of deformable registration of lung 4DCT with anatomical sub-region segmentations", International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, jun, 2007.
  27. [AYAD-06] M. Ayadi, D. Sarrut, and C. Ginestet, "Cumulating static dose distributions to simulate dynamic dose distributions: an experimental study", Med. Phys. 48th AAPM (American Association of Physicists in Medicine) Annual Meeting, vol. 33, no. 6, Orlando, FL, USA, pp. 2084, jun, 2006.
  28. [BOLD-06] V. Boldea, G. Sharp, S. Jiang, N. Choi, C. Ginestet, C. Carrie, and D. Sarrut, "Implementation and Evaluation of Automatic Contour Propagation in 4DCT of Lung", Med. Phys. 48th AAPM (American Association of Physicists in Medicine) Annual Meeting, vol. 33, no. 6, Orlando, FL, USA, pp. 2019-2020, jun, 2006.
  29. [DUFO-06] N. Dufour, L. Guigues, M. Boutemeur, and D. Sarrut, "Monte Carlo Simulation Platform for the External Techniques of Treatment of Cancer", 1st European Conf. on Molecular Imaging Technology (EUROMEDIM'06), Marseille, France, May, 2006.
  30. [BADE-06] J. N. Badel, C. Ginestet, N. Dufour, and D. Sarrut, "Monte Carlo simulations of the transit dose from amorphous silicon electronic portal images", The 9th International Workshop on Electronic Portal Imaging, Melbourne, Australia, 2006 .
  31. [GUIG-06b] L. Guigues, D. Sarrut, N. Dufour, M. C. Ricol, E. Testa, M. Boutemeur, N. Freud, and J. M. Létang, "ThIS : A Geant4-based Therapeutic Irradiation Simulator", 1st European Workshop on Monte Carlo Treatment Planning (MCTP), Gent, Belgium, Oct, 2006.
  32. [BOLD-05] V. Boldea, D. Sarrut, and C. Carrie, "Comparison of 3D Dense Deformable Registration Methods for Breath-hold Reproducibility Study in Radiotherapy", SPIE Medical Imaging: Visualization, Image-Guided Procedures, and Display, vol. 5747, pp. 222-230, 2005.
  33. [RIT-05] S. Rit, D. Sarrut, and C. Ginestet, "Respiratory signal extraction for 4D CT imaging of the thorax from cone-beam CT projections", Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), vol. 3749: Springer Verlag, Lecture Notes in Computer Science, pp. 556-63, 2005.
  34. [ATOU-04] H. Atoui, D. Sarrut, and S. Miguet, "Usefulness of image morphing techniques in cancer treatment by conformal radiotherapy", SPIE Medical Imaging: Visualization, Image-Guided Procedures, and Display, vol. 5367, pp. 332–340, 2004.
  35. [BOLD-03] V. Boldea, D. Sarrut, and S. Clippe, "Lung Deformation Estimation with Non-Rigid Registration for Radiotherapy Treatment", Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), vol. 2878: Springer Verlag, Lecture Notes in Computer Science, pp. 770-7, 2003.
  36. [SARR-01a] D. Sarrut, and S. Clippe, "Geometrical transformation approximation for 2D/3D intensity-based registration of portal images and CT scan", Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), vol. 2208, Utrecht (Netherlands), Springer Verlag, Lecture Notes in Computer Science, pp. 532–540, 2001.
Thesis
  1. [BOUI-13a] G. Bouilhol, "Incertitudes et mouvement dans le traitement des tumeurs pulmonaires : de la radiothérapie à l’hadronthérapie", INSA Lyon, vol. PhD, 2013.

    Dirk K.M. De Ruysscher, Professeur, UZ Leuven, rapporteur Dirk Verellen, Professeur, UZ Brussels, rapporteur Jacques Balosso, Professeur, CHU Grenoble Anne Laprie, Maître de conférence, ICR, Toulouse Joël Hérault, Physicien médical, CAL, Nice David Sarrut, Chargé de Recherche CNRS, directeur de thèse Myriam Ayadi-Zahra, Physicienne médicale, CLB, Lyon, co-encadrante

  2. [DELM-13a] V. Delmon, Recalage déformable de projections de scanner X à faisceau conique, , vol. PhD: INSA de Lyon, 2013 .

    Laurent Desbat, Professeur, Grenoble, Rapporteur

    Jan Kybic, Chargé de Recherche, CVUT, Prague, Rapporteur

    Oscar Acosta, Maitre de conférence, Rennes, Examinateur

    Grégoire Malandain, Directeur de Recherche, INRIA, Nice, Examinateur

    David Sarrut, Directeur de Recherche, CNRS, Lyon, Directeur de thèse

    Simon Rit, Chargé de Recherche, CNRS, Lyon, Co-directeur de thèse

    Loic Dibout, Ingénieur d’Application, Elekta SAS, Paris, Invité

  3. [GREZ-11] L. Grèzes-Besset, Détection et analyse du mouvement respiratoire à partir d’images fluoroscopiques en radiothérapie, , Lyon, INSA de Lyon, 2011 .

    Mme Jocelyne Troccaz Directeur de Recherche CNRS Rapporteur M. Jean-Yves Boire Professeur des Universités Rapporteur Mme Catherine Mennessier Enseignant Chercheur Examinatrice M. Albert Lisbona Physicien Médical Examinateur M. Patrick Clarysse Directeur de Recherche CNRS Directeur de thèse M. David Sarrut Chargé de Recherche CNRS Co-Directeur de thèse M. Loïc Dibout Ingénieur d’Application Elekta SAS Invité

  4. [VIDAL-11] M. Vidal, Evolution des modèles de calcul de dose pour la planification de traitement en Protonthérapie, : INSA de Lyon, 2011 .

    Jean-Louis HABRAND PU-PH, Centre François Baclesse, Caen Président du jury Joël HERAULT Physicien médical, Centre Antoine Lacassagne, Nice Rapporteur Dimitris VISVIKIS Directeur de Recherche INSERM, LaTIM, Brest Rapporteur Denis DAUVERGNE Directeur de Recherche CNRS, IPNL, Lyon Examinateur David SARRUT Chargé de Recherche, CNRS Creatis, Lyon Directeur de thèse Pascal FRANCOIS Physicien médical, Institut Curie, Paris Co-directeur de thèse Ludovic DE MARZI Physicien médical, Institut Curie - CPO, Orsay Encadrant Régis FERRAND Chef de projet, Institut Curie - CPO, Orsay Invité Jean-Christophe DIAZ Ingénieur Projet, DOSIsoft, Cachan Invité

  5. [GREV-PHD-11] L. Grevillot, Monte Carlo simulation of active scanning proton therapy system with Gate/Geant4: Towards a better patient dose quality assurance, , vol. phd, Lyon, INSA de Lyon, 2011 .

    Pr. Frank Verhaegen Professor, MAASTRO, Maastricht (Nl) Rapporteur Dr. Harald Paganetti Associate Professor, MGH, Boston (US) Rapporteur Dr. Irène Buvat Directeur de Recherche, CNRS, Paris (Fr) Examinateur Dr. Katia Parodi Associate Professor, HIT, Heidelberg (De) Examinateur Pr. Jacques Balosso Professeur, ETOILE, Lyon (Fr) Examinateur Dr. David Sarrut Chargé de Recherche, CNRS, Lyon (Fr) Directeur de thèse Dr. Nicolas Freud Maître de Conférence, INSA, Lyon (Fr) Co-Directeur de thèse Dr. Damien Bertrand Physicien, IBA, Louvain-la-Neuve (Be) Co-Encadrant

  6. [VAND-10] J. Vandemeulebroucke, Lung Motion Modelling and Estimation for Image Guided Radiation Therapy, : INSA de Lyon, 2010 .

    David Hawkes Professeur, UCL, Londres Rapporteur Dirk Vandermeulen Professeur, KUL, Louvain Rapporteur Grégoire Malandain Directeur de Recherche, INRIA Examinateur Denis Friboulet Professeur, INSA, Lyon Examinateur Jan Kybic Chargé de Recherche, CVUT, Prague Co-directeur de thèse David Sarrut Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse Patrick Clarysse Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse

  7. [ZAHR-10a] N. Zahra, Mesure de dose en thérapie par ions carbone : mise en place d'un dispositif expérimental et simulations Monte­-Carlo, : Université Claude Bernard Lyon 1, 2010 .

    Philippe Lautesse Maitre de conferences des universites (MCU) David Sarrut Charge de recherche CNRS (CR) Joel Herault Physicien medical, Centre A. Lacassagne Nice Rapporteur Daniel Sillou Directeur de recherche, LAPP Annecy Rapporteur Jean-Louis Habrand Professeur, Institut Curie Paris Examinateur Jean Colin Professeur, LPC Caen Examinateur Bernard Ille Directeur de recherche, IPNL Lyon Examinateur

  8. [BADE-09a] J. N. Badel, Contrôle dosimétrique des traitements de radiothérapie par simulation Monte Carlo de l’image de dose portale transmise, : INSA de Lyon, 2009 .

    Mme. Ginette Marinello Rapporteur (Physicienne Médicale, HDR) M. Gérard Montarou Rapporteur (Directeur de Recherche, CNRS) M. Jacques Balosso Examinateur (Professeur d’Université) M. Pascal Francois Examinateur (Physicien Médical, HDR) Mme. Isabelle Magnin Directeur de thèse (Directeur de Recherche, INSERM) M. David Sarrut Co-Directeur de thèse (Chargé de Recherche, CNRS)

  9. [AYAD-07] M. Ayadi, Dosimétrie dynamique (4D) pour le traitement du cancer du poumon, : Université Claude Bernard Lyon 1, 2007 .

    Directeur de thèse : Pr. Madjid Boutemeur M. Jean-Claude Rosenwald, Rapporteur M. Philippe Giraud, Rapporteur M. Jean-François Germond, Examinateur M. Bernard Ille, Examinateur M. Albert Lisbona, Examinateur Mme Chantal Ginestet, Co-directrice de thèse M. David Sarrut, Co-directeur de thèse

  10. [RIT-07a] S. Rit, Prise en compte du mouvement respiratoire pour la reconstruction d'images tomodensitométriques, : Université Lumière Lyon 2, 2007 .

    Pr. Bloch Isabelle, ENST, Paris Rapporteur DR Grangeat Pierre, CEA, Grenoble Rapporteur DR Magnin Isabelle, CNRS, Lyon Examinateur DR Malandin Grégoire, INRIA, Sophia Antipolis Examinateur Pr. Miguet Serge, LIRIS, Lyon Directeur Cr. Van Herk Marcel, Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Pays-Bas Examinateur Do. Sarrut David, Université Lumière Lyon 2, détaché au CLB, Lyon Co-directeur

  11. [BOLD-06a] V. Boldea, Intégration de la respiration en radiothérapie : apport du recalage déformable d'images, : Université Lumière Lyon 2, 2006 .

    Grégoire Malandain, DR INRIA, rapporteur Philippe Cinquin, Professeur, Grenoble, rapporteur Jean Rousseau, Professeur, examinateur Greg Sharp, Assistant Research Physicist, MGH (Boston), examinateur, David Sarrut, chercheur au CLB, co-directeur de thèse, Serge Miguet, Professeur, directeur de thèse

  12. [SARR-00] D. Sarrut, Recalage multimodal et plate-forme d'imagerie médicale à accès distant, : Université Lumière Lyon 2, 2000 .

    Mme. Jocelyne Troccaz, Rapporteur, Directeur de Recherche CNRS M. Christian Roux, Rapporteur, Professeur Mme. Isabelle Magnin, Examinateur, Directeur de Recherche INSERM M. Ehoud Ahronovitz, Examinateur, Maitre de conférences M. Bernard Tourancheau, Examinateur, Professeur M. Serge Miguet, Professeur, Directeur de thèse, Professeur

Miscellaneous
HDR
  1. [SARR-08b] D. Sarrut, Imagerie dynamique et simulations Monte-Carlo pour la radiothérapie guidée par l'image, : Université Claude-Bernard Lyon I, 2008.

    Barillot C. (rap.), Malandain G. (rap.), Verellen D. (rap.), Buvat I., Deneve W., Peroche B. et Clarysse P.

Invited Conference
  1. [SARR-14] D. Sarrut, J. Vandemeulebroucke, G. Bouilhol, R. Pinho, V. Delmon, and S. Rit, "Open source tools for validation of deformable registration", ESTRO 33 (European SocieTy for Radiotherapy & Oncology) , Vienna, Austria, 2014.
  2. [SARR-10] D. Sarrut, J. Vandemeulebroucke, and S. Rit, "Advances in deformable image registration of thoracic 4D CT", ESTRO 29 (European SocieTy for Radiotherapy & Oncology) , Barcelona, Spain, 2010.