Sujet de stage Master - Equipe IRM de l’ischemie cérébrale et MEDICAD Creatis-LRMN UMR CNRS 5220 U630 Inserm - Lyon
Sujet : Validation expérimentale des différentes méthodes de quantification de la perfusion cérébrale en IRM
Contexte : L’étude du débit sanguin cérébral (ou perfusion) suite à un accident vasculaire repose sur le suivi IRM du premier passage dans le cerveau d’un produit de contraste injecté par voie intraveineuse. L’analyse quantitative de ces images fait appel à un modèle physiologique et/ou mathématique de la perfusion ainsi que la détermination d’une fonction d’entrée artérielle mesurée dans un ou plusieurs des vaisseaux sanguins présents dans les images. Divers modèles sont utilisés dans la littérature et certains déjà implémentés au laboratoire. Le choix et les conditions d’utilisation de ces différents modèles n’a pour l’instant pas été étudiés de manière systématique.
Objectifs : L’objectif du stage est
• d’une part d’implanter une méthode de calcul des paramètres de perfusion par un modèle utilisant des B-spline
• de comparer en simulation les conditions d’utilisation des différentes méthodes suivant le niveau de bruit, la fréquence d’acquisition des images, la durée de l’acquisition, …
• de valider sur des données cliniques de perfusion cérébrale les résultats obtenues en simulation
Méthodologie : Après avoir pris en main les outils informatiques (Matlab), les données et les bases de l’imagerie IRM, il s’agira de développer des méthodes de calcul d’analyse numérique et de réaliser un logiciel de comparaison des méthodes de calcul des paramètres de perfusion.
Compétences requises : Bases de programmation Matlab, du traitement du signal et de l’algorithmie, Un intérêt pour l’imagerie expérimentale et une bonne maîtrise de l’anglais scientifique.