Objectif
Le but de ce stage de " master 2 " est de développer et d’évaluer un algorithme de tracking d'images pelviennes ultrasonores 3D+T (T = temps) par approche géométrique (SIFT, etc.). Les données sont recueillies sur des patients atteints d’un cancer de la prostate et traités par radiothérapie. Le stage sera effectué au laboratoire CREATIS sur le site du Centre de lutte contre le cancer Léon Bérard (CLB) à Lyon.
Contexte
Au cours d'une séance de radiothérapie, la qualité du traitement peut être affectée par les mouvements internes des organes. Avec l'émergence de protocoles de traitements hypofractionnés (dose > 2 Gy/fraction) et de protocoles d'escalade de dose, la précision dans la délivrance du traitement est essentielle. C'est pour cette raison que de plus en plus de techniques (imagerie 2D par rayons X, transducteurs, ultrasons, etc.) permettent de suivre ces mouvements. Le CLB a récemment fait l'acquisition d'une sonde ultrasonore transpérinéale (sonde TP) spécialement adaptée pour suivre les mouvements des organes pelviens au cours d’une séance de traitement. Un protocole d'étude vient de débuter avec inclusion de patients atteints d’un cancer de la prostate et traités par radiothérapie avec prostate en place ou après prostatectomie.
Méthode
L'étudiant devra, sur les données acquises au CLB grâce à la sonde TP, développer, implémenter et évaluer un algorithme de tracking par approche géométrique (SIFT, etc.) pour pouvoir suivre les mouvements et/ou déformations du volume cible et des organes à risques environnants. L'objectif à plus long terme étant d'asservir l'irradiation au mouvement interne des organes.
Profil
Compétences : traitement d'images, programmation, C++, ITK, MATLAB.
Période : 6 mois en 2014 selon le master.
Salaire : 436 euros net / mois.
Lieu : Centre Léon Bérard, Lyon, France.
Encadrants
Benoît Presles, post-doctorant, benoit.presles@creatis.insa-lyon.fr
David Sarrut, directeur de recherche CNRS, david.sarrut@creatis.insa-lyon.fr
Bibliographie
1. LU, Xuesong, ZHANG, Su, YANG, Wei, et al. SIFT and shape information incorporated into fluid model
for non-rigid registration of ultrasound images. Computer methods and programs in biomedicine, 2010, vol.
100, no 2, p. 123-131.
2. MIKOLAJCZYK, Krystian et SCHMID, Cordelia. A performance evaluation of local descriptors. Pattern
Analysis and Machine Intelligence, IEEE Transactions on, 2005, vol. 27, no 10, p. 1615-1630.
3. LEUNG, Corina, HASHTRUDI-ZAAD, Keyvan, FOROUGHI, Pezhman, et al. Experimental validation
of a 4D elastic registration algorithm. In : Engineering in Medicine and Biology Society, 2008. EMBS 2008.
30th Annual International Conference of the IEEE. IEEE, 2008. p. 3961-3966.