Séminaires passés et présentations à CREATIS

Date Titre Lieu / Résumé
06/04/2018 - 12:12 CLUB des Développeurs

12h12-13h13

GitLab/GitHub : Etat de l'art des forges logicielles par Claire Mouton (Ingénieur de Recherche à CREATIS). Panorama et description des usages collaboratifs et des solutions d'hébergement

Utilisation des conteneurs dans la recherche : de Docker à Singularity par Sorina Pop (Ingénieur de Recherche à CREATIS).
 
09/03/2018 - 12:12 CLUB des Développeurs
12h12-13h13
 
Outils pour le développement et l'utilisation de codes de calcul scientifique par Anne Cadiou (Ingénieur de Recherche au LMFA – Ecole Centrale Lyon). 
Les GPUs à l'épreuve de la métrologie par Emmanuel Quemener (Ingénieur de Recherche au Centre Blaise Pascal – ENS Lyon).
 
21/03/2018 - 14:00 Environmental Multiway data mining

Although array factorization methods have been vastly investigated as a source separation tool in disparate areas like chemometrics or remote sensing, studying multiple data set simultaneously, factorizing very large data set and identifying the extracted components solely from their spectra remain challenging tasks.

23/10/2017 - 10:30 Recalage de groupes d’images médicales 3D par extraction de points d’intérêt

Composition du Jury :

M. Adrien BARTOLI Professeur des Universités Rapporteur

M. Fabrice HEITZ Professeur des Universités Examinateur

M. Xavier PENNEC Directeur de Recherche Rapporteur

MME Jocelyne TROCCAZ Directeur de Recherche Examinateur

M. Sébastien VALETTE Chargé de Recherche Examinateur

09/02/2018 - 12:12 CLUB des Développeurs
12h12-13h13
 
Fitting curves using Excel par Maciej Orkisz.
 
Disruptif or not disruptif, the GPU ? par Emmanuel Quemener (Centre Blaise Pascal – ENS Lyon).
 
08/02/2018 - 16:38 Assemblée Générale du Laboratoire

Programme :

8h30-9h00 : Informations unités- Informations générales (O. BEUF) (10’+5’)- Présentation du budget exécuté 2017 et prévisionnel 2018 (S. VIGNON) (10’+5’)

9h00-9h30 : Profils et projets de recherche des chercheurs ou enseignants chercheurs recrutés en 2017- Damien GARCIA : Évaluation de la fonction diastolique par caractérisation 3-D de l’écoulement intracardiaque (20’+10’)

02/02/2018 - 14:30 Towards model-assisted clinical decision making in cardiac disease

Diagnosis of cardiac disease in the clinic remains difficult due to limited possibilities to extract data from a patient and problems in translating clinical data into the underlying pathological tissue properties. Consequently, diagnosis is based on combining limited patient information with general knowledge on pathophysiology, past experience with similar patients, and clinical guidelines.

01/12/2017 - 12:12 CLUB des Développeurs

12h12-13h13

Reprise du CLUB des Développeurs. Venez exprimer vos attentes et vos propositions de contenu pour l'année à venir!

Retour d'expérience par Bertrand David (ingénieur au Laboratoire des Matériaux Avancés) :

Etat de l'art des forges logicielles par Claire Mouton (ingénieur à CREATIS) : Panorama et description des usages collaboratifs et des solutions d'hébergement

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12/01/2018 - 12:12 CLUB des Développeurs

12h12-13h13

Démonstration et session pratique : Générateur, promesse et calcul asynchrone en javascript par Pierre Gueth.

Parallel image reconstruction for ultrasound echography, in the: MATLAB, UNIX shell, pbs job scheduler and CREATIS cluster environments par Denis Bujoreanu

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16/11/2017 - 12:00 Évaluation de l'intégrité du muscle strié squelettique par imagerie et spectroscopie de résonance magnétique

Cette présentation exposera les résultats d’une étude évaluant l’impact de dommages musculaires induits par électrostimulation neuromusculaire sur la structure et le métabolisme énergétique du muscle strié squelettique au regard des capacités de production de force. Les perspectives d’une évaluation de l’intégrité des tissus seront illustrées par de récentes acquisitions multimodales sur un imageur clinique à 7T.

 

30/11/2017 - 11:00 Recent advances at the VITALab : solving video analytic and medical imaging problems trough deep learning methods

This presentation summarizes the latest scientific advances that occurred at the VITALab (Sherbrooke, Canada) and underline unsolved questions that we ought to work on in the upcoming years.  In the last two years, the VITALab (like a large proportion of the digital imaging community) has been carried by the deep learning wave.  Work has been done in various areas of video analytics as well as medical imaging.  This includes traffic analytics, motion detection, background estimation, brain tumor segmentation, and MRI cardiac analysis.

30/11/2017 - 11:00 Recent advances at the VITALab : solving video analytic and medical imaging problems trough deep learning methods

This presentation summarizes the latest scientific advances that occurred at the VITALab (Sherbrooke, Canada) and underline unsolved questions that we ought to work on in the upcoming years.  In the last two years, the VITALab (like a large proportion of the digital imaging community) has been carried by the deep learning wave.  Work has been done in various areas of video analytics as well as medical imaging.  This includes traffic analytics, motion detection, background estimation, brain tumor segmentation, and MRI cardiac analysis.

15/11/2017 - 14:00 Machine learning from heterogeneous descriptors of cardiac function for the characterization of heart failure patients
13/11/2017 - 09:00 Journée des Doctorants de Troisième annéee

Programme de la journée

09:00 - 09:25 RUMINDO Gerardo Kenny Cardiac modeling for the study and following of reversible/irreversible myocardial injuries (CLARYSSE Patrick, OHAYON Jacques, CROISILLE Pierre )

09:25-09:50 GERBAYAntoine Approche multiparametrique de la viabilité myocardique en IRM: nouveaux bio-marqueurs  (CROISILLE Pierre )

09:50-10:15 BADESCU Emilia Ultrafast strategies for cardiac motion estimation (LIEBGOTT Hervé, FRIBOULET Denis )

19/09/2017 - 10:00 Where computational techniques meet clinical practice: understanding the working of the heart in health and disease

Contemporary research in cardiovascular medicine is aimed at both the understanding of the fundamental properties of the cardiovascular system and its changes with disease, as well as providing evidence-based guidelines towards best clinical practice. Linking basic understanding with clinical practice is the objective of translational biomedicine, in which "reality-driven" research is key, underlining the concept that direct human observations are essential for the study of hypotheses relevant to human reality [Mankoff S, Journal of Translational Medicine 2004].

02/06/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

12h-13h

Développement ultra rapide d'une interface Matlab pour tester les paramètres numériques d'une fonction par Clément Daviller (développeur dans l'industrie puis doctorant à CREATIS).

Session interactive : lambda-calcul ou comment compiler des programmes avec du papier et votre crayon (à amener!) par Pierre Gueth.

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19/05/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

12h-13h

GitHub et l'intégration continue (Travis/Appveyor) par Eric Boix (ingénieur de recherche au LIRIS).

AddressSanitizer & ThreadSanitizer, des alternatives rapides à valgrind par Fabrice Bellet (ingénieur de recherche à CREATIS).

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05/05/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

12h-13h

Retour sur les "bonnes" pratiques de partage de code dans l'équipe 3 par François Varray et Hervé Liebgott.

De l'intérêt du développement en Open Source, l'exemple de GDCM par Jean-Pierre Roux.

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18/04/2017 - 14:00 Simulation numérique de la propagation des ondes dans les tissus mous - Application à l’élastographie transitoire par US
10/04/2017 - 09:00 Journée des Doctorants de Première Année

09h00-09h20 PERROT Vincent : Imagerie ultrasonore rapide et modélisation du mouvement vectoriel de la paroi des vaisseaux et du flux (H.Liebgott, D. Vray) Équipe 3

09h20-09h40 POLICHETTI Maxime : Suivi spatio-temporel 3D de la cavitation par imagerie ultrasonore: application au guidage et contrôle de gestes de thérapie (C.Cachard) Équipe 3

07/04/2017 - 11:00 Clinical quantitative susceptibility mapping (QSM): Biometal imaging and its emerging roles in patient care

Les travaux de recherche du Dr Wang sont centrés sur l'application de la mathématique, de la physique, de l’ingénierie électronique et de l'informatique dans le développement d'outils visant à améliorer le diagnostique clinique.

 http://vivo.med.cornell.edu/display/cwid-yiwang 

07/04/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Recalage de corps entiers (une centaine de CT-scan 3D) par extraction de points d'intérêt via des optimisations CPU en C/C++ (OpenMP, instructions SIMD, ...) par Rémi Agier.

Comment la documentation peut ressusciter votre code (Elavisu) par Eduardo Davila.

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23/03/2017 - 14:00 Séminaire : Estimation du risque de fracture dans le cas d'un os métastasé
24/03/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Illustration de la Programmation Orientée Objet (POO) en Matlab au travers d'un gestionnaire de figures : création d'un singleton, initialisation des figures, création d’événements communs par Clément Daviller.

Liberté, légalité, efficacité : de Matlab à (num)Python, retour d'expérience par Fabien Millioz.

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10/03/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Quelques exemples de post-traitement de maillages cardiaques avec VTK par Nicolas Duchateau.

Intégration continue : retour d'expérience suite à la mise en place d'un dashboard CDash s'assurant de la compilation multiplateforme et du passage d'une batterie de tests par Claire Mouto

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14/02/2017 - 08:45 Assemblée Générale du Laboratoire CREATIS

8h45 : Accueil

9h15-10h15 : Informations unités

-Informations générales (O. BEUF) (15’+15’)

-Présentation du budget exécuté 2016 et prévisionnel 2017 (S. VIGNON) (10’+5’)

- Règles et procédures (S. VIGNON) (10’+5’)

10h15-11h15 : Profils et projets de recherche des chercheurs et enseignants chercheurs recrutés en 2016

- Nicolas DUCHATEAU : Traitement d’images multi-modalités/dimensionnelles et modélisation (15’+5’)

10/02/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Une introduction à Docker par Sorina Pop.

Cas d'utilisation de Docker par Geoffroy Berret.

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27/01/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Tester la compilation de vos logiciels facilement avec Travis : l'exemple de vv par Thomas Baudier.

Système de Trig respiratoire sur une base Arduino : le temps réel à la rescousse de vos manips par Denis Grenier.

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13/01/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Using Python from Matlab par Simon Rit.

Finite-element modelling of the left ventricle using Abaqus and object-oriented programming in Matlab par Kenny Rumindo.

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09/12/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Modern C++, including news from C++14 ("auto" keyword, range based loop, etc.) par David Sarrut.

C++ HTML5 - le meilleur des deux mondes… / C++ HTML5 - the best of both worlds… par Bertrand David.

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