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Conference Paper

  1. [VAND-08]J. Vandemeulebroucke, Clarysse, P., Kybic, J., and Sarrut, D., “Estimating Respiratory Motion from Cone-Beam Projections”, in In Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention MICCAI'2008, The First International Workshop on Pulmonary Image Analysis, New York, 2008.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/Publications?action=AttachFile&do=view&target=miccai-jef2008.pdf
  2. [RIT-07c]S. Rit, Sarrut, D., and Miguet, S., “Gated cone-beam CT imaging of the thorax: a reconstruction study”, in SPIE Medical Imaging, San Diego, California, USA, 2007.
  3. [AYADI-07b]M. Ayadi, Vandemeulebroucke, J., Hlavacek, S., Boldea, V., Ginestet, C., and Sarrut, D., “Dosimetry on moving organs: static and dynamic dose distributions computed from 4DCT for lung cancer treatment”, in 9th Biennial ESTRO Meeting on Physics and Radiation Technology For Clinical Radiotherapy, 2007, p. S77.
  4. [VAND-07]J. Vandemeulebroucke, Sarrut, D., and Clarysse, P., “Point-validated Pixel-based Breathing Thorax Model”, in International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, 2007, pp. 195-199.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/popi-model
  5. [BADE-07]J. N. Badel, Sarrut, D., and Ginestet, C., “Prediction of portal dose images with Monte Carlo simulation for dosimetric control in radiotherapy”, in International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, 2007.
  6. [ZAHR-07]N. Zahra, Lautesse, P., Guigues, L., Frisson, T., and Sarrut, D., “Geant4-based simulation of Carbon beam irradiation inside CT image : validation with radiochromic films”, in 11th HCBPM (Heavy Charged Particles in Biology & Medicine) IBIBAM (Ion Beams In Biology and Medicine), Heidelberg, 2007.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/Publications
  7. [BOLD-07]V. Boldea, Sharp, G. C., Jiang, S. B., and Sarrut, D., “Lung motion modeling with deformable registration: non-linearity and hysteresis estimation and analysis”, in International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, 2007.
    http://liris.cnrs.fr/publis/?id=2748
  8. [RIT-07b]S. Rit, Ginestet, C., and Sarrut, D., “Comparison of gated and dynamic cone-beam CT reconstruction methods”, in International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, 2007.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~srit/biblio/rit2007.pdf
  9. [WU-07]Z. Wu, Sharp, G., Rietzel, E., Boldea, V., and Sarrut, D., “Validation of deformable registration of lung 4DCT with anatomical sub-region segmentations”, in International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, 2007.
  10. [RIT-07]S. Rit and Sarrut, D., “Cone-beam projection of a deformable volume for motion compensated algebraic reconstruction”, in Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, Lyon, France, 2007.
    https://www.creatis.insa-lyon.fr/~srit/biblio/rit2007c.pdf
  11. [AYAD-06]M. Ayadi, Sarrut, D., and Ginestet, C., “Cumulating static dose distributions to simulate dynamic dose distributions: an experimental study”, in Med. Phys. 48th AAPM (American Association of Physicists in Medicine) Annual Meeting, Orlando, FL, USA, 2006, vol. 33, p. 2084.
  12. [DUFO-06]N. Dufour, Guigues, L., Boutemeur, M., and Sarrut, D., “Monte Carlo Simulation Platform for the External Techniques of Treatment of Cancer”, in 1st European Conf. on Molecular Imaging Technology (EUROMEDIM'06), Marseille, France, 2006.
  13. [BOLD-06]V. Boldea, Sharp, G., Jiang, S., Choi, N., Ginestet, C., Carrie, C., and Sarrut, D., “Implementation and Evaluation of Automatic Contour Propagation in 4DCT of Lung”, in Med. Phys. 48th AAPM (American Association of Physicists in Medicine) Annual Meeting, Orlando, FL, USA, 2006, vol. 33, pp. 2019-2020.
  14. [GUIG-06b]L. Guigues, Sarrut, D., Dufour, N., Ricol, M. C., Testa, E., Boutemeur, M., Freud, N., and Létang, J. M., “ThIS : A Geant4-based Therapeutic Irradiation Simulator”, in 1st European Workshop on Monte Carlo Treatment Planning (MCTP), Gent, Belgium, 2006.
  15. [GUIG-06a]L. Guigues, Sarrut, D., Dufour, N., Ricol, M. C., Testa, E., Boutemeur, M., Freud, N., and Létang, J. M., “A Platform for Monte Carlo Simulation of Cancer Therapy with Photon and Light Ions Beams based on the Geant 4 Toolkit”, in IEEE Nuclear Sciences Symposium, San Diego, USA, 2006.
  16. [BADE-06]J. N. Badel, Ginestet, C., Dufour, N., and Sarrut, D., “Monte Carlo simulations of the transit dose from amorphous silicon electronic portal images”, in The 9th International Workshop on Electronic Portal Imaging, Melbourne, Australia, 2006.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/ dsarrut/mybib/2006/badel-iwepid2006.pdf
  17. [RIT-05]S. Rit, Sarrut, D., and Ginestet, C., “Respiratory signal extraction for 4D CT imaging of the thorax from cone-beam CT projections”, in Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), 2005, vol. 3749, pp. 556-63.
  18. [BOLD-05]V. Boldea, Sarrut, D., and Carrie, C., “Comparison of 3D Dense Deformable Registration Methods for Breath-hold Reproducibility Study in Radiotherapy”, in SPIE Medical Imaging: Visualization, Image-Guided Procedures, and Display, 2005, vol. 5747, pp. 222-230.
  19. [ATOU-04]H. Atoui, Sarrut, D., and Miguet, S., “Usefulness of image morphing techniques in cancer treatment by conformal radiotherapy”, in SPIE Medical Imaging: Visualization, Image-Guided Procedures, and Display, 2004, vol. 5367, pp. 332–340.
  20. [BOLD-03]V. Boldea, Sarrut, D., and Clippe, S., “Lung Deformation Estimation with Non-Rigid Registration for Radiotherapy Treatment”, in Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), 2003, vol. 2878, pp. 770-7.
  21. [SARR-01b]D. Sarrut, Miguet, S., Vincent, F., Clarysse, P., Exbrayat, M., Brunie, L., Fleute, M., Desbat, L., and Magnin, I. E., “Requêtes complexes et hybrides dans des bases d'images médicales distantes. Une illustration en imagerie cardiaque”, in ASTI'2001, Paris, France, 2001.
  22. [SARR-01a]D. Sarrut and Clippe, S., “Geometrical transformation approximation for 2D/3D intensity-based registration of portal images and CT scan”, in Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), Utrecht (Netherlands), 2001, vol. 2208, pp. 532–540.

Book Chapter

  1. [SARR-13]D. Sarrut, Vandemeulebroucke, J., and Rit, S., “4D Modeling and Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy”, J. Ehrhardt and Lorenz, C. Springer, 2013, pp. 103–124.
  2. [RIT-13b]S. Rit, Sarrut, D., and Sonke, J. - J., “4D Modeling and Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy”, J. Ehrhardt and Lorenz, C. Springer, 2013, pp. 319–334.
  3. [SARR-13b]D. Sarrut and Vandemeulebroucke, J., “Nonparametric: Demons, Diffusion, and Viscous-Fluid Approaches”, in Image Processing in Radiation Therapy, K. K. Brock CRC Press, 2013.PDF icon K11476_C007.pdf (3.29 MB)
    http://www.crcpress.com/product/isbn/9781439830178
  4. [CAMA-11]S. Camarasu-Pop, Glatard, T., Benoit-Cattin, H., and Sarrut, D., “Enabling Grids for GATE Monte-Carlo Radiation Therapy Simulations with the GATE-Lab”, in Applications of Monte Carlo Method in Science and Engineering, InTech 2011.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/articles/Camarasu-Pop2011.pdf

Invited Conference

  1. [SARR-14]D. Sarrut, Vandemeulebroucke, J., Bouilhol, G., Pinho, R., Delmon, V., and Rit, S., “Open source tools for validation of deformable registration”, ESTRO 33 (European SocieTy for Radiotherapy & Oncology) . Vienna, Austria, 2014.
  2. [SARR-10]D. Sarrut, Vandemeulebroucke, J., and Rit, S., “Advances in deformable image registration of thoracic 4D CT”, ESTRO 29 (European SocieTy for Radiotherapy & Oncology) . Barcelona, Spain, 2010.

HDR

  1. [SARR-08b]D. Sarrut, “Imagerie dynamique et simulations Monte-Carlo pour la radiothérapie guidée par l'image”. Université Claude-Bernard Lyon I, 2008.
    Barillot C. (rap.), Malandain G. (rap.), Verellen D. (rap.), Buvat I., Deneve W., Peroche B. et Clarysse P.

Thesis

  1. [DELM-13a]V. Delmon, “Recalage déformable de projections de scanner X à faisceau conique”, INSA de Lyon, 2013.
    Laurent Desbat, Professeur, Grenoble, Rapporteur Jan Kybic, Chargé de Recherche, CVUT, Prague, Rapporteur Oscar Acosta, Maitre de conférence, Rennes, Examinateur Grégoire Malandain, Directeur de Recherche, INRIA, Nice, Examinateur David Sarrut, Directeur de Recherche, CNRS, Lyon, Directeur de thèse Simon Rit, Chargé de Recherche, CNRS, Lyon, Co-directeur de thèse Loic Dibout, Ingénieur d’Application, Elekta SAS, Paris, Invité
    www.creatis.insa-lyon.fr/~srit/biblio/delmon2013a.pdf
  2. [BOUI-13a]G. Bouilhol, “Incertitudes et mouvement dans le traitement des tumeurs pulmonaires : de la radiothérapie à l’hadronthérapie”, 2013.
    Dirk K.M. De Ruysscher, Professeur, UZ Leuven, rapporteur Dirk Verellen, Professeur, UZ Brussels, rapporteur Jacques Balosso, Professeur, CHU Grenoble Anne Laprie, Maître de conférence, ICR, Toulouse Joël Hérault, Physicien médical, CAL, Nice David Sarrut, Chargé de Recherche CNRS, directeur de thèse Myriam Ayadi-Zahra, Physicienne médicale, CLB, Lyon, co-encadrante
  3. [GREV-PHD-11]L. Grevillot, “Monte Carlo simulation of active scanning proton therapy system with Gate/Geant4: Towards a better patient dose quality assurance”, INSA de Lyon, Lyon, 2011.
    Pr. Frank Verhaegen Professor, MAASTRO, Maastricht (Nl) Rapporteur Dr. Harald Paganetti Associate Professor, MGH, Boston (US) Rapporteur Dr. Irène Buvat Directeur de Recherche, CNRS, Paris (Fr) Examinateur Dr. Katia Parodi Associate Professor, HIT, Heidelberg (De) Examinateur Pr. Jacques Balosso Professeur, ETOILE, Lyon (Fr) Examinateur Dr. David Sarrut Chargé de Recherche, CNRS, Lyon (Fr) Directeur de thèse Dr. Nicolas Freud Maître de Conférence, INSA, Lyon (Fr) Co-Directeur de thèse Dr. Damien Bertrand Physicien, IBA, Louvain-la-Neuve (Be) Co-Encadrant
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/LoicGrevillot_PhD_2011.pdf
  4. [GREZ-11]L. Grèzes-Besset, “Détection et analyse du mouvement respiratoire à partir d’images fluoroscopiques en radiothérapie”, INSA de Lyon, Lyon, 2011.
    Mme Jocelyne Troccaz Directeur de Recherche CNRS Rapporteur M. Jean-Yves Boire Professeur des Universités Rapporteur Mme Catherine Mennessier Enseignant Chercheur Examinatrice M. Albert Lisbona Physicien Médical Examinateur M. Patrick Clarysse Directeur de Recherche CNRS Directeur de thèse M. David Sarrut Chargé de Recherche CNRS Co-Directeur de thèse M. Loïc Dibout Ingénieur d’Application Elekta SAS Invité
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/LouiseGrezesBesset_PHD_2011.pdf
  5. [VIDAL-11]M. Vidal, “Evolution des modèles de calcul de dose pour la planification de traitement en Protonthérapie”, INSA de Lyon, 2011.
    Jean-Louis HABRAND PU-PH, Centre François Baclesse, Caen Président du jury Joël HERAULT Physicien médical, Centre Antoine Lacassagne, Nice Rapporteur Dimitris VISVIKIS Directeur de Recherche INSERM, LaTIM, Brest Rapporteur Denis DAUVERGNE Directeur de Recherche CNRS, IPNL, Lyon Examinateur David SARRUT Chargé de Recherche, CNRS Creatis, Lyon Directeur de thèse Pascal FRANCOIS Physicien médical, Institut Curie, Paris Co-directeur de thèse Ludovic DE MARZI Physicien médical, Institut Curie - CPO, Orsay Encadrant Régis FERRAND Chef de projet, Institut Curie - CPO, Orsay Invité Jean-Christophe DIAZ Ingénieur Projet, DOSIsoft, Cachan Invité
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/MarieVidal_PhD_2011.pdf
  6. [VAND-10]J. Vandemeulebroucke, “Lung Motion Modelling and Estimation for Image Guided Radiation Therapy”, INSA de Lyon, 2010.
    David Hawkes Professeur, UCL, Londres Rapporteur Dirk Vandermeulen Professeur, KUL, Louvain Rapporteur Grégoire Malandain Directeur de Recherche, INRIA Examinateur Denis Friboulet Professeur, INSA, Lyon Examinateur Jan Kybic Chargé de Recherche, CVUT, Prague Co-directeur de thèse David Sarrut Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse Patrick Clarysse Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/JefVandemeulebroucke_PHD_2010.pdf
  7. [ZAHR-10a]N. Zahra, “Mesure de dose en thérapie par ions carbone : mise en place d'un dispositif expérimental et simulations Monte­-Carlo”, Université Claude Bernard Lyon 1, 2010.
    Philippe Lautesse Maitre de conferences des universites (MCU) David Sarrut Charge de recherche CNRS (CR) Joel Herault Physicien medical, Centre A. Lacassagne Nice Rapporteur Daniel Sillou Directeur de recherche, LAPP Annecy Rapporteur Jean-Louis Habrand Professeur, Institut Curie Paris Examinateur Jean Colin Professeur, LPC Caen Examinateur Bernard Ille Directeur de recherche, IPNL Lyon Examinateur
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/NabilZahra_PHD_2010.pdf
  8. [BADE-09a]J. N. Badel, “Contrôle dosimétrique des traitements de radiothérapie par simulation Monte Carlo de l’image de dose portale transmise”, INSA de Lyon, 2009.
    Mme. Ginette Marinello Rapporteur (Physicienne Médicale, HDR) M. Gérard Montarou Rapporteur (Directeur de Recherche, CNRS) M. Jacques Balosso Examinateur (Professeur d’Université) M. Pascal Francois Examinateur (Physicien Médical, HDR) Mme. Isabelle Magnin Directeur de thèse (Directeur de Recherche, INSERM) M. David Sarrut Co-Directeur de thèse (Chargé de Recherche, CNRS)
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/JeanNoelBadel_PHD_2009.pdf
  9. [AYAD-07]M. Ayadi, “Dosimétrie dynamique (4D) pour le traitement du cancer du poumon”, Université Claude Bernard Lyon 1, 2007.
    Directeur de thèse : Pr. Madjid Boutemeur M. Jean-Claude Rosenwald, Rapporteur M. Philippe Giraud, Rapporteur M. Jean-François Germond, Examinateur M. Bernard Ille, Examinateur M. Albert Lisbona, Examinateur Mme Chantal Ginestet, Co-directrice de thèse M. David Sarrut, Co-directeur de thèse
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/MyriamAyadi_PHD_2007.pdf
  10. [RIT-07a]S. Rit, “Prise en compte du mouvement respiratoire pour la reconstruction d'images tomodensitométriques”, Université Lumière Lyon 2, 2007.
    Pr. Bloch Isabelle, ENST, Paris Rapporteur DR Grangeat Pierre, CEA, Grenoble Rapporteur DR Magnin Isabelle, CNRS, Lyon Examinateur DR Malandin Grégoire, INRIA, Sophia Antipolis Examinateur Pr. Miguet Serge, LIRIS, Lyon Directeur Cr. Van Herk Marcel, Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Pays-Bas Examinateur Do. Sarrut David, Université Lumière Lyon 2, détaché au CLB, Lyon Co-directeur
    http://liris.cnrs.fr/publis/?id=3354
  11. [BOLD-06a]V. Boldea, “Intégration de la respiration en radiothérapie : apport du recalage déformable d'images”, Université Lumière Lyon 2, 2006.
    Grégoire Malandain, DR INRIA, rapporteur Philippe Cinquin, Professeur, Grenoble, rapporteur Jean Rousseau, Professeur, examinateur Greg Sharp, Assistant Research Physicist, MGH (Boston), examinateur, David Sarrut, chercheur au CLB, co-directeur de thèse, Serge Miguet, Professeur, directeur de thèse
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/VladBoldea_PhD_2006.pdf
  12. [SARR-00]D. Sarrut, “Recalage multimodal et plate-forme d'imagerie médicale à accès distant”, Université Lumière Lyon 2, 2000.
    Mme. Jocelyne Troccaz, Rapporteur, Directeur de Recherche CNRS M. Christian Roux, Rapporteur, Professeur Mme. Isabelle Magnin, Examinateur, Directeur de Recherche INSERM M. Ehoud Ahronovitz, Examinateur, Maitre de conférences M. Bernard Tourancheau, Examinateur, Professeur M. Serge Miguet, Professeur, Directeur de thèse, Professeur
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/these/

Miscellaneous

  1. [CAMA-09]S. Camarasu-Pop, Benoit-Cattin, H., Moscicki, J., Sarrut, D., and Glatard, T., “Results and evaluation of ThIS on grid”. Catania, Italie, 2009.
  2. [GLAT-09c]T. Glatard, Camarasu-Pop, S., Benoit-Cattin, H., Clarysse, P., Montagnat, J., Moscicki, J., Olabarriaga, S., and Sarrut, D., “Integrating pilot-jobs, workflows and virtual resource browser to foster medical image analysis on EGEE”. Catania, Italie, 2009.
  3. [CAMA-09a]S. Camarasu-Pop, Sarrut, D., Benoit-Cattin, H., and Glatard, T., “GATE-Lab”. Barcelone, Espagne, 2009.
  4. [CAMA-08c]S. Camarasu-Pop, Benoit-Cattin, H., Guigues, L., and Sarrut, D., “Porting ThIS on the EGEE grid”. Istanbul, Turquie, 2008.
  5. [CAMA-08d]S. Camarasu-Pop, Guigues, L., Benoit-Cattin, H., and Sarrut, D., “ThIS on the Grid”. Clermont-Ferrand, France, 2008.

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