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Journal Article

Conference Paper

  1. [RICH-19]Transpulmonary pressures and computed tomography in experimental ARDS, in 47ème congrès annuel de la Société de Réanimation de Langue Française, Paris, France, 2019, p. Annals of Intensive Care 2019, 9 (Suppl 1):CO-14.
  2. [LIDA-17]Airway-tree segmentation in subjects with acute respiratory distress syndrome, in Scandinavian Conference on Image Analysis, Tromsø, Norway, 2017, pp. 76-87.
  3. [PRIE-12e]J. C. Prieto, Pérez Romanello, C., Pérez Romanello, V., Revol-Muller, C., Odet, C., Orkisz, M., and Hernández Hoyos, M., Segmentación del árbol vascular pulmonar, in XXXVIII Conferencia Latinoamericana en Informática (CLEI), Medellín, Colombia, 2012, pp. 1-7.
  4. [ZULU-11b]M. A. Zuluaga, Hush, D., Delgado Leyton, E. J. F., Hernández Hoyos, M., and Orkisz, M., Learning from Only Positive and Unlabeled Data to Detect Lesions in Vascular CT Images, in Medical Image Computing and Computer Assisted Interventions - MICCAI , Toronto, Canada, 2011, vol. LNCS 6893, Part III, pp. 9-16.
  5. [GUTI-11]F. A. Gutiérrez Ossa, Ortega, D. C., Orkisz, M., Uriza, L. F., and Hernández Hoyos, M., Automatic segmentation of pulmonary arterial tree in Computed Tomography images, in Sexto Congreso Colombiano de Computación (6CCC), Manizales, Colombia, 2011, p. 6 in electronic proc.
  6. [ZULU-10b]M. A. Zuluaga, Orkisz, M., Hernández Hoyos, M., Lozano Martínez, F., and Magnin, I. E., Towards vascular abnormality detection: an SVM approach, in 24rth CARS - Comput Assisted Radiol Surg, Geneva, Switzerland, 2010, vol. 5-suppl.1, pp. S355-6 (abstract).
  7. [MORA-10]A. Morales Pinzón, Orkisz, M., Teillaud, S., Sánchez, J. A., and Hernández Hoyos, M., Extracción semi-automática de ejes de canales de corales, in Sexto Seminario Internacional de Procesamiento de y Análisis de Imágenes Médicas, Bogotá, Colombia, 2010, p. 10 pages in electronic proceedings.
  8. [ZULU-10e]M. A. Zuluaga, Delgado Leyton, E. J. F., Hernández Hoyos, M., and Orkisz, M., Feature selection for SVM-based vascular anomaly detection, in MICCAI Workshop on Medical Computer Vision, Beijing, China, 2010, vol. LNCS 6533, pp. 141-152.
  9. [ZULU-09a]M. A. Zuluaga, Hernández Hoyos, M., and Orkisz, M., Evaluation of partial volume effects in computer tomography for the improvement of coronary artery segmentation, in 23rd CARS - Comput Assisted Radiol Surg, Berlin, Germany, 2009, vol. 4-suppl.1, pp. S40-1 (abstract).
  10. [ZULU-09d]M. A. Zuluaga, Hernández Hoyos, M., and Orkisz, M., Evaluación del efecto de volumen parcial en imágenes TAC para el mejoramiento de la segmentación arterial coronaria, in Quinto Seminario de Ingeniería Biomédica y Quinto Seminario Internacional de Procesamiento de y Análisis de Imágenes Médicas, Bogota, Colombia, 2009, p. 4 in electronic proc.
  11. [ZULU-09c]M. A. Zuluaga, Orkisz, M., Delgado Leyton, E. J. F., Doré, V., Morales Pinzón, A., and Hernández Hoyos, M., Adaptación del algoritmo MARACAS para la segmentación de la bifurcación de la arteria carótida y cuantificación de estenosis en imágenes TAC, in Quinto Seminario de Ingeniería Biomédica y Quinto Seminario Internacional de Procesamiento de y Análisis de Imágenes Médicas, Bogota, Colombia, 2009, p. 5 in electronic proc.
  12. [HERN-08]M. Hernández Hoyos, Zuluaga, M. A., Lozano, M., Prieto, J. C., Douek, P., Magnin, I. E., and Orkisz, M., Coronary centerline tracking in CT images with use of an elastic model and image moments, in MICCAI Workshop - Grand Challenge Coronary Artery Tracking, New York City, USA, 2008, p. 8 on-line: http://hdl.handle.net/10380/1401.
  13. [CANT-07d]D. Cantor Rivera, Orkisz, M., Uriza Carrasco, L. F., and Hernández Hoyos, M., Generación de modelos vasculares específicos al paciente a partir de IRM 3D usando el algoritmo de fast-marching, in Cuarto Seminario de Ingeniería Biomédica y Quinto Seminario Internacional de Procesamiento de y Análisis de Imágenes Médicas, Bogota, Colombia, 2007, p. 2 in electronic proc.
  14. [CARR-06a]J. F. Carrillo, Hernández Hoyos, M., and Orkisz, M., Automatic vascular tree segmentation, in XXXII Conferencia Latinoamericana de Informática CLEI, Santiago de Chile, Chile, 2006, p. 174 (abstract; 8 p. full paper on CD).
  15. [CARR-06b]J. F. Carrillo, Dávila Serrano, E. E., Hernández Hoyos, M., and Orkisz, M., Vascular tree extraction from 3D images, in 20th CARS - Computer Assisted Radiology and Surgery, Osaka, Japan, 2006, p. 462 (abstract).
  16. [CARR-06c]J. F. Carrillo, Hernández Hoyos, M., Dávila Serrano, E. E., and Orkisz, M., Segmentación y visualización arterial en ARM y TAC, in XXXI Congreso Colombiano de Radiología, Cartagena, Colombia, 2006, pp. 21-22 (abstract).
  17. [CARR-05]J. F. Carrillo, Orkisz, M., and Hernández Hoyos, M., Extraction of 3D vascular tree skeletons based on the analysis of connected components evolution, in 11th Int. IAPR Conf. Computer Analysis of Images and Patterns (CAIP 2005), Versailles, France, 2005, vol. 3691, pp. 604-611.
  18. [ORKI-02c]M. Orkisz and Hernández Hoyos, M., Suivi de vaisseaux sanguins dans des images 3D à l'aide d'un modèle de base de moments, in Mathématiques et Imagerie, Journée 'Application à la modélisation et l'imagerie en Cardio-Vasculaire', Lyon, France, 2002.
  19. [ORKI-01c]M. Orkisz and Hernández Hoyos, M., Models for 3D Vascular Image Analysis, in Computer Graphics, Image Processing and Recognition, Warsaw, Poland, 2001.
  20. [HERN-99]M. Hernández Hoyos, Orkisz, M., Roux, J. P., and Douek, P., Inertia-based vessel axis extraction and stenosis quantification in 3D MRA images, in Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS'99), Paris, France, 1999, pp. 189-193.

Book Chapter

  1. [ORKI-04]M. Orkisz and Hernández Hoyos, M., Podstawy technik segmentacji stosowanych w przetwarzaniu obrazow 3D naczyn krwionosnych, in Polska Akademia Nauk Biocybernetyka i Inzynieria Biomedyczna 2000, Obrazowanie biomedyczne, vol. 8, M. Nalecz, Chmielewski, L., Kulikowski, J. M., and Nowakowski, A. Warszawa, Poland: Akademicka Oficyna Wydawnicza EXIT, Publ., 2004, pp. 351–372.

Invited Conference

  1. [ORKI-02b]M. Orkisz and Hernández Hoyos, M., From inertia matrix to the analysis of vascular pathologies, Int Conf Computer Vision and Graphics. Zakopane, Poland, pp. 6-15, 2002.
  2. [ORKI-01b]M. Orkisz and Hernández Hoyos, M., Models for 3D vascular image analysis, Med. Informatics and Technologies, vol. 2. Jaszowiec, Poland, pp. IP13-IP22, 2001.
  3. [ORKI-01f]M. Orkisz and Hernández Hoyos, M., Models for 3D Vascular Image Analysis, Computer Graphics, Image Processing and Recognition. Warsaw, Poland, 2001.
  4. [ORKI-98d]M. Orkisz and Hernández Hoyos, M., Développements récents dans le traitement d'images : principes des techniques de segmentation d'images vasculaires 3D, 2-èmes Journées du Groupe de Recherche et de Réflexion en Angiographie par Résonance Magnétique. Paris, France, pp. 94-103, 1998.

Thesis

  1. [MORA-16]A. Morales Pinzón, Lung segmentation and airway tree matching : Application to aeration quantification in CT images of subjects with ARDS, Université Claude Bernard Lyon 1; Universidad de los Andes, Lyon, Bogotá, 2016.
    Jury: Anna Fabijanska, Łódz University of Technology, Rapporteur Isabelle Bloch, Telecom ParisTech, Rapporteur Fraçoise Prêteux, École des Ponts ParisTech Examinateur Jean-Christophe Richard, Université Lyon 1, Hôpital de la Croix Rousse, Examinateur José Tiberio Hernández, Universidad de los Andes, Examinateur Leonardo Flórez Valencia, Pontificia Universidad Javeriana, Examinateur Maciej Orkisz, Université Lyon 1, Directeur de thèse Marcela Hernández Hoyos, Universidad de los Andes, Directeur de thèse
    PDF icon Alfredo MORALES PINZON.pdf (20.9 MB)
  2. [ZULU-11d]M. A. Zuluaga, Methods for the automation of vascular lesions detection in computed tomography images, Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, 2011.
    Bloch I. (rap.), Hernández J.T. (Pdt), Hernández Hoyos M.(co-Dir.), Magnin I.E., Orkisz M. (co-Dir.), Romero E.E. et Salvado O. (rap.)
  3. [HERN-02d]M. Hernández Hoyos, Segmentation anisotrope 3D pour la quantification en imagerie vasculaire par résonnance magnétique, INSA-Lyon, 2002.
    Bloch I. (rap.), Douek P., Hernandez J.T., Magnin I.E., Nahum R., Orkisz M. et Sequeira J. (rap.)

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