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Conference Paper

  1. [HADD-07]R. Haddad, Magnin, I. E., and Clarysse, P., “A new fully-digital anthropomorphic and dynamic thorax/heart model”, in Proceedings of the 29th Annual International Conference of the IEEE EMBS, Lyon, France, 2007, pp. 5999-6002.
  2. [GELA-07a]A. Gelas, Schaerer, J., Bernard, O., Friboulet, D., Clarysse, P., Magnin, I. E., and Prost, R., “Radial Basis Functions Collocation Methods For Model-Based Level-set Segmentation”, in IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), San Antonio, TX, USA, 2007, vol. 2, pp. 237-240.
  3. [SCHA-07a]J. Schaerer, Gelas, A., Prost, R., Clarysse, P., and Magnin, I. E., “Volumetric Mesh Construction From Scattered Prior Data: Application To Cardiac MR Image Analysis”, in European Signal Processing Conference, Poznań, Poland, 2007, pp. 438-442.
  4. [VAND-07]J. Vandemeulebroucke, Sarrut, D., and Clarysse, P., “Point-validated Pixel-based Breathing Thorax Model”, in International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, 2007, pp. 195-199.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/popi-model
  5. [SCHA-06]J. Schaerer, Qian, Z., Clarysse, P., Metaxas, D., Axel, L., and Magnin, I. E., “Fast and automated creation of patient-specific 3D heart model from tagged MRI”, in From Statistical Atlases to Personalized Models: Understanding Complex Diseases in Populations and Individuals, Satellite Workshop MICCAI 2006, Copenhagen, Denmark, 2006, pp. 91-94.
  6. [DELH-06]B. Delhay, Clarysse, P., Pera, C., and Magnin, I. E., “A spatio-temporal deformation model for dense motion estimation in periodic cardiac image sequences”, in From Statistical Atlases to Personalized Models: Understanding Complex Diseases in Populations and Individuals, Satellite Workshop MICCAI 2006, Copenhagen, Denmark, 2006, p. (in-press).
  7. [SCHA-05]J. Schaerer, Rouchdy, Y., Clarysse, P., Hiba, B., Croisille, P., Pousin, J., and Magnin, I. E., “Simultaneous Segmentation of the Left and Right Heart Ventricles in 3D Cine MR Images of Small Animals”, in Computers In Cardiology, Lyon, France, 2005, pp. 231-234.
  8. [POUS-05]J. Pousin, Rouchdy, Y., Picq, M., Schaerer, J., and Clarysse, P., “Constrained 3D elastic model for the segmentation in cardiac MRI”, in Computers In Cardiology, Lyon, France, 2005, pp. 785-788.
  9. [BRUS-05]E. Brusseau, Said, G., and Clarysse, P., “Modèle numérique d'estimation 2D de la déformation des tissus mous biologiques à partir d'images échographiques radiofréquence: Résultats sur simulations numériques et données expérimentales”, in GRETSI'05, Louvain-La-Neuve, Belgium, 2005, pp. 287-290.
  10. [HADD-05d]R. Haddad, Clarysse, P., Orkisz, M., Revel, D., and Magnin, I. E., “A Realistic Anthropomorphic Dynamic Heart Phantom”, in Computers in Cardiology, Lyon, France, 2005, pp. 801-804.
  11. [DELH-05]B. Delhay, Lotjonen, J., Clarysse, P., Katila, T., and Magnin, I. E., “A Dynamic 3-D Cardiac Surface Model from MR Images”, in Computers In Cardiology, Lyon, France, 2005, pp. 423-426.
  12. [HADD-05b]R. Haddad, Clarysse, P., Orkisz, M., Revel, D., and Magnin, I. E., “A realistic anthropomorphic numerical model of the beating heart”, in Functional Imaging and Modeling of the Heart, Barcelona, Spain, 2005, pp. 384-393.
  13. [GERM-05a]C. Germain, Breton, V., Clarysse, P., Gaudeau, Y., Glatard, T., Jeannot, E., Legré, Y., Loomis, C., Montagnat, J., Moureaux, J. M., Osorio, A., and Texier, R., “Grid-enabling medical image analysis”, in Biogrid'05, proceedings of the IEEE/ACM International Symposium on Cluster Computing and the Grid, Cardiff, UK, 2005.
    http://www.cse.uconn.edu/ huang/BioGrid-05/
  14. [DELH-05b]B. Delhay, Clarysse, P., Lotjonen, J., Katila, T., and Magnin, I. E., “Evaluation of two free form deformation based motion estimators in cardiac and chest imaging”, in Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH), Barcelona, Spain, 2005, pp. 467-476.
  15. [HADD-05a]R. Haddad, Clarysse, P., Orkisz, M., Revel, D., and Magnin, I. E., “Un modèle numérique anthropomorphique du coeur battant”, in Forum de Recherche en Génie Biologique et Médical (JSTIM-FRGBM'05), Nancy, France, 2005, vol. 26, pp. 77-78.
  16. [DELH-04]B. Delhay, Clarysse, P., Bonnet, P., Grangeat, P., and Magnin, I. E., “Combined 3D object motion estimation in medical sequences”, in International Conference on Image Processing, Singapore, Singapore, 2004, pp. 1461-1464.
  17. [QIU-04]B. Qiu, Clarysse, P., Montagnat, J., Janier, M., and Vray, D., “Comparison of 3D Deformable Models For in vivo Measurements of Mouse Embryo from 3D Ultrasound Images”, in IEEE International Ultrasonics Symposium, Montréal, Canada, 2004, pp. 748-751.
  18. [POLL-04]M. Pollari, Lotjonen, T., Makela, T., Pauna, N., Reilhac, A., and Clarysse, P., “Evaluation of cardiac PET-MRI registration methods using a numerical breathing phantom”, in IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Arlington, Vancouver, USA, 2004, pp. 1447-1450.
  19. [MILL-04a]J. Milles, Clarysse, P., Van Susterens, A., Croisille, P., Magnin, I. E., and Arts, T., “Automatic 2D segmentation of the left ventricle in tagged cardia MRI using motion”, in IEEE International Symposium on Biomedical Imaging : From Nano to Macro, Arlington, VA, USA, 2004.
  20. [ZHU-03]Y. M. Zhu, Luo, J. H., Clarysse, P., and Magnin, I. E., “Correction des inhomogénéités d'intensité en IRM”, in Conférences F. Lhermitte - 13e Rendez-Vous de l'ARSEP, Paris, France, 2003, p. 35.
  21. [MAKE-03b]T. Makela, Pollari, M., Lotjonen, J., Pauna, N., Reilhac, A., Clarysse, P., Magnin, I. E., and Katila, T., “Evaluation and comparison of surface and intensity based rigid registration methods for thorax and cardiac MR and PET images”, in Second International Workshop on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Lyon, France, 2003, vol. 2674, pp. 224-233.
  22. [PAUN-03]N. Pauna, Croisille, P., Costes, N., Reilhac, A., Makela, T., Cozar, O., Janier, M., and Clarysse, P., “A Strategy to quantitatively evaluate MRI/PET cardiac rigid registration methods using a Monte Carlo simulator”, in Proceedings of FIMH'03 (Second International Workshop on functional Imaging and Modeling of the Heart), Lyon, France, 2003, vol. 2674, pp. 194-204.
  23. [DYDE-02]I. Dydenko, Chehbi, S., Friboulet, D., Clarysse, P., Magnin, I. E., D'hooge, J., and Bijnens, B., “Using an elastic deformable template for the segmentation of ultrasound cardiac radio frequency images based on the velocity information”, in IEEE International Ultrasonics Symposium, Munich, Germany, 2002, pp. 1706-1709.
  24. [VRAY-02]D. Vray, Discher, A., Le Floc'h, J., Mai, W., Clarysse, P., Pham, Q. C., Montagnat, J., and Janier, M., “3D quantification of ultrasound images : application to mouse embryo imaging in vivo”, in IEEE International Ultrasonics Symposium (UFFC), Munich, Germany, 2002.
  25. [PHAM-01b]Q. C. Pham, Vincent, F., Clarysse, P., Croisille, P., and Magnin, I. E., “A FEM-based deformable model for the 3D segmentation and tracking of the heart in cardiac MRI”, in Some Congress, Pula, Croatia, 2001, pp. 250-254.
  26. [PHAM-01a]Q. C. Pham, Vincent, F., Clarysse, P., Croisille, P., and Magnin, I. E., “Heart segmentation in MRI using a 3D prior biventricular deformable model”, in Forum des Jeunes Chercheurs en GBM, Compiègne, France, 2001, pp. 70-71.
  27. [MAKE-01a]T. Makela, Clarysse, P., Lotjonen, J., Sipila, O., Lauerma, K., Hanninen, H., Nenonen, J., Knuuti, J., Katila, T., and Magnin, I. E., “A new method for the registration of cardiac PET and MR images using deformable model based segmentation of the main thorax structure”, in Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'01), Utrecht, The Netherlands, 2001, pp. 557–564.
  28. [MAKE-01b]T. Makela, Pham, Q. C., Clarysse, P., Lotjonen, J., Laeuerma, K., Hanninen, H., Knuuti, J., Katila, T., and Magnin, I. E., “A 3D model-based approach for the PET-functional and MR-anatomical cardiac imaging data fusion”, in FIMH'01, Helsinki, Finland, 2001, vol. 2230, pp. 83-90.
  29. [CLAR-01b]P. Clarysse, Croisille, P., Bracoud, L., and Magnin, I. E., “Integrated quantitative analysis of tagged magnetic resonance images”, in FIMH'01, Helsinki, Finland, 2001, vol. 2230, pp. 69-75.
  30. [SARR-01b]D. Sarrut, Miguet, S., Vincent, F., Clarysse, P., Exbrayat, M., Brunie, L., Fleute, M., Desbat, L., and Magnin, I. E., “Requêtes complexes et hybrides dans des bases d'images médicales distantes. Une illustration en imagerie cardiaque”, in ASTI'2001, Paris, France, 2001.
  31. [CLAR-01a]P. Clarysse, Lavorel, C., Glière, A., Grangeat, P., and Magnin, I. E., “Un modèle de thorax respirant pour l'évaluation d'algorithmes de reconstruction d'organes en mouvement par tomographie virtuelle”, in GRETSI'01, Toulouse, France, 2001.
  32. [VINC-00b]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., and Magnin, I. E., “Segmentation of the heart from MR image sequences using a 3D active model”, in Biomedical Engineering Society Annual Meeting, Seattle, Washington, USA, 2000.
  33. [CLAR-00b]P. Clarysse, Hans, D., Croisille, P., and Magnin, I. E., “Exploratory analysis of the spatio-temporal deformation of the myocardium during systole from tagged MRI”, in Biomedical Engineering Society Annual Meeting, Seattle, Washington, USA, 2000.
  34. [VINC-00a]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., and Magnin, I. E., “An elasticity-based model and its application to the estimation of the heart deformation in tagged MRI congres”, in IEEE International Conference on Image Processing ICIP'00, Vancouver, Canada, 2000, vol. 1, pp. 629–632.
  35. [VINC-99]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., and Magnin, I. E., “Segmentation et suivi de mouvement d'objets déformables par région active”, in GRETSI 99, Vannes, France, 1999, pp. 163-166.
  36. [BENO-98]H. Benoit-Cattin, Planat, A., Joachimsmann, P., Baskurt, A., Clarysse, P., and Magnin, I. E., “On the coding of active quadtree mesh”, in IEEE International Conference on Image Processing ICIP'98, Chicago, Illinois, USA, 1998, vol. 2, pp. 895-898.
  37. [HAN-98c]M. Han, Clarysse, P., Croisille, P., Magnin, I. E., and Revel, D., “Computer aided diagnosis of the myocardial ischemia based on a spatio-temporal deformation features analysis”, in Computers In Cardiology, Cleveland, Ohio, USA, 1998.
  38. [HAN-98a]M. Han, Clarysse, P., Croisille, P., Magnin, I. E., and Revel, D., “Aide à l'analyse de l'évolution spatio-temporelle de la déformation du myocarde”, in 9ème Forum Jeunes Chercheurs GBM, Brest, France, 1998.
  39. [CLAR-97b]P. Clarysse, Friboulet, D., Magnin, I. E., and Revel, D., “Suivi temporel de surfaces déformables - Application à la surface endocardique du VG”, in VIème Colloque 'de la recherche à la découverte' section 22 du CNRS, Reims, France, 1997.
  40. [CLAR-97e]P. Clarysse, Reissman, P. J., Lefebvre, S., Baudin, O., and Revel, D., “Region-based segmentation of multislice and multiphase cardiac Magnetic Resonance Images”, in World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, Nice, France, 1997, p. 684.
  41. [BOUD-97]A. Boudraa and Clarysse, P., “Fast fuzzy gray level image segmentation method”, in World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, Nice, France, 1997, p. 686.
  42. [CLAR-97d]P. Clarysse, Revel, D., and Magnin, I. E., “Segmentation d'images par résonance magnétique multi-phases et multi-coupes du coeur par une approche de régions déformables”, in Rencontres Annuelles du Futuroscope 'les Techniques d'Imagerie Cardiovasculaire du Futur', Poitiers, France, 1997.
  43. [CLAR-97c]P. Clarysse, “Traitement d'image et infographie en imagerie du coeur”, in Séminaire du LIGIM, Lyon, France, 1997.
  44. [CLAR-96]P. Clarysse, “Recent and Future Trends in Cardiac Image Processing”, in IEEE EMBS International Summer School on Biomedical Imaging, Ile de Berder, France, 1996.
  45. [SOTT-95]F. Sottilini, Clarysse, P., Roux, J. P., Revel, D., and Magnin, I. E., “LV myocardial wall motion estimation with tagged cine MRI (SPAMM)”, in Computers in Cardiology, Vienna, Austria, 1995, pp. 529–532.
  46. [CLAR-95b]P. Clarysse, Jaouen, O., Magnin, I. E., and Morvan, J. M., “Interpolation 3D des parois cardiaques à partir de données discrètes”, in Jour. Thématiques GDR TdSI - GRAISHYM : Mouvement 3D d'objets non rigides, Lille, France, 1995, p. 4 pages.
  47. [CLAR-95a]P. Clarysse, Poupon, F., Barbier, B., and Magnin, I. E., “3D boundary extraction of the left ventricle by a deformable model with a priori information”, in IEEE Int. Conf. Image Processing, Washington, USA, 1995, pp. 492–495.
  48. [CLAR-94c]P. Clarysse, “Evolution temporelle de la courbure 3D des surfaces des parois cardiaques”, in V Colloque'Thérapeutique et médicaments, de la recherche à la découverte', section 22 du CNRS, Montpellier, France, 1994.
  49. [GORC-94b]J. M. Gorce, Friboulet, D., Clarysse, P., and Magnin, I. E., “Three dimensional velocity field estimation of moving cardiac walls”, in Computers in Cardiology, Bethesda, USA, 1994, pp. 489–492.
  50. [CLAR-94b]P. Clarysse, Jaouen, O., Magnin, I. E., and Morvan, J. M., “3D representation and deformation analysis of the heart walls from X-ray and MR images”, in Computers in Cardiology, Bethesda, USA, 1994, pp. 657–660.
  51. [CLAR-94a]P. Clarysse, Friboulet, D., and Magnin, I. E., “Time evolution analysis of differential features on 3D surfaces of the heart walls”, in IEEE Medical Imaging Conf., Norfolk, USA, 1994, pp. 1807–1811.
  52. [CLAR-93b]P. Clarysse, Friboulet, D., and Magnin, I. E., “Curvature assessment of the heart walls in 3D. Acquisition, segmentation, quantification”, in Proc Computers in Cardiology, London, UK, 1993, pp. 607–610.
  53. [CLAR-93a]P. Clarysse, Friboulet, D., and Magnin, I. E., “Calcul de la courbure 3D des parois cardiaques en imagerie dynamique”, in IVème Colloque 'Thérapeutique et Médicaments, de la recherche à la découverte', Section 22 du Comité National de la Recherche Scientifique, Strasbourg, France, 1993.

Conference Proceedings

  1. [RUMI-17a]“Generation of a synthetic database of heart models to evaluate strain-based infarct detection algorithms”, Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé (RITS). SFGBM, Lyon, France, 2017.
  2. [CLAR-08]P. Clarysse, Metaxas, D., and Pousin, J., “Special Issue of Mathematical Modelling of Natural Phenomena on 'Medical Imaging'”, vol. 3. EDP Sciences, Publ, 2008.
  3. [MAGN-03]I. E. Magnin, Montagnat, J., Clarysse, P., Nenonen, J., and Katila, T., “Proceedings of the Second International Workshop on Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH'03), LNCS 2674, 300 pages”. Springer Verlag, Publ, Some City, Some Country, 2003.
  4. [KATI-01]T. Katila, Magnin, I. E., Clarysse, P., Montagnat, J., and Nenonen, J., “Proceedings of the First International Workshop on Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH'01), LNCS 2432, 158 pages”, Lecture Notes in Computer Sciences, LNCS 2432. Springer Verlag, Publ., Some City, Some Country, 2001.

Book Chapter

  1. [BERN-15]O. Bernard, Clarysse, P., Dietenbeck, T., Friboulet, D., Jehan-Besson, S., and Pousin, J., “Extraction and segmentation of structures in image sequences”, in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, P. Clarysse and Friboulet, D. Hoboken (USA) - London (UK): Wiley-ISTE, 2015, pp. 3-64.
  2. [BERN-15]O. Bernard, Clarysse, P., Dietenbeck, T., Friboulet, D., Jehan-Besson, S., and Pousin, J., “Extraction and segmentation of structures in image sequences”, in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, P. Clarysse and Friboulet, D. Hoboken (USA) - London (UK): Wiley-ISTE, 2015, pp. 3-64.
  3. [FRIB-15]O. Bernard, Clarysse, P., Dietenbeck, T., Friboulet, D., Jehan-Besson, S., and Pousin, J., “Extraction et segmentation de structures dans des séquences d’images”, in Traitement et analyse d'images cardiaques, Paris: Hermès-Lavoisier, 2015, pp. 25-82.
  4. [CLAR-15h]“Cardiac motion estimation in tagged MRI”, in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, London: Hoboken-Wiley-ISTE, 2015, pp. 247-256.
  5. [GIRA-15]P. R. Girard, Clarysse, P., Pujol, R., Wang, L., and Delachartre, P., “Differential Geometry Revisited by Biquaternion Clifford Algebra”, in in J.-D. Boissonnat et al. (Eds), Curves and Surfaces, Springer, 2015, pp. 216-242.PDF icon Girard-15 draft ICCS Differential Geometry Revisited by Biquaternion.pdf (404.61 KB)
    http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-22804-4_17
  6. [CLAR-15g]“Motion estimation and analysis”, in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, London: Hoboken-Wiley-ISTE, 2015, pp. 65-102.
  7. [CLAR-14]P. Clarysse and Pousin, J., “Estimation et analyse du mouvement”, in Traitement et analyse d'images cardiaques, Paris: Hermes-Lavoisier, 2014, pp. 83-116.
  8. [NEYR-14]B. Neyran and Viallon, M., “Analyse, méthodes et post-traitements d’images par RM dynamiques pour la quantification de la perfusion myocardique”, in Traitement et analyse des images cardiaques, vol. 2, P. Clarysse and Friboulet, D. Paris: Hermès-Lavoisier, 2014, pp. 121-155.
  9. [CLAR-14a]P. Clarysse and Croisille, P., “Estimation de mouvement en IRM marquée”, in Traitement et analyse d'images cardiaques, Paris: Hermes-Lavoisier, 2014, pp. 249-256.
  10. [BASA-14]M. Alessandrini, Basarab, A., Bernard, O., and Delachartre, P., “Estimation du mouvement du coeur basée sur la phase en imagerie cardiaque multimodalités”, in Traitement et analyse des images cardiaques, P. Clarysse and Friboulet, D. Paris: Hermès-Lavoisier, 2014, pp. 221-248.
  11. [GIRA-13]P. R. Girard, Pujol, R., Clarysse, P., Marion, A., Goutte, R., and Delachartre, P., “Analytic Video (2D+T) Signals by Clifford Fourier Transforms in Multiquaternion Grassmann-Hamilton-Clifford Algebras”, in Quaternion and Clifford Fourier transforms and Wavelets, TIM/Birkhauser., Springer, 2013, p. 350.
    http://www.springer.com/birkhauser/mathematics/book/978-3-0348-0602-2
  12. [GERM-09]C. Germain-Renaud, Breton, V., Clarysse, P., Delhay, B., Gaudeau, Y., Glatard, T., Jeannot, E., Legré, Y., Montagnat, J., Moureaux, J. M., Osorio, A., Pennec, X., Schaerer, J., and Texier, R., “Grid Analysis of Radiological Data”, in Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine and Healthcare, M. Cannataro IGI, 2009.

Book

  1. [CLAR-15b]P. Clarysse and Friboulet, D., Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis. Hoboken (USA) - London (UK): Wiley-ISTE, 2015, p. 370.
  2. [CLAR-15]P. Clarysse and Friboulet, D., Traitement et analyse d'images cardiaques. Paris: Hermès-Lavoisier, 2015, p. 344.
  3. [CLAR-11b]P. Clarysse, Imagerie dynamique cardiaque et thoracique. Hermes-Lavoisier, 2011, p. 288 pages.

Invited Conference

  1. [CLAR-13]P. Clarysse, “Imagerie cardiaque: de l'image à la quantification globale et régionale de l'anatomie, de la structure et de la fonction”. École STIC'2013, Nouvelles Technologies de l'Information et de la Communication, MONASTIR – TUNISIE, 2013.
    www.ltim.org/EcoleStic2013/
  2. [CLAR-13a]P. Clarysse, Vandroux, C., Bourguignon, C., Spaltenstein, J., Viallon, M., and Croisille, P., “Segmentation tissulaire d'images par RM de réhaussement tardif – Etat de l'art et algorithmes disponibles dans le plugin OsiriX CMRSegTools”. Journée du Groupe de Recherche en Imagerie Cardiaque (GRIC), JFR, Paris, 2013.
  3. [CLAR-12a]P. Clarysse, Glatard, T., and Cervenansky, F., “Simulation d’images pour l’aide à l’évaluation en analyse d’images cardiaques - La plateforme d’imagerie virtuelle VIP”, Consortium du projet ANR VIP. Journée GDR STIC-Santé sur l’évaluation de méthodes de segmentation en Imagerie Médicale, Paris, 2012.
  4. [CLAR-12]P. Clarysse and Friboulet, D., “Méthodes de segmentation et modélisation du ventricule gauche en ultrasons et IRM”, Journée du Groupe de Recherche en Imagerie Cardiaque (GRIC) : Analyse d'images cardiaques, Journées Françaises de Radiologie. Paris, France, 2012.
  5. [CLAR-10e]P. Clarysse and Croisille, P., “Quantification du mouvement du coeur en IRM”. 1ère journée du Groupe de Recherche en Imagerie Cardiaque (GRIC), Marseille, 2010.
  6. [CLAR-10d]P. Clarysse, “Quantification du mouvement en imagerie cardiaque”. AG GDR STIC-Santé, Villejuif, 2010.
  7. [CLAR-09b]P. Clarysse, “Analyse d’images cardiaques : de l’acquisition à la quantification”. Séminaire ‘Modélisation, simulation et imagerie du myocarde’, organisé le laboratoire MAP5 (Université Paris Descartes) et l’action CardioSense3D de l’INRIA, Paris, 2009.
  8. [CLAR-09a]P. Clarysse, “Analyse d'images médicales et modélisation: de l'acquisition à la quantification”, Séminaire du GDR STIC-Santé, Thème F, Modélisation et simulation d'organes. Paris, 2009.
  9. [CLAR-09a]P. Clarysse, “Analyse d’images médicales et modélisation: de l’acquisition à la quantification”. Séminaire du GDR STIC-Santé, Thème F, Modélisation et simulation d'organes (2ème partie), 2009.
  10. [CLAR-09]P. Clarysse, “Analyse d'images cardiaques : de l'acquisition à la quantification”, Séminaire Modélisation, simulation et imagerie du myocarde, Laboratoire MAP5 (Université Paris Descartes) et action CardioSense3D (INRIA). Paris, 2009.
  11. [CLAR-08b]P. Clarysse, “Patient specific modeling and analysis of cardiac images”, Seminars of the Computer Vision Center, Universitat Autònoma de Barcelona. Barcelona, 2008.
  12. [CLAR-03]P. Clarysse, “Applications en imagerie cardio-vasculaire de la fusion d'images”, Journées de Recherche en Imagerie Médicale. Nantes, France, 2003.
  13. [CLAR-97h]P. Clarysse, Revel, D., and Magnin, I. E., “Segmentation d'images par résonance magnétique multi-phases et multi-coupes du coeur par une approche de régions déformable”, Rencontres Annuelles du Futuroscope 'les Techniques d'Imagerie Cardiovasculaire du Futur'. Poitiers, France, 1997.

HDR

  1. [CLAR-05]P. Clarysse, “Analyse d'images cardiaques assistée par les modèles”. INSA Lyon / Université Claude-Bernard Lyon I, 2005.
    Axel L. (rap.), Ayache N. (rap.), Herment A. (rap.), Pousin J., Bittoun J., Revel D. et Magnin I.E.

Thesis

  1. [CAST-12]C. Casta, “Estimation 3D conjointe forme/structure/mouvement dans des séquences dynamiques d’images. Application à l’obtention de modèles cardiaques patients spécifiques anatomiques et fonctionnels.”, Insa de Lyon, Lyon, 2012.PDF icon PhD.pdf (18.62 MB)
  2. [GREZ-11]L. Grèzes-Besset, “Détection et analyse du mouvement respiratoire à partir d’images fluoroscopiques en radiothérapie”, INSA de Lyon, Lyon, 2011.
    Mme Jocelyne Troccaz Directeur de Recherche CNRS Rapporteur M. Jean-Yves Boire Professeur des Universités Rapporteur Mme Catherine Mennessier Enseignant Chercheur Examinatrice M. Albert Lisbona Physicien Médical Examinateur M. Patrick Clarysse Directeur de Recherche CNRS Directeur de thèse M. David Sarrut Chargé de Recherche CNRS Co-Directeur de thèse M. Loïc Dibout Ingénieur d’Application Elekta SAS Invité
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/LouiseGrezesBesset_PHD_2011.pdf
  3. [VAND-10]J. Vandemeulebroucke, “Lung Motion Modelling and Estimation for Image Guided Radiation Therapy”, INSA de Lyon, 2010.
    David Hawkes Professeur, UCL, Londres Rapporteur Dirk Vandermeulen Professeur, KUL, Louvain Rapporteur Grégoire Malandain Directeur de Recherche, INRIA Examinateur Denis Friboulet Professeur, INSA, Lyon Examinateur Jan Kybic Chargé de Recherche, CVUT, Prague Co-directeur de thèse David Sarrut Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse Patrick Clarysse Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/JefVandemeulebroucke_PHD_2010.pdf

Miscellaneous

  1. [GIBA-12]B. Gibaud, Forestier, G., Benoit-Cattin, H., Cervenansky, F., Clarysse, P., Friboulet, D., Gaignard, A., Hugonnard, P., Lartizien, C., Liebgott, H., Montagnat, J., Tabary, J., and Glatard, T., “Design of an ontology for the annotation of object models used for medical image simulation”. Lyon, 2012.
  2. [GLAT-09c]T. Glatard, Camarasu-Pop, S., Benoit-Cattin, H., Clarysse, P., Montagnat, J., Moscicki, J., Olabarriaga, S., and Sarrut, D., “Integrating pilot-jobs, workflows and virtual resource browser to foster medical image analysis on EGEE”. Catania, Italie, 2009.
  3. [SARR-01]M. Sarreau, Miguet, S., Vincent, F., Clarysse, P., Exbrayat, M., Brunie, L., Fleute, M., Desbat, L., and Magnin, I. E., “Requêtes complexes et hybrides dans des bases d'images médicales distantes. Une illustration en imagerie cardiaque”. 2001.
  4. [CLAR-00c]P. Clarysse, Hans, D., Croisille, P., and Magnin, I. E., “Exploratory analysis of the spatio-temporal deformation of the myocardium during systole from tagged MRI”. 2000.
  5. [VINC-00c]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., and Magnin, I. E., “Segmentation of the heart from MR image sequences using a 3D active model”. 2000.
  6. [CLAR-97g]P. Clarysse, “Traitement d'image et infographie en imagerie du coeur”. 1997.
  7. [CLAR-97f]P. Clarysse, Friboulet, D., Magnin, I. E., and Revel, D., “Suivi temporel de surfaces déformables - Application à la surface endocardique du VG”. 1997.
  8. [CLAR-96b]P. Clarysse, “Recent and Future Trends in Cardiac Image Processing”. 1996.
  9. [CLAR-94d]P. Clarysse, “Evolution temporelle de la courbure 3D des surfaces des parois cardiaques”. 1994.

Patent

  1. [Dela-13]P. Delachartre, Basarab A.,, Clarysse, P., and Croisille, P., “Procede d'estimation du mouvement dans une sequence d'images dynamiques”, 2013.

Magazine Article

  1. [CLAR-12a]P. Clarysse and Pousin, J., “Méthodes mathématiques pour l’analyse d’images médicales”, ALS Magazine - Académie Lorraine des Sciences, pp. 28-34, 2012.

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