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Book Chapter

  1. [LANG-10f]M. Langer, Boistel, R., Pagot, E., Cloetens, P., and Peyrin, F., X-ray in-line phase microtomography for biomedical applications, in Microscopy: Science, Technology, Applications and Education, vol. 1, A. Méndez-Vilas and Díaz, J. Badajoz, Spain: Formatex Research Center, 2010, pp. 391-402.
  2. [PEYR-10]F. Peyrin and Douek, P., La Tomographie par rayons X, in Imagerie Médicale à base de photons, Editions Hermès Sciences, Lavoisier., H. Fanet Paris: , 2010, pp. 189-234.
  3. [BENH-09]A. Benhali and Peyrin, F., Discrete methods, in Traité IC2 "Tomography", Hermès 2009, pp. 89-112.
  4. [PEYR-09c]F. Peyrin and Charvet, A. M., Synchrotron tomography, in Traité IC2 "Tomography", Hermès 2009, p. (in-press).
  5. [BENH-02]A. Benhali and Peyrin, F., Les méthodes discrètes, in Traité IC2 La tomographie, P. Grangeat Paris, France: Hermès, Publ., 2002, pp. 111–138.
  6. [CHAR-02]A. M. Charvet and Peyrin, F., Chap. 15 : La tomographie synchrotron, in Traité IC2 La tomographie, P. Grangeat Paris, France: Hermès, Publ., 2002, pp. 219–237.
  7. [PEYR-99e]F. Peyrin, Medical Imaging and applications I : Synchrotron Radiation MicroTomography, in Applications of Synchrotron Radiation, M. Grioni, Lambertini, C., and San Miguel, A. Editions Frontières, Publ., 1999, pp. 166–179.
  8. [LAVA-96c]A. M. Laval-Jeantet, Mesures de densité et de masse osseuse : techniques, in Maladies métaboliques osseuses de l'adulte, D. Kuntz Paris, France: Flammarion, Publ., 1996.
  9. [GENA-92]H. K. Genant, Lang, P., Steiger, P., Gluer, C., and Laval-Jeantet, A. M., Osteoporosis : assessment by bone densitometry, in Imaging of the spine and the spinal cord, C. C. Manelfe New York: Ravenpress, Publ., 1992, pp. 195–212.

Invited Conference

  1. [RIT-16A]4D and motion-compensated cone-beam CT, 4D Treatment Planning Workshop. Groningen, The Netherlands, 2016.
  2. [SARR-14]D. Sarrut, Vandemeulebroucke, J., Bouilhol, G., Pinho, R., Delmon, V., and Rit, S., Open source tools for validation of deformable registration, ESTRO 33 (European SocieTy for Radiotherapy & Oncology) . Vienna, Austria, 2014.
  3. [LANG-14a]M. Langer, Cloetens, P., Weber, L., and Peyrin, F., Phase retrieval in in-line phase tomography - developments and applications, Advanced X-Ray Tomography: Experiment, Modeling, and Algorithms. Lorentz Center, Leiden, Netherlands, 2014.
  4. [RIT-14a]S. Rit, Motion-compensated Cone-Beam CT for Image-Guided Radiotherapy, SIAM Conference on Imaging Science. Hong Kong, China, 2014.
  5. [LANG-13a]M. Langer, Cloetens, P., Weber, L., and Peyrin, F., Phase retrieval in in-line phase tomography - developments and applications, Holographic Imaging: from macro to nano - current methodologies for hologram reconstruction. 2013.
  6. [LANG-13]M. Langer, Cloetens, P., Hesse, B., Suhonen, H., Pacureanu, A., Raum, K., and Peyrin, F., Design of priors for X-ray in-line phase tomography, Satellite Meeting Real and Reciprocal Space X-ray Imaging. The Royal Society, 2013.
  7. [PEYR-13b]F. Peyrin, Advances in 3D X-ray imaging and associated inverse problems. Optimization and Statistics in Image Processing", CIMI International Workshop, Toulouse , 2013.
  8. [PEYR-13d]F. Peyrin and Bousson, V., Pathologie osseuse : quantification 3D du tissu osseux : de la macro à la nano-imagerie. Journée État de l’Art en Imagerie Clinique, France Life Imaging, Paris, France, 2013.
  9. [PEYR-12b]F. Peyrin, Pacureanu, A., and Langer, M., Investigation of the bone osteocyte network from synchrotron nano-CT. Biology and medicine: from fundamental research to diagnosis BioMedSyn2012 , Orsay, 16-17 Janv, 2012.
  10. [PACU-12b]A. Pacureanu, Langer, M., Rose, J. L., Revol-Muller, C., and Peyrin, F., 3D nano-CT: a new approach for imaging at cellular scale, General Assembly of the French Society for Signal and Image Processing in Life Sciences. 2012.
  11. [PEYR-11d]Imagerie : principe and applications de la micro-CT 3D. Ecole BIBIVT Biomécanique et Bioingénérie du Vieillissement des Tissus, CNRS, Marrakech, Maroc, 2011.
  12. [PEYR-11d]F. Peyrin, Imagerie : principe and applications de la micro-CT 3D. Ecole BIBIVT Biomécanique et Bioingénérie du Vieillissement des Tissus, CNRS, Marrakech, Maroc,, 2011.
  13. [PEYR-11c]F. Peyrin, Pacureanu, A., and Langer, M., 3D microscopic imaging by synchrotron radiation micro/nano-ct, 18th IEEE International Conference on Image Processing (ICIP). pp. 3057-3060, 2011.
  14. [PEYR-11d]Imagerie : principe and applications de la micro-CT 3D. Ecole BIBIVT Biomécanique et Bioingénérie du Vieillissement des Tissus, CNRS, Marrakech, Maroc, 2011.
  15. [SARR-10]D. Sarrut, Vandemeulebroucke, J., and Rit, S., Advances in deformable image registration of thoracic 4D CT, ESTRO 29 (European SocieTy for Radiotherapy & Oncology) . Barcelona, Spain, 2010.
  16. [LANG-10e]M. Langer, In-line synchrotron radiation phase tomography, The Rank Prize Funds Symposium on High Resolution X-Ray Imaging. Grasmere, UK, 2010.
  17. [PEYR-08d]F. Peyrin, Algorithmes de reconstruction tomographique,, Séminaire Total , Pierre-Bénite. Pierre Bénite, 2008.
  18. [PEYR-08c]F. Peyrin, Micro-CT du tissu osseux : acquisition et analyse, Journées du GDR Mécano-transduction. Paris, 2008.
  19. [PEYR-08a]F. Peyrin, Micro-CT and articular characterization, 5ème colloque International en Bioingénierie et Thérapies. Nancy, 2008.
  20. [LARR-08c]A. Larrue and Peyrin, F., Microtomographie synchrotron : Application à la Détection des microfissures dans l'os, Journ/'ees du Groupement National de Microscopie Electronique A Balayage et de microanalyses GN-MEBA, - Société Francaise de Physique. Paris, 2008.
  21. [PETE-06d]Z. Peter and Peyrin, F., Progress in three-dimensional analysis of bone tissue from micro-CT, Israel-France Meeting on Medical Imaging Technology Israel-France. Jerusalem, Israel, 2006.
  22. [PEYR-06a]F. Peyrin, Paramétres de la micro-architecture osseuse, Séminaire Qualité Osseuse. Paris, France, 2006.
  23. [PEYR-06b]F. Peyrin, Algorithmes de Reconstruction en micro-tomographie synchrotron, Atelier sur la micro-tomographie. Synchrotron Soleil, Paris, France, 2006.
  24. [PEYR-05d]F. Peyrin, Micro-tomographie in vitro pour l'étude de la micro-architecture osseuse, Réunion INSERM Interface Orthopédie et Rhumatologie, 'La fragilité osseuse et ses déterminants'. Paris, France, 2005.
  25. [PEYR-04d]F. Peyrin, Synchrotron Radiation Micro-tomography in Bone Research, 16th International Bone Densitometry Workshop. Annecy, France, 2004.
  26. [PEYR-04h]F. Peyrin, Micro-tomographie X 3D : principes et utilisation du rayonnement synchrotron, Atelier CNRS ' Imagerie/Tomographie et analyse fine par spectroscopie d'émission '. Sarcenas, France, 2004.
  27. [PEYR-04g]F. Peyrin, Synchrotron et les équipements de laboratoire : une comparaison, Colloque de la SF2M, Imagerie 3D en science des matériaux. Grenoble, France, 2004.
  28. [PEYR-04e]F. Peyrin, Ultra-structural bone imaging, Conf. of the Society of Biomechanics. Hertogenbosch, The Netherlands, 2004.
  29. [PEYR-03a]F. Peyrin, Imaging biological samples at the micrometer scale using synchrotron radiation micro-CT, Conférence CNRS Jacques Monod 'Imagerie in vivo'. Roscof, France, 2003.
  30. [PEYR-02c]F. Peyrin and Cloetens, P., Synchrotron RadiationCT of biological tissue, IEEE ISBI 02 (International Symposium on Biomedical Image Processing). Washington, USA, 2002.
  31. [PEYR-02b]F. Peyrin, Analyse de la microstructure osseuse par microtomographie 3D par rayons X, Journee Scientifique 'Imagerie in vivo du petit animal', IFR 58. Paris, France, 2002.
  32. [PEYR-02a]F. Peyrin, Bone imaging in small animals using X-ray micro-CT, Journée Scientifique d'imagerie du Petit Animal. Lyon, France, 2002.
  33. [RITM-02]E. Ritman and Peyrin, F., Micro-imaging of Small Animals and Biological Specimens, IEEE ISBI 02 (International Symposium on Biomedical Image Processing). Washington, USA, p. (CD-ROM), 2002.
  34. [PEYR-02f]F. Peyrin, Imagerie du petit animal par microtomographie X, Session spéciale, Journées Française de Radiologie. Paris, France, 2002.
  35. [PEYR-00e]F. Peyrin, Nuzzo, S., Martin-Badosa, E., and Cloetens, P., Assessment of bone quality using synchrotron radiation based micro-CT, Special Focus Day The search for better surrogate markers for bone strength. Warnemünde (Germany), 2000.
  36. [PEYR-00c]F. Peyrin, Exploration de l'architecture osseuse : développement et perspectives, XIIIème journée scientifique du GRIO (GRoupe de Recherche et d'Information sur les Ostéoporoses). Paris, France, 2000.
  37. [QUEN-98b]D. Quenard, Bentz, D., Kunzel, H., Peyrin, F., Salome-Pateyron, M., and Baruchel, B., Microstructure and transport properties of porous building materials: X-ray micro-tomography and 3D-reconstruction, Workshop on modeling of deterioration in composite building components due to heat and mass transfer. Tsukuba, Japan, 1998.
  38. [PEYR-96f]F. Peyrin, Pateyron, M., Amiel, M., and Cloetens, P., Microtomographie osseuse utilisant le rayonnement synchrotron, 'Recherche en imagerie de l'os', Comité Interface INSERM/SFR, JFR'96, 6 Novembre, vol. 77. Paris, France, p. 923, 1996.
  39. [LAVA-94a]A. M. Laval-Jeantet, Trame osseuse et vieillissement, 42e Journées Françaises de Radiologie, vol. 6. Paris, France, p. S108, 1994.
  40. [LAVA-93c]A. M. Laval-Jeantet, Chevalier, F., Bergot, C., Peyrin, F., and Houssard, J. P., La structure trabéculaire vertébrale en tomodensitométrie, Architecture et résistance mécanique osseuses. Masson, Publ., Montpellier, France, pp. 82–91, 1993.

HDR

  1. [LETA-08]J. M. Létang, Contribution à l'imagerie et à la dosimétrie des rayonnements ionisants : traitement du signal et simulation en physique de transport de particules. Université Claude Bernard Lyon 1 -- INSA de Lyon, 2008.
    Françoise Peyrin, rapporteure ; Frédéric Truchetet, rapporteur ; Albert Heinrich Walenta, rapporteur ; Daniel Babot ; Rolf Clackdoyle ; Denis Dauvergne ; Ali Mohammad-Djafari
  2. [SARR-08b]D. Sarrut, Imagerie dynamique et simulations Monte-Carlo pour la radiothérapie guidée par l'image. Université Claude-Bernard Lyon I, 2008.
    Barillot C. (rap.), Malandain G. (rap.), Verellen D. (rap.), Buvat I., Deneve W., Peroche B. et Clarysse P.

Thesis

  1. [VILC-17B]Dual-energy cone-beam CT for proton therapy, L'Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, Lyon, 2017.
    Jury : Katia Parodi Professeur, Ludwig-Maximilians-Universität, Munich Rapporteur Frank Verhaegen Professeur, MAASTRP Clinic, Maastricht Rapporteur Denis Dauvergne Directeur de Recherche, CNRS, Grenoble Examinateur Marie-Claude Biston Docteur Centre Léon Bérard, Lyon ExaminatriceJean Michel Létang Maître de Conférences, INSA-LYON, Villeurbanne Directeur de thèse Simon Rit Chargé de Recherche, CNRS, Villeurbanne Co-directeur de thèse
  2. [SOSS-16]Correction of scattered radiation in mul-ti-energy radiography and tomography, université de Lyon, Grenoble, 2016.
    Jury: LETANG J.M (Directeur), DESBAT L ( Président),MOHAMMAD-DJAFARI A (Rapporteur), MOREL C (Rapporteur), POLUDNIOWSKI G ( Rapporteur), REBUFFEL V( Examinatrice), TABARY J (Invité)
    PDF icon Arthur SOSSIN_2016.pdf (5.62 MB)
  3. [QUIN-16A]Proton computed tomography, L'Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, Lyon, 2016.
    Jury : Gary Royle Professeur, University College London, London Rapporteur Joao Seco Professeur, University of Heidelberg, Heidelberg Rapporteur Iréne Buvat Directeur de Recherche, CNRS, Orsay Examinateur Denis Dauvergne Directeur de Recherche, CNRS, Grenoble Examinateur Jean Michel Létang Maître de Conféerences, INSA-LYON, Villeurbanne Directeur de thèse Simon Rit Chargé de Recherche, CNRS, Villeurbanne Co-directeur de thèse
  4. [TOMA-2016]Joint super-resolution/segmentation approaches for the tomographic images analysis of the bone micro-architecture, Université de Lyon Lyon 2, LYON, 2016.
    Jury :PEYRIN Françoise (Directeur), SIXOU Bruno (Co-Directeur), DENIS Loïc (Co-Encadrant),  KOUAME Denis (Rapporteur), LEDESEMA-CARBAYO Maria J (Rapporteur), RUAN Su (Pdt), PIALAT Jean-Baptiste (invité),
    PDF icon AlinaTOMA.pdf (19.64 MB)
  5. [WEBER-16]Iterative tomographic X-Ray phase reconstruction, université de Lyon, Grenoble, 2016.
    Jury : BLEUET Pierre (Rapporteur), MOKSO Rajmund ( Rapporteur), BUFFIERE Jean-Yves ( Examinateur), VERDUN Francis ( Examinateur), PEYRIN Françoise (Directrice de thèse), LANGER Max ( Co-directeur de thèse) CLOETENS Peter (Invité)
    PDF icon These Loriane Weber_sept2016.pdf (37.15 MB)
  6. [HILA-15]E. Hilaire, Simulation et reconstruction 3D à partir de caméra Compton pour l’hadronthérapie : influence des paramètres d’acquisition, INSA de Lyon, Villeurbanne, 2015.
    COMTAT C. (rapporteur), GUEDON J.-P. (rapporteur), SARRUT D. (examinateur), VISVIKIS D. (président), PEYRIN F. (directrice de thèse), MAXIM V. (co-directrice)
    PDF icon Estelle HILAIRE.pdf (9.06 MB)
  7. [HESS-14]B. Hesse, Characterization of tissue properties on the sub-micron scale in human bone by means of Synchrotron Radiation CT, 2014.
    Thèse co-tutelle, INSA Lyon et Humboldt University Berlin, soutenue le 24 Mars 2014, Jury : B Kanngiesser (rapporteur), P Laugier (rapporteur), Nils Blüthgen (président), M Langer (invité), K Raum, (co-directeur), F Peyrin (directeur)
  8. [ROEL-14]F. Roehlinghoff, Design and Implementation of a Prompt-Gamma Camera for Real-Time Monitoring of Ion Beam Therapy, INSA de Lyon, 2014.
    Joel Hérault, Rapporteur ; Frank Verhaegen, Rapporteur ; Dietmar Georg ; Tony Lomax ; David Sarrut ; Julien Smeets ; Denis Dauvergne
  9. [DONG-14]P. Dong, Three-dimensional analysis of bone cellular tissue from SR CT Imaging, 2014.
    Jury : J.M. Chassery (rapporteur), V. Bousson (rapporteur), J. Ohser, M. Orkisz (président), F. Peyrin (directeur), thèse de doctorat EEA, INSA Lyon, soutenue le 21 Févier 2014
  10. [DELM-13a]V. Delmon, Recalage déformable de projections de scanner X à faisceau conique, INSA de Lyon, 2013.
    Laurent Desbat, Professeur, Grenoble, Rapporteur Jan Kybic, Chargé de Recherche, CVUT, Prague, Rapporteur Oscar Acosta, Maitre de conférence, Rennes, Examinateur Grégoire Malandain, Directeur de Recherche, INRIA, Nice, Examinateur David Sarrut, Directeur de Recherche, CNRS, Lyon, Directeur de thèse Simon Rit, Chargé de Recherche, CNRS, Lyon, Co-directeur de thèse Loic Dibout, Ingénieur d’Application, Elekta SAS, Paris, Invité

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