Equipe d'encadrement au laboratoire CREATIS :

Carole FRINDEL, David ROUSSEAU

Contact :

carole.frindel@insa-lyon.fr

Sujet du stage :

Développement d’une IHM pour l’étude de l’ischémie cérébrale par IRM de perfusion.

Contexte :

Les accidents vasculaires cérébraux (AVC) constituent une des premières causes de mortalités dans les pays développés. Le traitement clinique de ces accidents passe par des acquisitions d’images de perfusion par résonance magnétique (IRM) réalisées en complément d’images anatomiques pour contribuer à l'établissement du diagnostic puis dans le suivi thérapeutique de l'AVC. Lors de l'IRM de perfusion, un agent de contraste est injecté au patient. Cet agent se diffuse ou s‘écoule différemment dans les tissus où s'est produit l’AVC. Par traitement des images acquises lors de l’injection de cet agent de contraste, il est possible de réaliser des cartographies donnant l’état physiologique des tissus. La chaîne de traitement de ces images est relativement élaborée et le développement d’outils logiciels conviviaux pour les médecins est donc un enjeu important.

Objectif du stage :

Un ensemble de traitements dits « experts » (recalage d’images, déconvolution, segmentation d’image) permettant de réaliser des cartographies de perfusion est dores et déjà opérationnel au sein de notre équipe de recherche. Dans ce contexte, l'enjeu de ce stage sera d’implanter ces traitements sous la plateforme de développement logiciel du laboratoire CREATIS : CREATOOLS. Les CreaTools sont un ensemble d'outils conçus pour répondre aux besoins d'utilisateurs finaux. Ainsi, les CreaTools fournissent un environment de développement permettant aux utilisateur de créer facilement leurs propres applications basées sur des composants existants (ensemble de traitements dits « experts ») et des composants prêts à l'emploi : librairies graphiques et de visualisation d'images médicales entre autres. Plus concrètement, il s'agira de créer une IHM en tant que surcouche de l'ensemble de traitements dits « experts » en utilisant les Creatools. Dans ce cadre, on veillera en particulier à l’ergonomie de l’IHM. Dans un second temps, des données issues d’une cohorte de patients seront analysées et étudiées sur un plan statistique.

Compétences développées :

Traitement numérique des images biomédicales 3D de type IRM, analyses statistiques.

Compétences attendues :

Programmation en matlab et c++. Connaissances de VTK, ITK et/ou wxWidgets seront un plus.

Gratification :

417 euros net par mois. Durée 4 à 6 mois