Contexte scientifique:
Le scanner X est aujourd’hui l'imagerie de référence pour la planification des doses en radiothérapie. L'imagerie par résonance magnétique (IRM) permet toutefois une meilleure visualisation et caractérisation des tissus mous entrainant une délinéation plus précise des tumeurs. Elle nécessite toutefois par la suite soit de générer des images tomodensitométriques de substitution ou synthétiques à partir d’images RM sur lesquelles est réalisée la planification soit le calcul direct de dose à partir d’images par RM se basant sur des hypothèses physiques.
Objectif: Dans ce contexte, l’objectif du stage sera de :
- Définir un protocole d’IRM de la région tête et cou de manière à réduire l’ensemble des artefacts d’image tout en permettant la classification et la caractérisation des tissus
- Segmenter les images par RM pour la délinéation des Organs at Risk (OAR)
- Segmenter les images par RM pour la délinéation des volumes tumoraux macroscopique et microscopique
- Classer les différentes régions anatomiques en 5 classes de tissues (air, os, fluide, tissus mou et graisse)
- Générer des images synthétiques de scanner X et de densité électronique.
Encadrement scientifique : Ce stage sera réalisé au laboratoire CREATIS sur le site du Centre Léon Bérard au sein des départements d’imagerie diagnostique et de radiothérapie et en collaboration avec la société TheraPanacea.
Profil et compétences du candidat recherché :
- Physicien/ne avec des bonnes compétences dans les techniques d’imagerie et de physique des particules
- Traitement d’image
- Maitrise d’outils de programmation
- Volonté de s’investir dans le domaine médical et de travailler dans un milieu interdisciplinaire
- Autonomie, dynamisme
- Bon niveau oral et écrit en anglais
Références bibliographiques :
- Owrangi AM, Greer PB, Glide‐Hurst CK. MRI‐only treatment planning: benefits and challenges. Phys Med Biol. 2018 Feb 26;63(5):05TR01. doi: 10.1088/1361‐6560/aaaca4.
- Optimizing MRI sequences and images for MRI‐based stereotactic radiosurgery treatment planning. Taghizadeh S, Labuda C, Yang CC, Morris B, Kanakamedala MR, Vijayakumar S, Rey‐Dios R, Duggar WN, Florez E, Fatemi A.
- Amir M. Owrangi, Peter B. Greer and Carri K. Glide‐Hurst. MRI‐only treatment planning: benefits and challenges. Phys Med Biol. ; 63(5): 05TR01. doi:10.1088/1361‐6560/aaaca4
- Maria A Schmidt and Geoffrey S Payne. Radiotherapy Planning using MRI. Phys Med Biol. 2015 November 21; 60(22): R323–R361. doi:10.1088/0031‐9155/60/22/R323
Contacts: Les candidatures, composées d’un CV détaillé, des relevés de notes et classements des formations suivies et d’une lettre de motivation mettant en avant les adéquations du parcours et des compétences du candidat, sont à adresser à : olivier.beuf@creatis.insa‐lyon.fr, frank.pilleul@lyon.unicancer.fr et benjamin.leporq@creatis.insa‐lyon.fr.