IRM de la tête et du cou pour la planification de radiothérapie-(2020-2021)

Contexte scientifique:

Le  scanner  X  est  aujourd’hui  l'imagerie  de  référence  pour  la  planification  des  doses  en  radiothérapie. L'imagerie par résonance magnétique  (IRM) permet toutefois une meilleure visualisation et caractérisation  des tissus mous entrainant une délinéation plus précise des tumeurs. Elle nécessite toutefois par la suite soit  de  générer  des  images  tomodensitométriques  de  substitution  ou  synthétiques  à  partir  d’images  RM  sur  lesquelles est réalisée la planification soit le calcul direct de dose à partir d’images par RM se basant sur des  hypothèses physiques. 

Objectif:  Dans ce contexte, l’objectif du stage sera de : 

  • Définir un protocole d’IRM de la  région  tête et  cou de manière à  réduire l’ensemble  des artefacts  d’image tout en permettant la classification et la caractérisation des tissus
  •  Segmenter les images par RM pour la délinéation des Organs at Risk (OAR)
  •  Segmenter  les  images  par  RM  pour  la  délinéation  des  volumes  tumoraux  macroscopique  et  microscopique
  •  Classer  les  différentes  régions  anatomiques  en  5  classes  de  tissues  (air,  os,  fluide,  tissus  mou  et  graisse) 
  •  Générer des images synthétiques de scanner X et de densité électronique.

Encadrement scientifique :  Ce  stage  sera  réalisé  au  laboratoire  CREATIS  sur  le  site  du  Centre  Léon  Bérard  au  sein  des  départements d’imagerie diagnostique et de radiothérapie et en collaboration avec la société TheraPanacea. 

Profil et compétences du candidat recherché :  

  • Physicien/ne avec des bonnes compétences dans les techniques d’imagerie et de physique des particules 
  • Traitement d’image  
  • Maitrise d’outils de programmation 
  • Volonté de s’investir dans le domaine médical et de travailler dans un milieu interdisciplinaire 
  • Autonomie, dynamisme 
  • Bon niveau oral et écrit en anglais 

Références bibliographiques : 

  1. Owrangi AM, Greer PB, Glide‐Hurst CK. MRI‐only treatment planning: benefits and challenges. Phys Med Biol. 2018  Feb 26;63(5):05TR01. doi: 10.1088/1361‐6560/aaaca4. 
  2. Optimizing MRI sequences and images for MRI‐based stereotactic radiosurgery treatment planning. Taghizadeh S,  Labuda C, Yang CC, Morris B, Kanakamedala MR, Vijayakumar S, Rey‐Dios R, Duggar WN, Florez E, Fatemi A. 
  3. Amir M. Owrangi, Peter B. Greer and Carri K. Glide‐Hurst. MRI‐only  treatment planning: benefits and challenges.  Phys Med Biol. ; 63(5): 05TR01. doi:10.1088/1361‐6560/aaaca4 
  4.  Maria  A  Schmidt  and  Geoffrey  S  Payne.  Radiotherapy  Planning  using  MRI.  Phys  Med  Biol.  2015  November  21;  60(22): R323–R361. doi:10.1088/0031‐9155/60/22/R323 

Contacts: Les candidatures, composées d’un CV détaillé, des relevés de notes et classements des formations suivies et d’une lettre de motivation mettant en avant les adéquations du parcours et des compétences du candidat,  sont à adresser à :  olivier.beuf@creatis.insa‐lyon.fr,  frank.pilleul@lyon.unicancer.fr  et  benjamin.leporq@creatis.insa‐lyon.fr.