Présentations et séminaires à CREATIS

Date Titre Lieu / Résumé
15/11/2016 - 14:00 Atelier Git

Que vous travailliez sur un article ou sur le code d'un logiciel, seul ou avec des collaborateurs, un gestionnaire de versions tel que Git peut vous être très utile! Vous pouvez ainsi conserver un historique et facilement vous synchroniser avec d'autres contributeurs.

C'est pourquoi je vous convie à une initiation à Git le mardi 15 novembre de 14h à 16h. Vous pourrez venir y pratiquer les commandes de base (clone, add, commit, pull, push, status, log, help), seul puis à plusieurs.

07/11/2016 - 09:00 Passeport Informatique - 7 et 8 novembre

Le Passeport Informatique vise à donner à chaque membre CREATIS, ancien ou nouveau, les clés informatiques pour la vie et le travail au laboratoire. 2 matinées de 9h à 12h les 7 et 8 novembre 2016.

https://intranet.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/PasseportInformatique

04/11/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

La ligne de commande sous linux : quelques principes et des exemples simples par Fabrice Bellet.

Retour d'expérience : "_\{(.*)(?=\})\}" ou comment les expressions régulières facilitent la vie, démonstration via des exemples pratiques par Sami Qorchi.

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24/10/2016 - 14:00 «Correction of scattered radiation in multi-energy radiography and tomography»

L’imagerie à rayons X couplée aux détecteurs résolus en énergie permet de différencier les matériaux présents et d’estimer leurs contributions respectives. Cependant, ces techniques nécessitent des images très précises. La présence du rayonnement diffusé conduit à une perte du contraste spatial et un biais dans l’imagerie radiographique ainsi que des artefacts dans la tomodensitométrie (TDM). L’objectif principal de cette thèse était de développer une approche de correction du rayonnement diffusé adaptée à l’imagerie multi-énergies.

19/10/2016 - 10:00 MRI coils of the Future
11/10/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Reprise du CLUB des Développeurs. Venez exprimer vos attentes et vos propositions de contenu pour l'année à venir!

Gérer votre projet avec Redmine par Claire Mouton.

Utilisation du cluster à CREATIS par Eduardo Dávila.

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04/10/2016 - 14:00 Détection et caractérisation du cancer de la prostate par images IRM 1.5T multiparamétriques

Composition du jury :

Monsieur Olivier BASSET, Professeur des Universités - Université Claude Bernard Lyon 1

Monsieur Nacim BETROUNI, Chargé de Recherche - INSERM U 1189 (Rapporteur)

Monsieur Bruno GAS, Professeur des Universités - Université Pierre et Marie Curie, Paris (Rapporteur)

Monsieur Rémi FLAMARY, Maître de Conférences - Université de Nice Sophia Antipolis

Madame Carole LARTIZIEN-MENIERE, Chargée de Recherche HDR - CNRS UMR5220                ( Co-Directrice)

30/09/2016 - 10:00 Iterative tomographic X-ray phase reconstruction.

Titre :

Iterative tomographic X-ray phase reconstruction.

Date et heure :

Vendredi 30 Septembre 2016 à 10h00

Lieu :

Salle René CHAR, La Rotonde, INSA Lyon

Jury :

- BLEUET Pierre, HDR, CEA Leti (rapporteur)

28/09/2016 - 14:00 Proton Computed tomography

Titre :

Proton Computed tomography

Date et heure :

Mercredi 28 Septembre 2016 à 14h00

Lieu :

Salle René CHAR, La Rotonde, INSA Lyon

Jury :

- M. ROYLE Gary, Professeur des Universités, University College London (rapporteur)

23/09/2016 - 14:00 Computer aided diagnosis of epilepsy lesions based on multivariate and multimodality data analysis

Titre :

Computer aided diagnosis of epilepsy lesions based on multivariate and multimodality data analysis

Date et heure :

Vendredi 23 Septembre 2016 à 14h00

Lieu :

Amphithéâtre Claude CHAPPE, INSA Lyon

Jury :

21/09/2016 - 13:30 Imagerie médicale optique du métabolisme cérébral sain ou pathologique

Composition du jury

Monsieur Walter BLONDEL, Professeur des Universités ; Université de Lorraine

Monsieur Jacques DEROUARD, Professeur des Universités ; Université Grenoble 1

Monsieur Jean-Marc DINTEN, Ingénieur CEA ; CEA Grenoble 

Monsieur Sylvain GIOUX, Professeur des Universités ; Université de Strasbourg

Monsieur Norbert NOURY, Professeur des Universités ; UCBL 

20/09/2016 - 14:00 Three-dimensional image analysis of high resolution confocal microscopy data of the Drosophila melanogaster brain

Titre :

Three-dimensional image analysis of high resolution confocal microscopy data of the Drosophila melanogaster brain

Date et heure :

Mardi 20 Septembre 2016 à 14h00

Lieu :

Salle Réunion de CREATIS

Jury :

19/07/2016 - 14:00 Aspects of Data Quality and Interpretation in Medical Imaging
13/05/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Architecture du code pour projets de recherche en Matlab (I) - Comment organiser les expérimentations, tests, validations, l'analyse des résultats et la visualisation ? par Bruno Sciolla.

FiPy : Mate-la bien mon EDP !, un package Python pour aller plus loin que MATLAB pour les Equations aux Dérivées Partielles par Clément Douarre et David Rousseau.

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29/04/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Programmation Orientée Objet sous Matlab par Olivier Bernard.

Concepts de Programmation Orientée Objet (OOP) par Eduardo Dávila.

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07/04/2016 - 14:00 Utilisation de COMSOL dans le domaine de l'imagerie médicale

Inscription obligatoire sur le site : https://www.comsol.fr/events/id/71761/

01/04/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Sage: Python sophistiqué et développement collaboratif par Thierry Dumont (Ingénieur de Recherche au sein de l'Institut Camille Jordan).

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18/03/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Simplified application porting to VIP (Virtual Imaging Platform) with the Boutiques system par Tristan Glatard.

Concepts de Programmation Orientée Objet (OOP) par Eduardo Dávila.

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10/03/2016 - 10:00 Tractographie cardiaque optimale par IRM du Tenseur de diffusion

Titre :

Tractographie cardiaque optimale par IRM du Tenseur de diffusion.

Date et heure :

Jeudi 10 Mars 2016 à 10h00.

Lieu :

Amphithéâtre Est, Bâtiments Les Humanités, INSA

Jury :

- DESVIGNES Michel, Professeur des Universités, INP Grenoble (rapporteur)

- ROUSSEAU François, Professeur des Universités, Télécom Bretagne (rapporteur)

- USSON Yves, Chargé de Recherche, TIMC-IMAG

09/03/2016 - 14:00 Joint super-resolution/segmentation approaches for the tomographic images analysis of the bone micro-architecture

Titre :

Joint super-resolution/segmentation approaches for the tomographic images analysis of the bone micro-architecture.

Date et heure :

Mercredi 9 Mars 2016 à 14h00

Lieu :

Salle René CHAR, La Rotonde, INSA Lyon

Jury :

- Maria LEDESMA-CARBAYO, Professeur (TU), Université Politecnica de Madrid (rapporteur)

- Denis KOUAME, Professeur, IRIT, Université Paul Sabatier, Toulouse (rapporteur)

04/03/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Simple?TK for wrapping ?TK par Simon Rit.

Reproductibilité et partage de code en ultrasons par Hervé Liebgott.

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18/02/2016 - 14:00 X-ray CT for Plant Phenotyping: Research and Development.

Dr Stefan GERTH du Fraunhoffer Intitute de Wurzburg donnera un talk intitulé "X-ray CT for Plant Phenotyping: Research and Development." Cette présentation sera précédée d'une intervention de David ROUSSEAU intitulée "extension du domaine d'applicabilité de VIP par un couplage avec des modèles biologiques réalistes".

12/02/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Simulations of propagation-based phase contrast images using Octave par Loriane Weber.

Calcul parallèle et distribué à CREATIS - ressources disponibles par Sorina Pop.

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11/02/2016 - 14:30 Contrôle temporel de la cavitation ultrasonore : application à la thrombolyse ultrasonore extracorporelle.

Titre :

Contrôle temporel de la cavitation ultrasonore : application à la thrombolyse ultrasonore extracorporelle.

Date et heure :

Jeudi 11 Février 2016 à 14h30.

Lieu :

Salle de Conférences LabTAU, 151 cours Albert Thomas Lyon 3ème

Jury :

- Jean-Christophe BERA, Professeur des Universités, Université Claude Bernard Lyon 1

- Christian CACHARD, Professeur des Universités, Université Claude Bernard Lyon 1

02/02/2016 - 13:00 PhD Student

Deterministic X-Ray simulation for CT acquisition planning

01/02/2016 - 14:00 Sparsity and Compressed Sensing for Signal and Image Reconstruction and Decomposition
29/01/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Developing an open-source software: the RTK example par Simon Rit.

Protocole de caractérisation d'antenne IRM incluant un traitement automatique développé sous Matlab et rendu exécutable sur VIP (Virtual Imaging Platform) par Laurent Mahieu-Williame.

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28/01/2016 - 14:00 Développement d'un système de topographie optique diffuse résolu en temps et hyperspectral pour le suivi de l'activité cérébrale humaine.

Titre :

Développement d'un système de topographie optique diffuse résolu en temps et hyperspectral pour le suivi de l'activité cérébrale humaine.

Date et heure :

Jeudi 28 Janvier 2016 à 14h00.

Lieu :

Petit Amphithéâtre de CPE Lyon

Rapporteurs :

- Patrick POULET, Maître de Conférences-Praticien Hospitalier, Institut de Physique Biologique, Strasbourg

26/01/2016 - 14:00 Segmentation du poumon et appariement d'arbres bronchiques : application à la quantification de l'aération sur des images CT de patients avec SDRA

Titre :

Segmentation du poumon et appariement d'arbres bronchiques : application à la quantification de l'aération sur des images CT de patients avec SDRA.

Date et heure :

Mardi 26 Janvier 2016 à 14h00

Lieu :

Amphithéâtre de l'IPNL, Université Claude Bernard Lyon 1

Rapporteurs :

- Anna FABIJAŃSKA, Łódź University of Technology

- Isabelle BLOCH, Telecom ParisTech

Jury :

20/01/2016 - 13:00 Imagerie de diffusion cardiaque en respiration libre

Titre :

Imagerie de diffusion cardiaque en respiration libre.

Date et heure :

Mercredi 20 Janvier 2016 à 13h00

Lieu :

Amphithéâtre Réné CHAR, Rotonde, INSA Lyon

Rapporteurs :

- Hervé SAINT-JALMES, Professeur, LTSI, Université de Rennes 1

- Jacques FELBLINGER, Professeur, Directeur U947, CHU de Nancy

Jury :

- Hervé SAINT-JALMES, Professeur, LTSI, Université de Rennes 1

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