Séminaires passés et présentations à CREATIS

Date Titre Lieu / Résumé
10/12/2018 - 14:00 Ultrafast, broadband and multi-pulse transmissions for ultrasonic imaging

Jury :

M. Denis KOUAME, Professeur des Universités, Université de Toulouse, Rapporteur

Mme Caroline PETITJEAN, Maître de conférence, Université de Rouen Normandie, Rapporteur

M. Roberto LAVARELLO, Professeur des Universités, Pontificia Universidad Católica del Perú, Examinateur

14/12/2018 - 14:00 High-frame rate ultrasound methodologies for cardiac applications

Jury :

Mme Nadjia KACHENOURA, Chargée de recherche HdR, Inserm / Université Paris Sud Rapporteur

M. Jan D’HOOGE, Professeur, Katholieke Universiteit Leuven Rapporteur

Mme Ling TONG, Ingénieur de recherche, Supersonic Imaging Examinatrice

M. Olivier BASSET, Professeur, Laboratoire CREATIS Examinateur

10/12/2018 - 09:30 Imagerie multimodale 2D/3D ultrarapide. Application à l'imagerie microstructurale cardiovasculaire.

Soutenance d'habilitation à diriger des recherches, devant le jury suivant :

Mme Anabela Da Silva, Directrice de Recherche CNRS, Université Aix-Marseille, Rapporteuse

M. Denis Kouamé, Professeur des Universités, Université Paul Sabatier Toulouse, Rapporteur

M.Christian Jutten, Professeur des Universités, Université Grenoble-Alpes, Rapporteur

29/11/2018 - 09:00 Journée des Doctorants de troisième année

09h00-09h20: Bingqing XIE : Material decomposition in spectral CT for medical applications

(Dir : Y.ZU) équipe 1

09h20-09h40  Pierre-Antoine GANAYE :Image segmentation of brain MRI under anatomical constraints 

(Dir: H. BENOIT-CATTIN , M.SDIKA) équipe 2 

28/11/2018 - 14:00 Développement et validation de stratégies de quantification lipidique par imagerie et spectroscopie proton à 3T : Application à l’étude de la surnutrition

Jury :

M. Hervé Saint-Jalmes,Professeur des Universités et Professeur Hospitalier, Biosit Université de Rennes, Rapporteur

Mme Florence Franconi,Ingénieur Recherches, Laboratoire: Micro et Nanomédecines Translationnelles, Université d'Angers, Rapporteur

M. Jean-Marie Bonny, Directeur de Recherches INRA Clermont-Ferrand, Examinateur

M. Denis Friboulet, Professeur des Universités, Laboratoire CREATIS, Lyon, Examinateur

11/12/2018 - 11:00 Recent Developments in Spectral-Based Ultrasonic Tissue Characterization

Echographic imaging depicts anatomical structure by displaying the magnitude of the envelope-detected backscattered echoes. However, ultrasonic radiofrequency data contains a richer information content that can be exploited for constructing images of intrinsic tissue properties. In particular, spectral-based ultrasonic tissue characterization techniques allow imaging parameters such as the backscatter coefficient and the attenuation coefficient.

26/11/2018 - 14:00 Échographie compressée: une nouvelle stratégie d’acquisition et de formation pour une imagerie ultrarapide

Jury :

Basarab Adrian, Maître de conférences HDR, Université Paul Sabatier de Toulouse, Rapporteur

Luo Jianwen, Maître de conférences HDR, Université Tsinghua, Rapporteur

Thiran Jean-Philippe, Professeur, Ecole Fédérale Polytechnique de Lausanne, Rapporteur

Bridal Lori, Directrice de recherche CNRS, Sorbonne Université, Examinatrice

27/11/2018 - 11:00 Ultrasound-based carotid elastography for detection of vulnerable atherosclerotic plaques validated by magnetic resonance imaging

05/10/2018 - 10:00 2D and 3D multispectral photoacoustic imaging - Application to the evaluation of blood oxygen concentration

Jury : 

Anabela DA SILVA Chargée de recherche HDR Institut Fresnel CNRS, Marseille, France Rapporteur

Georg SCHMITZ Professeur Ruhr Universität Bochum, Bochum, Allemagne Rapporteur

Jean-Philippe THIRAN Professeur Ecole polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Suisse Examinateur

26/09/2018 - 14:00 Méthodes IRM innovantes pour la caractérisation de la microstructure des tissus biologiques

Composition du Jury:

 

Najat Salameh, Professeur, Université de Bâle Rapporteur

Stéphane Serfaty, Professeur, Université de Cergy Pontoise Rapporteur

Jean-Michel Franconi, Professeur, Université de Bordeaux Rapporteur

Stefan Enoch, DR CNRS, Université de Marseille  Examinateur

Isabelle DufourProfesseur, Université de Bordeaux Examinatrice

Noël Burais, Professeur, Université de Lyon  Examinateur

18/12/2017 - 09:00 Exploitation des effets électro-optiques pour la sécurité en IRM : applications des liaisons optiques pour des capteurs RF endoluminaux et des sondes de mesure du TAS

Composition du jury :

- Monsieur LEVEQUE Philippe, Directeur de recherche CNRS, Université de Limoges; (Rapporteur)

-Monsieur SAINT-JALMES Hervé, Professeur et Praticien Hospitalier, Université de Rennes; (Rapporteur)

-Madame COURJAL Nadège, Maître de conférences, Université Franche-Comté; (Examinateur)

22/12/2017 - 10:00 Imagerie ultrasonore ultra-rapide dédiée à la quantification 3D du mouvement cardiaque

Composition du jury :

Monsieur PERNOT Mathieu, Directeur de Recherche, INSERM Paris ; (Examinateur)

Madame PETITJEAN Caroline, Maître de Conférences - HDR, Université de Rouen ; (Rapporteur)

Monsieur SARRY Laurent, Professeur des Universités, Université Clermont Auvergne ; (Rapporteur)

Monsieur LIEBGOTT Hervé, Professeur des Universités, Université Lyon 1 ;

05/10/2017 - 10:00 Traitement et simulations d’images d’IRM de perfusion pour la prédiction de l’évolution de la lésion ischémique dans l’AVC

Composition du Jury :

Mme. Su RUAN PR. Univ ROUEN, rapporteuse

M. Olivier MICHEL PR. Univ GRENOBLE, rapporteur

Mme Stéphanie ALLASSONNIERE PR. Ecole POLYTECHNIQUE, examinatrice

Mme Carole FRINDEL MCF, INSA LYON, co-encadrante

M. Emmanuel GRENIER DR. ENS LYON, co-directeur

M. David ROUSSEAU PR. Université d'ANGERS, Directeur de Thèse

 

30/11/2017 - 10:30 L'imagerie ultrasonore de la thrombolyse ultrasonore

Composition du jury :

- Madame ALBOUY-KISSI Adelaide, Maître de Conférences, Université d'Auvergne (Examinatrice)

Monsieur AUBRY Jean-Francois, Directeur de Recherche, CNRS PARIS (Rapporteur)

Monsieur BERA Jean-Christophe, Professeur des Universités, Université Lyon 1 (co-Directeur de Thèse)

Madame BRIDAL Lori, Directrice de Recherche, CNRS PARIS (Examinatrice)

27/10/2017 - 15:00 Single-pixel imaging: development and applications of adaptive methods

Composition du Jury :

M. BARANIUK Richard Professeur des Universités Rapporteur

M. SOUSSEN Charles Professeur des Universités Rapporteur

M. ARRIDGE Simon Professeur des Universités Examinateur

MME TARONI Paola Professeur des Universités Examinateur

04/10/2016 - 14:00 Détection et caractérisation du cancer de la prostate par images IRM 1.5T multiparamétriques

Composition du jury :

Monsieur Olivier BASSET, Professeur des Universités - Université Claude Bernard Lyon 1

Monsieur Nacim BETROUNI, Chargé de Recherche - INSERM U 1189 (Rapporteur)

Monsieur Bruno GAS, Professeur des Universités - Université Pierre et Marie Curie, Paris (Rapporteur)

Monsieur Rémi FLAMARY, Maître de Conférences - Université de Nice Sophia Antipolis

Madame Carole LARTIZIEN-MENIERE, Chargée de Recherche HDR - CNRS UMR5220                ( Co-Directrice)

16/12/2016 - 14:00 Fourier-based reconstruction of ultrafast sectorial images in ultrasound

Résumé :Three-dimensional echocardiography is one of the most widely used modality in real time heart imaging thanks to its noninvasive and low cost. However, the real-time property is limited because of the limited speed of sound. To increase the frame rate, plane wave and diverging wave in transmission have been proposed to drastically reduce the number of transmissions to reconstruct one image. In this thesis, starting with the 2D plane wave imaging methods, the reconstruction of 2D/3D echocardiographic sequences in Fourier domain using diverging waves is addressed.

08/06/2016 - 14:00 Binary tomography reconstruction of bone microstructures from a limited number of projections

JURY :

Thomas Rodet Professeur à l’ENS Cachan rattaché au SATIE Rapporteur

Jan Sijbers Professeur de University of Antwerp Rapporteur

Ali Mohammad-Djafari Directeur de recherche au LSS-CNRS Examinateur

Bruno Sixou Maitre de conferences HDR , INSA de Lyon Directeur de thèse

Françoise Peyrin Directeur de recherche CREATIS Co-directeur de thèse

29/03/2016 - 14:00 Impact of Intracranial aneurysm one the parent vessel hemodynamic (from in vitro observation to in vivo exploration)

JURY :

FOURNEL Thierry, Professeur, Université Saint-Étienne President of the juryESTÈVE François, Professeur, CHU de Grenoble ReviewerFIEHLER Jens, Uni-Klinik de Hambourg – Eppendorf ReviewerLIEBGOTT Hervé, Maître de Conférence, UCBL Lyon 1 JuryCOURBEBAISSE Guy, Docteur, INSA Lyon DirectorCOSTALAT Vincent, Professeur, CHU de Montpellier Co-directorBONAFÉ Alain, Professeur, CHU de Montpellier Invited member

28/06/2018 - 15:00 Recent research on brain-inspired Modeling and its applications

Given a few labelled samples, semi-supervised learning generally performs much better than supervised learning, semi-supervised learning algorithms are more robust to noise. Label Prediction via Deformed Graph Laplacian for Semi-supervised Learning is presented.  A novel curriculum learning approach, dubbed multi-modal curriculum learning, to optimize the quality of semi-supervised image classification is proposed.

NeuCube, a spiking neural network architecture, is presented for FMRI data analysis of Brain cognition, and for obstacle avoidance in prosthetic vision.

22/06/2018 - 10:00 Blood flow dynamics in cerebral aneurysms: numerical and experimental models based on 4D Flow MRI

Cerebral aneurysms are dilatations of arteries feeding the brain that can present a danger of rupture, brain compression, and thrombotic occlusion of downstream vessels. A number of studies demonstrated that progression of cerebral aneurysms is affected by hemodynamic forces. Intra-aneurysmal flow dynamics can be quantified with in vivo MRI velocimetry (4D Flow MRI) or with patient-specific models based on imaging data.

14/06/2018 - 14:00 Modèles physiques de séparation de phase pour la segmentation : application à l’échographie 3D

Nous proposons un nouvel algorithme de segmentation pour des images échographiques 3D reposant sur la méthode dite des champs de phase. Pour cela, nous considérons un modèle variationnel dont le terme de régularisation est donné par l’équation de réaction-diffusion d’Allen-Cahn. Cette équation vise à modéliser les processus de séparation de phases, par exemple dans les fluides binaires.

28/06/2018 - 13:30 Analyse multirésolution et optimisation non lisse pour la segmentation de texture/Combining multiresolution analysis and non-smooth optimization for texture segmentation

Résumé : La segmentation d'images texturées continue de présenter un challenge majeur en traitement d'images quand les textures rencontrées sont de type stochastiques. Dans cet exposé, nous aborderons cette question par le couplage entre analyse multirésolution et outils d’optimisation non lisse. Nous présenterons tout d'abord les approches usuelles en deux temps estimation/segmentation puis nous expliciterons les modèles développés permettant d'effectuer les deux étapes de façon jointe.

31/05/2018 - 09:00 Journée des Doctorants de première Année
09h00-09h20: Charly Caredda: Imagerie optique hyper-spectrale clinique et préclinique(Dir : B.Montcel, R.Sablong (équipe 5)

09h20-09h40  Maryam Hammami: Segmentation automatique de masses d’images médicales 3D via apprentissage et vision

par ordinateur (Dir: D. Friboulet, R.Kechichian) (équipe 2)

01/06/2018 - 18:46 CLUB des Développeurs

12h12-13h13

How to make the most of MUST? par Damien Garcia (Chargé de Recherche à CREATIS).

Quelques aspects méconnus de GDB : break conditions, break commands, watchpoints, convenience variables, altering execution… par Fabrice Bellet (Ingénieur de Recherche à CREATIS).

Page intranet du CLUB des Développeurs.

04/05/2018 - 12:12 CLUB des Développeurs

12h12-13h13

Comment exploiter à distance vos résultats du cluster sur votre poste de travail? (résultats de calcul, VTK, 2D, 3D, web) par Eduardo Davila (Ingénieur de Recherche à CREATIS).

Building software with CMake par David Parsons (Ingénieur de Recherche chez INRIA).

Page intranet du CLUB des Développeurs.

11/12/2017 - 14:00 Spectroscopie de fluorescence et imagerie optique pour l'assistance à la résection de gliomes: conception et caractérisation de systèmes de mesure et modèles de traitement des données associées, sur fantômes et au bloc opératoire

Composition du jury :

- Mme DA SILVA Anabela, Chargée de Recherche, CNRS Marseille; (Rapporteur)

-M. GIOUX Sylvain, Professeur des Universités, Université de Strasbourg; (Rapporteur )

-Mme LAHRECH Hana, Chargée de Recherche, INSERM Grenoble; (Examinateur)

-Mme LE BOUQUIN JEANNES Régine, Professeure des Universités, Université de Rennes 1; (Examinateur)

18/04/2018 - 13:30 Evaluation de la recanalisation au cours des accidents ischémiques cérébraux : intérêt de la séquence IRM en T2* et de la spectroscopie de proche infra-rouge

Composition du Jury :

Pr Yannick BEJOT (Université de Bourgogne / CHU de Dijon) Rapporteur

Pr Mikaël MAZIGHI (Université Paris 7 / AP HP) Rapporteur

Pr Emmanuelle CANET SOULAS (Université Lyon 1) Examinatrice

Dr Anne Claire LUKASZEWICZ (Université Lyon 1 / CHU de Lyon) Examinatrice

Pr Tarek SHARSHAR (Université Versailles Saint Quentin / AP HP) Examinateur

06/04/2018 - 12:12 CLUB des Développeurs

12h12-13h13

GitLab/GitHub : Etat de l'art des forges logicielles par Claire Mouton (Ingénieur de Recherche à CREATIS). Panorama et description des usages collaboratifs et des solutions d'hébergement

Utilisation des conteneurs dans la recherche : de Docker à Singularity par Sorina Pop (Ingénieur de Recherche à CREATIS).
 
09/03/2018 - 12:12 CLUB des Développeurs
12h12-13h13
 
Outils pour le développement et l'utilisation de codes de calcul scientifique par Anne Cadiou (Ingénieur de Recherche au LMFA – Ecole Centrale Lyon). 
Les GPUs à l'épreuve de la métrologie par Emmanuel Quemener (Ingénieur de Recherche au Centre Blaise Pascal – ENS Lyon).
 

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