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Journal Article

  1. [RAUM-07]K. Raum, Hofmann, T., Leguerney, I., Saied, A., Peyrin, F., Vico, L., et Laugier, P., « Variations of microstructure, mineral density and tissue elasticity in B6/C3H mice », Bone, vol. 41, p. 1017–1024, 2007.
  2. [VALT-07a]S. Valton, Peyrin, F., Delpierre, P., Debarbieux, F., Bonissent, A., Khoury, R., Meessen, C., Morel, C., et Sappey-Marinier, D., « Evaluation of tomographic reconstruction methods for small animal microCT and microPET/CT », Nucl Instr Meth Phys Res A, vol. 571, p. 278-281, 2007.
  3. [PAPA-07]A. Papadimitropoulos, Mastrogiacomo, M., Peyrin, F., Molinari, E., Komlev, V. S., Rustichelli, F., et Cancedda, R., « Kinetics of in vivo bone deposition by bone marrow stromal cells within a resorbable porous calcium phosphate scaffold: an X-ray computed microtomography study », Biotechnol Bioeng, vol. 98, p. 271-281, 2007.
  4. [FOLL-07]H. Follet, Peyrin, F., Vidal-Salle, E., Bonnassie, A., Rumelhart, C., et Meunier, P. J., « Intrinsic mechanical properties of trabecular calcaneus determined by finite-element models using 3D synchrotron microtomography », J Biomech, vol. 40, p. (2174–2183), 2007.
  5. [CANC-07]R. Cancedda, Cedola, A., Guilani, A., Komlev, V., Lagomarsino, S., Mastrogiacomo, M., Peyrin, F., et Rustichelli, F., « Bulk and interface investigations of scaffolds and tissue-engineered bones by X-ray microtomography and X-ray microdiffraction », Biomaterials, vol. 28, p. 2505-2524, 2007.
  6. [BURG-07]A. Burghardt, Wang, Y., Elalieh, H., Thibault, X., Bikle, D., Peyrin, F., et Majumdar, S., « Evaluation of foetal bone structure and mineralization in IGF-I deficient mice using synchrotron radiation microtomography and Fourier transform infrared spectroscopy », Bone, vol. 40, p. 160-168, 2007.
  7. [HAIA-07]G. Haiat, Padilla, F., Peyrin, F., et Laugier, P., « Variation of ultrasonic parameters with microstructure and material properties of trabecular bone: a three-dimensional model simulation », J Bone Min Research, vol. 22, p. 665–674, 2007.
  8. [DELP-07a]P. Delpierre, Basolo, S., Berar, J. F., Bonissent, A., Breugnon, P., Boudet, N., Caillot, B., Chantepie, B., Clemens, J. C., Debarbieux, F., Dinkespiler, B., Khouri, R., Koudobine, I., Mararazzo, V., Meessen, C., Menouni, M., Morel, C., Mouget, C., Pangaud, P., Peyrin, F., Rougon, G., Sappey-Marinier, D., Valton, S., et Vigeolas, E., « PIXSCAN: Pixel Detector CT-Scanner for Small Animal Imaging », Nucl Instr Meth Phys Res A, vol. 571, p. 425-428, 2007.
  9. [PEYR-07c]F. Peyrin, « Three-dimensional image-based characterisation of porous media : application to bone micro-architecture », Osteoporosis Int, vol. 18, p. 837–839, 2007.
  10. [PEYR-07a]F. Peyrin, Mastrogiacomo, M., Cancedda, R., et Martinetti, R., « SEM and 3D synchrotron radiation microtomography in the study of bioceramic scaffolds for tissue engineering applications », Biotechnol Bioeng, vol. 97, p. 638-348, 2007.
  11. [MAST-07]M. Mastrogiacomo, Papadimitropoulos, A., Cedola, A., Peyrin, F., Giononni, P., Pearce, S. G., Alini, M., Giannini, C., Guagliardi, A., et Cancedda, R., « Engineering of Bone using Bone Marrow Stromal Cells and a Silicon-Stabilized Tricalcium Phosphate Bioceramic: evidence for a coupling between Bone Formation and Scaffold Resorption », Biomaterials, vol. 28, p. 1376-1384, 2007.
  12. [PEYR-07b]F. Peyrin, Peter, Z., Larrue, A., Bonnassie, A., et Attali, D., « Three-dimensional image-based characterisation of porous media : application to bone micro-architecture », Image Anal Stereol, vol. 26, p. 179–185, 2007.
  13. [BOSS-07]E. Bossy, Laugier, P., Peyrin, F., et Padilla, F., « Attenuation in trabecular bone: A comparison between numerical simulation and experimental results in human femur », J Acoust Soc Am, vol. 122, p. 2469-2475, 2007.
  14. [APOS-07]L. Apostol et Peyrin, F., « Connectivity Analysis in Very Large 3D Microtomographic Images », IEEE Trans Nucl Sci, vol. 54, p. (197-172), 2007.
  15. [CHAP-06a]C. Chappard, Basillais, A., Benhamou, C. L., Bonnassie, A., Brunet-Imbault, B., Bonnet, N., et Peyrin, F., « Comparison of synchrotron radiation and conventional X-ray microcomputed tomography for assessing trabecular bone microarchitecture of human femoral heads », Med Phys, vol. 33, p. 3568-3577, 2006.
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17022253
  16. [VALT-06a]S. Valton, Peyrin, F., et Sappey-Marinier, D., « A FDK-based Reconstruction Method for Off-centered Circular Trajectory Cone Beam Tomography », IEEE Trans Nucl Sci, p. 2736-2745, 2006.
  17. [APOS-06]L. Apostol, Boudousq, V., Basset, O., Odet, C., Yot, S., Tabary, J., Dinten, J. M., Boller, E., Kotzki, P. O., et Peyrin, F., « Relevance of 2D radiographic texture analysis for the assessment of 3D bone micro-architecture », Med Phys, vol. 33, p. 3546-3556, 2006.
  18. [RAUM-06a]K. Raum, Cleveland, R. O., Peyrin, F., et Laugier, P., « Derivation of elastic stiffness from site-matched mineral density and acoustic impedance maps », Phys Med Biol, vol. 51, p. 747-758, 2006.
  19. [KOML-06]V. Komlev, Peyrin, F., Mastrogiacomo, M., Cedola, A., Papadimitropoulos, A., Rustichelli, F., et Cancedda, R., « Kinetics of in Vivo Bone Deposition by Bone Marrow Stromal Cells into Porous Calcium Phosphate Scaffolds: An X-Ray Computed Microtomography Study », Tissue Eng, vol. 12, p. (3449-3458), 2006.
  20. [RAUM-06b]K. Raum, Leguerney, I., Chandelier, F., Talmant, M., Saied, A., Peyrin, F., et Laugier, P., « Site-matched assessment of structural and tissue properties of cortical bone using scanning acoustic microscopy and synchrotron radiation muCT », Phys Med Biol, vol. 51, p. 733-746, 2006.
  21. [HOFM-06]T. Hofman, Raum, K., Leguerney, I., Saied, A., Peyrin, F., Vico, L., et Laugier, P., « Assessment of bone structure and acoustic impedance in C3H and BL6 mice using high resolution scanning acoustic microscopy », Ultrasonics, vol. 44, supp 1, p. pp e1307-e1311, 2006.
  22. [CHAP-06b]C. Chappard, Peyrin, F., Bonnassie, A., Lemineur, G., Brunet-Imbault, B., Lespessailles, E., et Benhamou, C. L., « Subchondral Bone Micro-Architectural Changes In Osteoarthritis : a Synchrotron Micro-Computed Tomography Study », Osteoarthritis Cartilage, vol. 14, p. 215-223, 2006.
  23. [VALT-06b]S. Valton, Peyrin, F., et Sappey-Marinier, D., « Analysis of Cone Beam Artifacts in Off-Centered Circular CT for Four Reconstruction Methods », Int J Biomed Imaging, vol. 2006, p. Article ID 80421, 8 pages, 2006.
  24. [FOLL-05]H. Follet, Bruyère-Garnier, K., Peyrin, F., Roux, J. P., Arlot, M. E., Burt-Pichat, B., Rumelhart, C., et Meunier, P. J., « Relationship between compressive properties of human os calcis and microarchitecture assessed from 2D and 3D synchrotron microtomography », Bone, p. 340–351, 2005.
  25. [PEYR-05c]F. Peyrin, Boivin, G., et Braillon, P., « Bone microarchitecture in human foetuses », Clinical Cases in Mineral and Bone Metabolism, vol. 2, p. 150-157, 2005.
  26. [BAYA-05]S. Bayat, Apostol, L., Boller, E., Brochard, T., et Peyrin, F., « In vivo imaging of bone micro-architecture in mice with 3D synchrotron radiation microtomography », Nucl Instr Meth Phys Res A, vol. 548, p. 247-252, 2005.
  27. [BOSS-05a]E. Bossy, Padilla, F., Peyrin, F., et Laugier, P., « Three-dimensional simulation of ultrasound propagation through trabecular bone structures measured by synchrotron microtomography », Phys Med Biol, vol. 50, p. 5545-5556, 2005.
  28. [LAUG-05]P. Laugier, Padilla, F., Peyrin, F., Raum, K., Saied, A., Talmant, M., et Vico, L., « Apport des ultrasons dans l'exploration du tissu osseux », Innov Tech Biol Med - RBM, vol. 26, p. 299-311, 2005.
  29. [LAST-05]D. Last, Peyrin, F., et Guillot, G., « Accuracy of 3D MR microscopy for trabecular bone assessment: a comparative study on calcaneus samples using 3D synchrotron radiation microtomography », Magma, p. 1352-8661, 2005.
  30. [MAST-05]M. Mastrogiacomo, Muraglia, A., Komlev, V., Peyrin, F., Rustichelli, F., Crovace, A., et Cancedda, R., « Tissue engineering of bone: search for a better scaffold », Orthod Craniofacial Res, vol. 8, p. 277-284, 2005.
  31. [RAUM-05a]K. Raum, Leguerney, I., Chandelier, F., Bossy, E., Talmant, M., Saied, A., Peyrin, F., et Laugier, P., « Bone microstructure and elastic tissue properties are reflected in QUS axial transmission measurements », Ultrasound Med Biol, vol. 31, p. 1225-1235, 2005.
  32. [MAST-04]M. Mastrogiacomo, Komlev, V., Hausard, M., Peyrin, F., Turquier, F., Casari, S., Cedola, A., Rustichelli, F., et Cancedda, R., « X-ray microtomography for tissue engineering constructs », Tissue Eng, p. 1767-1774, 2004.
  33. [BOSS-04a]E. Bossy, Talmant, M., Peyrin, F., Akrout, L., Cloetens, P., et Laugier, P., « An In Vitro Study of the Ultrasonic Axial Transmission Technique at the Radius: 1-MHz Velocity Measurements Are Sensitive to Both Mineralization and Intracortical Porosity », J Bone Min Research, vol. 19, p. 1548-1556, 2004.
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  35. [NUZZ-03]S. Nuzzo, Meneghini, C., Braillon, P., Bouvier, R., Mobilio, S., et Peyrin, F., « Microarchitectural and physical changes during foetal growth in human vertebral bone », J Bone Min Research, vol. 18, p. 760-768, 2003.
  36. [HENG-03]S. Hengsberger, Enstroem, J., Peyrin, F., et Zysset, P., « How is the indentation modulus of bone tissue related to its macroscopic elastic response? A validation study », J Biomech, vol. 36, p. 1503-1509, 2003.
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  39. [MART-03b]E. Martin-Badosa, Amblard, D., Nuzzo, S., Elmoutaouakkil, A., Vico, L., et Peyrin, F., « Excised bone structures in mice: imaging at three-dimensional synchrotron radiation micro CT », Radiology, vol. 229, p. 921-928, 2003.
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  55. [BENT-00]D. P. Bentz, Quenard, D. A., Kunzel, H. M., Baruchel, J., Peyrin, F., Martys, N., et Garboczi, E. J., « Microstructure and transport properties of porous building materials. ii: three-dimensional x-ray tomographic studies », Mater Struct, vol. 33, p. 147–153, 2000.
  56. [PEYR-00a]F. Peyrin, Salome-Pateyron, M., Nuzzo, S., Cloetens, P., Laval-Jeantet, A. M., et Baruchel, J., « Perspectives in three-dimensional analysis of bone samples using synchrotron radiation microtomography », Cell Mol Biol, vol. 46, p. 1089–1102, 2000.
  57. [CHAF-00]S. Chaffai, Roberjot, V., Peyrin, F., Berger, G., et Laugier, P., « Frequency dependence of ultrasonic backscattering in cancellous bone: autocorrelation model and experimental results », J Acoust Soc Am, vol. 108, p. 2403–2411, 2000.
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Conference Paper

  1. [HOHW-18b]T. Hohweiller, Ducros, N., Peyrin, F., et Sixou, B., « An ADMM Algorithm for Constrained Material Decomposition in Spectral CT », in EUSIPCO, 2018.
  2. [[HOHW-18a]T. Hohweiller, Ducros, N., Peyrin, F., et Sixou, B., « A constrained Gauss-Newton algorithm for material decomposition in spectral computed tomography », in Biomedical Imaging (ISBI 2018), 2018 IEEE 15th International Symposium on, 2018, p. 336–339.
  3. [Li-2017]T. Li, Sixou, B., Peyrin, F., et Burghardt, A., « Nonconvex mixed TV/Cahn-Hilliard functional for super-resolution/segmentation fo 3D trabecular bone images », in ISBI, 2017.
  4. [ABAS-17]J. F. P. J. Abascal, Ducros, N., Rit, S., Sixou, B., et Peyrin, F., « Nonlinear material decomposition for x-ray spectral imaging using a bregman iterative approach », in Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé (RITS) 2017, 2017.
  5. [DUCR-17]N. Ducros, Pivot, O., Rit, S., Létang, J. M., Abascal, J. F. P. J., Boursier, Y., Dupont, M., Morel, C., et Peyrin, F., « Imagerie X spectrale: décomposition en base de matériaux par calibration polynomiale », in Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé (RITS) 2017, 2017.
  6. [HOHW-17c]T. Hohweiller, Ducros, N., Peyrin, F., et Sixou, B., « A Kullback-Leibler approach for 3D reconstruction of spectral CT data corrupted by Poisson noise », in SPIE Optics + Photonics, San Diego, California. USA, 2017.
    https://hal.archives-ouvertes.fr/view/index/docid/1557381
  7. [ROUS-17a]F. Rousset, Ducros, N., Farina, A., Valentini, G., D'Andrea, C., et Peyrin, F., « Time-resolved wavelet-based acquisitions using a single-pixel camera », in SPIE Photonics West, San Francisco, 2017, p. 1007016-1007016-7.
  8. [ROUS-16a]F. Rousset, Ducros, N., Farina, A., Valentini, G., D'Andrea, C., et Peyrin, F., « Adaptive acquisitions in biomedical optical imaging based on single pixel camera: comparison with compressive sensing », in 2016 IEEE 13th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2016, p. 680-683.
    http://ieeexplore.ieee.org/document/7493358/
  9. [DUCR-16]N. Ducros, Rit, S., Sixou, B., et Peyrin, F., « Non-linear regularized decomposition of spectral x-ray projection images », in Fourth international conference on image formation in X-ray computed tomography, 2016, p. 49-52.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~srit/biblio/ducros2016.pdf
  10. [Li-2016]Y. Li, Toma, A., Sixou, B., et Peyrin, F., « Super-resolution/segmentation of 2D trabecular bone images by a Mumford-Shah approach and comparison to Total Variation », in Eusipco, 2016.
  11. [DONG-15a]P. Dong, Valette, S., Zuluaga, M. A., Kazakia, G. J., et Peyrin, F., « Voronoi-Based Analysis of Bone Cell Network from Synchrotron Radiation Micro-CT Images », in IEEE ISBI, NYC, 2016.
  12. [SIXO-16d]L. Wang, Sixou, B., et Peyrin, F., « Multi-level tomography reconstructions with level-set and TV regulariization  », in Eusipco, 2016.
  13. [ROUS-15c]F. Rousset, Ducros, N., D'Andrea, C., et Peyrin, F., « Single pixel camera: an acquisition strategy based on the non-linear wavelet approximation », in 37th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, 2015, p. 6240–6243.
    https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01217883/document
  14. [LANG-15a]F. Lange, Peyrin, F., et Montcel, B., « Development of a hyperspectral time resolved DOT system for the exploration of the human brain activity », in RITS, Dourdan, France, 2015.
  15. [45676]E. Ong, Vadcard, F., Verdurand, M., Rositi, H., Peyrin, F., Berthezène, Y., Nighoghossian, N., Lerouge, F., Parola, S., Zimmer, L., Wiart, M., et Chauveau, F., « In vivo evaluation of a hybrid nanoparticle for molecular imaging of amyloid aggregation », in European Molecular Imaging Meeting, Tubingen, Germany, 2015.
  16. [ROSI-15]H. Rositi, Desestret, V., Chauveau, F., Cho, T. H., Ong, E., Berner, L. P., Weber, L., Langer, M., Olivier, C., Frindel, C., Nighoghossian, N., Berthezène, Y., Peyrin, F., Rousseau, D., et Wiart, M., « Fast virtual histology of unstained mouse brains using in-line X-ray phase tomography », in European Molecular Imaging Meeting, Tubingen, Germany, 2015.

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