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Conference Paper

  1. [GELA-07a]A. Gelas, Schaerer, J., Bernard, O., Friboulet, D., Clarysse, P., Magnin, I. E., et Prost, R., « Radial Basis Functions Collocation Methods For Model-Based Level-set Segmentation », in IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), San Antonio, TX, USA, 2007, vol. 2, p. 237-240.
  2. [SCHA-07a]J. Schaerer, Gelas, A., Prost, R., Clarysse, P., et Magnin, I. E., « Volumetric Mesh Construction From Scattered Prior Data: Application To Cardiac MR Image Analysis », in European Signal Processing Conference, Poznań, Poland, 2007, p. 438-442.
  3. [VAND-07]J. Vandemeulebroucke, Sarrut, D., et Clarysse, P., « Point-validated Pixel-based Breathing Thorax Model », in International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, 2007, p. 195-199.
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/popi-model
  4. [SCHA-07b]J. Schaerer, Clarysse, P., et Pousin, J., « A New Dynamic Elastic Model for Cardiac Image Analysis », in Proceedings of the 29th Annual International Conference of the IEEE EMBS, Lyon, France, 2007, p. 4488-4491.
  5. [SCHA-06]J. Schaerer, Qian, Z., Clarysse, P., Metaxas, D., Axel, L., et Magnin, I. E., « Fast and automated creation of patient-specific 3D heart model from tagged MRI », in From Statistical Atlases to Personalized Models: Understanding Complex Diseases in Populations and Individuals, Satellite Workshop MICCAI 2006, Copenhagen, Denmark, 2006, p. 91-94.
  6. [DELH-06]B. Delhay, Clarysse, P., Pera, C., et Magnin, I. E., « A spatio-temporal deformation model for dense motion estimation in periodic cardiac image sequences », in From Statistical Atlases to Personalized Models: Understanding Complex Diseases in Populations and Individuals, Satellite Workshop MICCAI 2006, Copenhagen, Denmark, 2006, p. (in-press).
  7. [POUS-05]J. Pousin, Rouchdy, Y., Picq, M., Schaerer, J., et Clarysse, P., « Constrained 3D elastic model for the segmentation in cardiac MRI », in Computers In Cardiology, Lyon, France, 2005, p. 785-788.
  8. [BRUS-05]E. Brusseau, Said, G., et Clarysse, P., « Modèle numérique d'estimation 2D de la déformation des tissus mous biologiques à partir d'images échographiques radiofréquence: Résultats sur simulations numériques et données expérimentales », in GRETSI'05, Louvain-La-Neuve, Belgium, 2005, p. 287-290.
  9. [HADD-05d]R. Haddad, Clarysse, P., Orkisz, M., Revel, D., et Magnin, I. E., « A Realistic Anthropomorphic Dynamic Heart Phantom », in Computers in Cardiology, Lyon, France, 2005, p. 801-804.
  10. [DELH-05]B. Delhay, Lotjonen, J., Clarysse, P., Katila, T., et Magnin, I. E., « A Dynamic 3-D Cardiac Surface Model from MR Images », in Computers In Cardiology, Lyon, France, 2005, p. 423-426.
  11. [HADD-05b]R. Haddad, Clarysse, P., Orkisz, M., Revel, D., et Magnin, I. E., « A realistic anthropomorphic numerical model of the beating heart », in Functional Imaging and Modeling of the Heart, Barcelona, Spain, 2005, p. 384-393.
  12. [GERM-05a]C. Germain, Breton, V., Clarysse, P., Gaudeau, Y., Glatard, T., Jeannot, E., Legré, Y., Loomis, C., Montagnat, J., Moureaux, J. M., Osorio, A., et Texier, R., « Grid-enabling medical image analysis », in Biogrid'05, proceedings of the IEEE/ACM International Symposium on Cluster Computing and the Grid, Cardiff, UK, 2005.
    http://www.cse.uconn.edu/ huang/BioGrid-05/
  13. [DELH-05b]B. Delhay, Clarysse, P., Lotjonen, J., Katila, T., et Magnin, I. E., « Evaluation of two free form deformation based motion estimators in cardiac and chest imaging », in Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH), Barcelona, Spain, 2005, p. 467-476.
  14. [HADD-05a]R. Haddad, Clarysse, P., Orkisz, M., Revel, D., et Magnin, I. E., « Un modèle numérique anthropomorphique du coeur battant », in Forum de Recherche en Génie Biologique et Médical (JSTIM-FRGBM'05), Nancy, France, 2005, vol. 26, p. 77-78.
  15. [SCHA-05]J. Schaerer, Rouchdy, Y., Clarysse, P., Hiba, B., Croisille, P., Pousin, J., et Magnin, I. E., « Simultaneous Segmentation of the Left and Right Heart Ventricles in 3D Cine MR Images of Small Animals », in Computers In Cardiology, Lyon, France, 2005, p. 231-234.
  16. [DELH-04]B. Delhay, Clarysse, P., Bonnet, P., Grangeat, P., et Magnin, I. E., « Combined 3D object motion estimation in medical sequences », in International Conference on Image Processing, Singapore, Singapore, 2004, p. 1461-1464.
  17. [QIU-04]B. Qiu, Clarysse, P., Montagnat, J., Janier, M., et Vray, D., « Comparison of 3D Deformable Models For in vivo Measurements of Mouse Embryo from 3D Ultrasound Images », in IEEE International Ultrasonics Symposium, Montréal, Canada, 2004, p. 748-751.
  18. [POLL-04]M. Pollari, Lotjonen, T., Makela, T., Pauna, N., Reilhac, A., et Clarysse, P., « Evaluation of cardiac PET-MRI registration methods using a numerical breathing phantom », in IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Arlington, Vancouver, USA, 2004, p. 1447-1450.
  19. [MILL-04a]J. Milles, Clarysse, P., Van Susterens, A., Croisille, P., Magnin, I. E., et Arts, T., « Automatic 2D segmentation of the left ventricle in tagged cardia MRI using motion », in IEEE International Symposium on Biomedical Imaging : From Nano to Macro, Arlington, VA, USA, 2004.
  20. [MAKE-03b]T. Makela, Pollari, M., Lotjonen, J., Pauna, N., Reilhac, A., Clarysse, P., Magnin, I. E., et Katila, T., « Evaluation and comparison of surface and intensity based rigid registration methods for thorax and cardiac MR and PET images », in Second International Workshop on Functional Imaging and Modeling of the Heart, Lyon, France, 2003, vol. 2674, p. 224-233.
  21. [PAUN-03]N. Pauna, Croisille, P., Costes, N., Reilhac, A., Makela, T., Cozar, O., Janier, M., et Clarysse, P., « A Strategy to quantitatively evaluate MRI/PET cardiac rigid registration methods using a Monte Carlo simulator », in Proceedings of FIMH'03 (Second International Workshop on functional Imaging and Modeling of the Heart), Lyon, France, 2003, vol. 2674, p. 194-204.
  22. [ZHU-03]Y. M. Zhu, Luo, J. H., Clarysse, P., et Magnin, I. E., « Correction des inhomogénéités d'intensité en IRM », in Conférences F. Lhermitte - 13e Rendez-Vous de l'ARSEP, Paris, France, 2003, p. 35.
  23. [DYDE-02]I. Dydenko, Chehbi, S., Friboulet, D., Clarysse, P., Magnin, I. E., D'hooge, J., et Bijnens, B., « Using an elastic deformable template for the segmentation of ultrasound cardiac radio frequency images based on the velocity information », in IEEE International Ultrasonics Symposium, Munich, Germany, 2002, p. 1706-1709.
  24. [VRAY-02]D. Vray, Discher, A., Le Floc'h, J., Mai, W., Clarysse, P., Pham, Q. C., Montagnat, J., et Janier, M., « 3D quantification of ultrasound images : application to mouse embryo imaging in vivo », in IEEE International Ultrasonics Symposium (UFFC), Munich, Germany, 2002.
  25. [PHAM-01a]Q. C. Pham, Vincent, F., Clarysse, P., Croisille, P., et Magnin, I. E., « Heart segmentation in MRI using a 3D prior biventricular deformable model », in Forum des Jeunes Chercheurs en GBM, Compiègne, France, 2001, p. 70-71.
  26. [MAKE-01a]T. Makela, Clarysse, P., Lotjonen, J., Sipila, O., Lauerma, K., Hanninen, H., Nenonen, J., Knuuti, J., Katila, T., et Magnin, I. E., « A new method for the registration of cardiac PET and MR images using deformable model based segmentation of the main thorax structure », in Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'01), Utrecht, The Netherlands, 2001, p. 557–564.
  27. [MAKE-01b]T. Makela, Pham, Q. C., Clarysse, P., Lotjonen, J., Laeuerma, K., Hanninen, H., Knuuti, J., Katila, T., et Magnin, I. E., « A 3D model-based approach for the PET-functional and MR-anatomical cardiac imaging data fusion », in FIMH'01, Helsinki, Finland, 2001, vol. 2230, p. 83-90.
  28. [CLAR-01b]P. Clarysse, Croisille, P., Bracoud, L., et Magnin, I. E., « Integrated quantitative analysis of tagged magnetic resonance images », in FIMH'01, Helsinki, Finland, 2001, vol. 2230, p. 69-75.
  29. [SARR-01b]D. Sarrut, Miguet, S., Vincent, F., Clarysse, P., Exbrayat, M., Brunie, L., Fleute, M., Desbat, L., et Magnin, I. E., « Requêtes complexes et hybrides dans des bases d'images médicales distantes. Une illustration en imagerie cardiaque », in ASTI'2001, Paris, France, 2001.
  30. [CLAR-01a]P. Clarysse, Lavorel, C., Glière, A., Grangeat, P., et Magnin, I. E., « Un modèle de thorax respirant pour l'évaluation d'algorithmes de reconstruction d'organes en mouvement par tomographie virtuelle », in GRETSI'01, Toulouse, France, 2001.
  31. [PHAM-01b]Q. C. Pham, Vincent, F., Clarysse, P., Croisille, P., et Magnin, I. E., « A FEM-based deformable model for the 3D segmentation and tracking of the heart in cardiac MRI », in Some Congress, Pula, Croatia, 2001, p. 250-254.
  32. [VINC-00b]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., et Magnin, I. E., « Segmentation of the heart from MR image sequences using a 3D active model », in Biomedical Engineering Society Annual Meeting, Seattle, Washington, USA, 2000.
  33. [CLAR-00b]P. Clarysse, Hans, D., Croisille, P., et Magnin, I. E., « Exploratory analysis of the spatio-temporal deformation of the myocardium during systole from tagged MRI », in Biomedical Engineering Society Annual Meeting, Seattle, Washington, USA, 2000.
  34. [VINC-00a]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., et Magnin, I. E., « An elasticity-based model and its application to the estimation of the heart deformation in tagged MRI congres », in IEEE International Conference on Image Processing ICIP'00, Vancouver, Canada, 2000, vol. 1, p. 629–632.
  35. [VINC-99]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., et Magnin, I. E., « Segmentation et suivi de mouvement d'objets déformables par région active », in GRETSI 99, Vannes, France, 1999, p. 163-166.
  36. [BENO-98]H. Benoit-Cattin, Planat, A., Joachimsmann, P., Baskurt, A., Clarysse, P., et Magnin, I. E., « On the coding of active quadtree mesh », in IEEE International Conference on Image Processing ICIP'98, Chicago, Illinois, USA, 1998, vol. 2, p. 895-898.
  37. [HAN-98c]M. Han, Clarysse, P., Croisille, P., Magnin, I. E., et Revel, D., « Computer aided diagnosis of the myocardial ischemia based on a spatio-temporal deformation features analysis », in Computers In Cardiology, Cleveland, Ohio, USA, 1998.
  38. [HAN-98a]M. Han, Clarysse, P., Croisille, P., Magnin, I. E., et Revel, D., « Aide à l'analyse de l'évolution spatio-temporelle de la déformation du myocarde », in 9ème Forum Jeunes Chercheurs GBM, Brest, France, 1998.
  39. [CLAR-97b]P. Clarysse, Friboulet, D., Magnin, I. E., et Revel, D., « Suivi temporel de surfaces déformables - Application à la surface endocardique du VG », in VIème Colloque 'de la recherche à la découverte' section 22 du CNRS, Reims, France, 1997.
  40. [CLAR-97e]P. Clarysse, Reissman, P. J., Lefebvre, S., Baudin, O., et Revel, D., « Region-based segmentation of multislice and multiphase cardiac Magnetic Resonance Images », in World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, Nice, France, 1997, p. 684.
  41. [BOUD-97]A. Boudraa et Clarysse, P., « Fast fuzzy gray level image segmentation method », in World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, Nice, France, 1997, p. 686.
  42. [CLAR-97d]P. Clarysse, Revel, D., et Magnin, I. E., « Segmentation d'images par résonance magnétique multi-phases et multi-coupes du coeur par une approche de régions déformables », in Rencontres Annuelles du Futuroscope 'les Techniques d'Imagerie Cardiovasculaire du Futur', Poitiers, France, 1997.
  43. [CLAR-97c]P. Clarysse, « Traitement d'image et infographie en imagerie du coeur », in Séminaire du LIGIM, Lyon, France, 1997.
  44. [CLAR-96]P. Clarysse, « Recent and Future Trends in Cardiac Image Processing », in IEEE EMBS International Summer School on Biomedical Imaging, Ile de Berder, France, 1996.
  45. [CLAR-95b]P. Clarysse, Jaouen, O., Magnin, I. E., et Morvan, J. M., « Interpolation 3D des parois cardiaques à partir de données discrètes », in Jour. Thématiques GDR TdSI - GRAISHYM : Mouvement 3D d'objets non rigides, Lille, France, 1995, p. 4 pages.
  46. [CLAR-95a]P. Clarysse, Poupon, F., Barbier, B., et Magnin, I. E., « 3D boundary extraction of the left ventricle by a deformable model with a priori information », in IEEE Int. Conf. Image Processing, Washington, USA, 1995, p. 492–495.
  47. [SOTT-95]F. Sottilini, Clarysse, P., Roux, J. P., Revel, D., et Magnin, I. E., « LV myocardial wall motion estimation with tagged cine MRI (SPAMM) », in Computers in Cardiology, Vienna, Austria, 1995, p. 529–532.
  48. [CLAR-94c]P. Clarysse, « Evolution temporelle de la courbure 3D des surfaces des parois cardiaques », in V Colloque'Thérapeutique et médicaments, de la recherche à la découverte', section 22 du CNRS, Montpellier, France, 1994.
  49. [GORC-94b]J. M. Gorce, Friboulet, D., Clarysse, P., et Magnin, I. E., « Three dimensional velocity field estimation of moving cardiac walls », in Computers in Cardiology, Bethesda, USA, 1994, p. 489–492.
  50. [CLAR-94b]P. Clarysse, Jaouen, O., Magnin, I. E., et Morvan, J. M., « 3D representation and deformation analysis of the heart walls from X-ray and MR images », in Computers in Cardiology, Bethesda, USA, 1994, p. 657–660.
  51. [CLAR-94a]P. Clarysse, Friboulet, D., et Magnin, I. E., « Time evolution analysis of differential features on 3D surfaces of the heart walls », in IEEE Medical Imaging Conf., Norfolk, USA, 1994, p. 1807–1811.
  52. [CLAR-93b]P. Clarysse, Friboulet, D., et Magnin, I. E., « Curvature assessment of the heart walls in 3D. Acquisition, segmentation, quantification », in Proc Computers in Cardiology, London, UK, 1993, p. 607–610.
  53. [CLAR-93a]P. Clarysse, Friboulet, D., et Magnin, I. E., « Calcul de la courbure 3D des parois cardiaques en imagerie dynamique », in IVème Colloque 'Thérapeutique et Médicaments, de la recherche à la découverte', Section 22 du Comité National de la Recherche Scientifique, Strasbourg, France, 1993.

Conference Proceedings

  1. [RUMI-17a]G. K. Rumindo, Duchateau, N., Viallon, M., Croisille, P., Ohayon, J., et Clarysse, P., « Generation of a synthetic database of heart models to evaluate strain-based infarct detection algorithms », Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé (RITS). SFGBM, Lyon, France, 2017.
  2. [CLAR-08]P. Clarysse, Metaxas, D., et Pousin, J., « Special Issue of Mathematical Modelling of Natural Phenomena on 'Medical Imaging' », vol. 3. EDP Sciences, Publ, 2008.
  3. [MAGN-03]I. E. Magnin, Montagnat, J., Clarysse, P., Nenonen, J., et Katila, T., « Proceedings of the Second International Workshop on Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH'03), LNCS 2674, 300 pages ». Springer Verlag, Publ, Some City, Some Country, 2003.
  4. [KATI-01]T. Katila, Magnin, I. E., Clarysse, P., Montagnat, J., et Nenonen, J., « Proceedings of the First International Workshop on Functional Imaging and Modeling of the Heart (FIMH'01), LNCS 2432, 158 pages », Lecture Notes in Computer Sciences, LNCS 2432. Springer Verlag, Publ., Some City, Some Country, 2001.

Book Chapter

  1. [BERN-15]O. Bernard, Clarysse, P., Dietenbeck, T., Friboulet, D., Jehan-Besson, S., et Pousin, J., « Extraction and segmentation of structures in image sequences », in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, P. Clarysse et Friboulet, D. Hoboken (USA) - London (UK): Wiley-ISTE, 2015, p. 3-64.
  2. [BERN-15]O. Bernard, Clarysse, P., Dietenbeck, T., Friboulet, D., Jehan-Besson, S., et Pousin, J., « Extraction and segmentation of structures in image sequences », in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, P. Clarysse et Friboulet, D. Hoboken (USA) - London (UK): Wiley-ISTE, 2015, p. 3-64.
  3. [FRIB-15]O. Bernard, Clarysse, P., Dietenbeck, T., Friboulet, D., Jehan-Besson, S., et Pousin, J., « Extraction et segmentation de structures dans des séquences d’images », in Traitement et analyse d'images cardiaques, Paris: Hermès-Lavoisier, 2015, p. 25-82.
  4. [CLAR-15h]P. Clarysse et Croisille, P., « Cardiac motion estimation in tagged MRI », in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, London: Hoboken-Wiley-ISTE, 2015, p. 247-256.
  5. [GIRA-15]P. R. Girard, Clarysse, P., Pujol, R., Wang, L., et Delachartre, P., « Differential Geometry Revisited by Biquaternion Clifford Algebra », in in J.-D. Boissonnat et al. (Eds), Curves and Surfaces, Springer, 2015, p. 216-242.PDF icon Girard-15 draft ICCS Differential Geometry Revisited by Biquaternion.pdf (404.61 KB)
    http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-22804-4_17
  6. [CLAR-15g]P. Clarysse et Pousin, J., « Motion estimation and analysis », in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, London: Hoboken-Wiley-ISTE, 2015, p. 65-102.
  7. [CLAR-14]P. Clarysse et Pousin, J., « Estimation et analyse du mouvement », in Traitement et analyse d'images cardiaques, Paris: Hermes-Lavoisier, 2014, p. 83-116.
  8. [NEYR-14]B. Neyran et Viallon, M., « Analyse, méthodes et post-traitements d’images par RM dynamiques pour la quantification de la perfusion myocardique », in Traitement et analyse des images cardiaques, vol. 2, P. Clarysse et Friboulet, D. Paris: Hermès-Lavoisier, 2014, p. 121-155.
  9. [CLAR-14a]P. Clarysse et Croisille, P., « Estimation de mouvement en IRM marquée », in Traitement et analyse d'images cardiaques, Paris: Hermes-Lavoisier, 2014, p. 249-256.
  10. [BASA-14]M. Alessandrini, Basarab, A., Bernard, O., et Delachartre, P., « Estimation du mouvement du coeur basée sur la phase en imagerie cardiaque multimodalités », in Traitement et analyse des images cardiaques, P. Clarysse et Friboulet, D. Paris: Hermès-Lavoisier, 2014, p. 221-248.
  11. [GIRA-13]P. R. Girard, Pujol, R., Clarysse, P., Marion, A., Goutte, R., et Delachartre, P., « Analytic Video (2D+T) Signals by Clifford Fourier Transforms in Multiquaternion Grassmann-Hamilton-Clifford Algebras », in Quaternion and Clifford Fourier transforms and Wavelets, TIM/Birkhauser., Springer, 2013, p. 350.
    http://www.springer.com/birkhauser/mathematics/book/978-3-0348-0602-2
  12. [GERM-09]C. Germain-Renaud, Breton, V., Clarysse, P., Delhay, B., Gaudeau, Y., Glatard, T., Jeannot, E., Legré, Y., Montagnat, J., Moureaux, J. M., Osorio, A., Pennec, X., Schaerer, J., et Texier, R., « Grid Analysis of Radiological Data », in Handbook of Research on Computational Grid Technologies for Life Sciences, Biomedicine and Healthcare, M. Cannataro IGI, 2009.

Book

  1. [CLAR-15b]P. Clarysse et Friboulet, D., Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis. Hoboken (USA) - London (UK): Wiley-ISTE, 2015, p. 370.
  2. [CLAR-15]P. Clarysse et Friboulet, D., Traitement et analyse d'images cardiaques. Paris: Hermès-Lavoisier, 2015, p. 344.
  3. [CLAR-11b]P. Clarysse, Imagerie dynamique cardiaque et thoracique. Hermes-Lavoisier, 2011, p. 288 pages.

Invited Conference

  1. [CLAR-13]P. Clarysse, « Imagerie cardiaque: de l'image à la quantification globale et régionale de l'anatomie, de la structure et de la fonction ». École STIC'2013, Nouvelles Technologies de l'Information et de la Communication, MONASTIR – TUNISIE, 2013.
    www.ltim.org/EcoleStic2013/
  2. [CLAR-13a]P. Clarysse, Vandroux, C., Bourguignon, C., Spaltenstein, J., Viallon, M., et Croisille, P., « Segmentation tissulaire d'images par RM de réhaussement tardif – Etat de l'art et algorithmes disponibles dans le plugin OsiriX CMRSegTools ». Journée du Groupe de Recherche en Imagerie Cardiaque (GRIC), JFR, Paris, 2013.
  3. [CLAR-12]P. Clarysse et Friboulet, D., « Méthodes de segmentation et modélisation du ventricule gauche en ultrasons et IRM », Journée du Groupe de Recherche en Imagerie Cardiaque (GRIC) : Analyse d'images cardiaques, Journées Françaises de Radiologie. Paris, France, 2012.
  4. [CLAR-12a]P. Clarysse, Glatard, T., et Cervenansky, F., « Simulation d’images pour l’aide à l’évaluation en analyse d’images cardiaques - La plateforme d’imagerie virtuelle VIP », Consortium du projet ANR VIP. Journée GDR STIC-Santé sur l’évaluation de méthodes de segmentation en Imagerie Médicale, Paris, 2012.
  5. [CLAR-10e]P. Clarysse et Croisille, P., « Quantification du mouvement du coeur en IRM ». 1ère journée du Groupe de Recherche en Imagerie Cardiaque (GRIC), Marseille, 2010.
  6. [CLAR-10d]P. Clarysse, « Quantification du mouvement en imagerie cardiaque ». AG GDR STIC-Santé, Villejuif, 2010.
  7. [CLAR-09b]P. Clarysse, « Analyse d’images cardiaques : de l’acquisition à la quantification ». Séminaire ‘Modélisation, simulation et imagerie du myocarde’, organisé le laboratoire MAP5 (Université Paris Descartes) et l’action CardioSense3D de l’INRIA, Paris, 2009.
  8. [CLAR-09a]P. Clarysse, « Analyse d'images médicales et modélisation: de l'acquisition à la quantification », Séminaire du GDR STIC-Santé, Thème F, Modélisation et simulation d'organes. Paris, 2009.
  9. [CLAR-09a]P. Clarysse, « Analyse d’images médicales et modélisation: de l’acquisition à la quantification ». Séminaire du GDR STIC-Santé, Thème F, Modélisation et simulation d'organes (2ème partie), 2009.
  10. [CLAR-09]P. Clarysse, « Analyse d'images cardiaques : de l'acquisition à la quantification », Séminaire Modélisation, simulation et imagerie du myocarde, Laboratoire MAP5 (Université Paris Descartes) et action CardioSense3D (INRIA). Paris, 2009.
  11. [CLAR-08b]P. Clarysse, « Patient specific modeling and analysis of cardiac images », Seminars of the Computer Vision Center, Universitat Autònoma de Barcelona. Barcelona, 2008.
  12. [CLAR-03]P. Clarysse, « Applications en imagerie cardio-vasculaire de la fusion d'images », Journées de Recherche en Imagerie Médicale. Nantes, France, 2003.
  13. [CLAR-97h]P. Clarysse, Revel, D., et Magnin, I. E., « Segmentation d'images par résonance magnétique multi-phases et multi-coupes du coeur par une approche de régions déformable », Rencontres Annuelles du Futuroscope 'les Techniques d'Imagerie Cardiovasculaire du Futur'. Poitiers, France, 1997.

HDR

  1. [CLAR-05]P. Clarysse, « Analyse d'images cardiaques assistée par les modèles ». INSA Lyon / Université Claude-Bernard Lyon I, 2005.
    Axel L. (rap.), Ayache N. (rap.), Herment A. (rap.), Pousin J., Bittoun J., Revel D. et Magnin I.E.

Thesis

  1. [CAST-12]C. Casta, « Estimation 3D conjointe forme/structure/mouvement dans des séquences dynamiques d’images. Application à l’obtention de modèles cardiaques patients spécifiques anatomiques et fonctionnels. », Insa de Lyon, Lyon, 2012.PDF icon PhD.pdf (18.62 MB)
  2. [GREZ-11]L. Grèzes-Besset, « Détection et analyse du mouvement respiratoire à partir d’images fluoroscopiques en radiothérapie », INSA de Lyon, Lyon, 2011.
    Mme Jocelyne Troccaz Directeur de Recherche CNRS Rapporteur M. Jean-Yves Boire Professeur des Universités Rapporteur Mme Catherine Mennessier Enseignant Chercheur Examinatrice M. Albert Lisbona Physicien Médical Examinateur M. Patrick Clarysse Directeur de Recherche CNRS Directeur de thèse M. David Sarrut Chargé de Recherche CNRS Co-Directeur de thèse M. Loïc Dibout Ingénieur d’Application Elekta SAS Invité
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/LouiseGrezesBesset_PHD_2011.pdf
  3. [VAND-10]J. Vandemeulebroucke, « Lung Motion Modelling and Estimation for Image Guided Radiation Therapy », INSA de Lyon, 2010.
    David Hawkes Professeur, UCL, Londres Rapporteur Dirk Vandermeulen Professeur, KUL, Louvain Rapporteur Grégoire Malandain Directeur de Recherche, INRIA Examinateur Denis Friboulet Professeur, INSA, Lyon Examinateur Jan Kybic Chargé de Recherche, CVUT, Prague Co-directeur de thèse David Sarrut Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse Patrick Clarysse Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse
    http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut/phd/JefVandemeulebroucke_PHD_2010.pdf

Miscellaneous

  1. [GIBA-12]B. Gibaud, Forestier, G., Benoit-Cattin, H., Cervenansky, F., Clarysse, P., Friboulet, D., Gaignard, A., Hugonnard, P., Lartizien, C., Liebgott, H., Montagnat, J., Tabary, J., et Glatard, T., « Design of an ontology for the annotation of object models used for medical image simulation ». Lyon, 2012.
  2. [GLAT-09c]T. Glatard, Camarasu-Pop, S., Benoit-Cattin, H., Clarysse, P., Montagnat, J., Moscicki, J., Olabarriaga, S., et Sarrut, D., « Integrating pilot-jobs, workflows and virtual resource browser to foster medical image analysis on EGEE ». Catania, Italie, 2009.
  3. [SARR-01]M. Sarreau, Miguet, S., Vincent, F., Clarysse, P., Exbrayat, M., Brunie, L., Fleute, M., Desbat, L., et Magnin, I. E., « Requêtes complexes et hybrides dans des bases d'images médicales distantes. Une illustration en imagerie cardiaque ». 2001.
  4. [CLAR-00c]P. Clarysse, Hans, D., Croisille, P., et Magnin, I. E., « Exploratory analysis of the spatio-temporal deformation of the myocardium during systole from tagged MRI ». 2000.
  5. [VINC-00c]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., et Magnin, I. E., « Segmentation of the heart from MR image sequences using a 3D active model ». 2000.
  6. [CLAR-97g]P. Clarysse, « Traitement d'image et infographie en imagerie du coeur ». 1997.
  7. [CLAR-97f]P. Clarysse, Friboulet, D., Magnin, I. E., et Revel, D., « Suivi temporel de surfaces déformables - Application à la surface endocardique du VG ». 1997.
  8. [CLAR-96b]P. Clarysse, « Recent and Future Trends in Cardiac Image Processing ». 1996.
  9. [CLAR-94d]P. Clarysse, « Evolution temporelle de la courbure 3D des surfaces des parois cardiaques ». 1994.

Patent

  1. [Dela-13]P. Delachartre, Basarab A.,, Clarysse, P., et Croisille, P., « Procede d'estimation du mouvement dans une sequence d'images dynamiques », 2013.

Magazine Article

  1. [CLAR-12a]P. Clarysse et Pousin, J., « Méthodes mathématiques pour l’analyse d’images médicales », ALS Magazine - Académie Lorraine des Sciences, p. 28-34, 2012.

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