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Conference Paper

  1. [HADD-07]R. Haddad, Magnin, I. E., et Clarysse, P., « A new fully-digital anthropomorphic and dynamic thorax/heart model », in Proceedings of the 29th Annual International Conference of the IEEE EMBS, Lyon, France, 2007, p. 5999-6002.
  2. [ROUC-07a]Y. Rouchdy, Pousin, J., Schaerer, J., et Clarysse, P., « A hyperelastic deformable template for cardiac segmentation in MRI », in Functional Imaging and Modeling of the Heart, Salt Lake City, UT, USA, 2007, vol. LNCS 4466, p. 443-452.
  3. [VAND-07]J. Vandemeulebroucke, Sarrut, D., et Clarysse, P., « Point-validated Pixel-based Breathing Thorax Model », in International Conference on the Use of Computers in Radiation Therapy (ICCR), Toronto, Canada, 2007, p. 195-199.
  4. [DELH-06]B. Delhay, Clarysse, P., Pera, C., et Magnin, I. E., « A spatio-temporal deformation model for dense motion estimation in periodic cardiac image sequences », in From Statistical Atlases to Personalized Models: Understanding Complex Diseases in Populations and Individuals, Satellite Workshop MICCAI 2006, Copenhagen, Denmark, 2006, p. (in-press).
  5. [SCHA-06]J. Schaerer, Qian, Z., Clarysse, P., Metaxas, D., Axel, L., et Magnin, I. E., « Fast and automated creation of patient-specific 3D heart model from tagged MRI », in From Statistical Atlases to Personalized Models: Understanding Complex Diseases in Populations and Individuals, Satellite Workshop MICCAI 2006, Copenhagen, Denmark, 2006, p. 91-94.
  6. [HADD-05a]R. Haddad, Clarysse, P., Orkisz, M., Revel, D., et Magnin, I. E., « Un modèle numérique anthropomorphique du coeur battant », in Forum de Recherche en Génie Biologique et Médical (JSTIM-FRGBM'05), Nancy, France, 2005, vol. 26, p. 77-78.
  7. [HADD-05b]R. Haddad, Clarysse, P., Orkisz, M., Revel, D., et Magnin, I. E., « A realistic anthropomorphic numerical model of the beating heart », in Functional Imaging and Modeling of the Heart, Barcelona, Spain, 2005, p. 384-393.
  8. [GERM-05a]C. Germain, Breton, V., Clarysse, P., Gaudeau, Y., Glatard, T., Jeannot, E., Legré, Y., Loomis, C., Montagnat, J., Moureaux, J. M., Osorio, A., et Texier, R., « Grid-enabling medical image analysis », in Biogrid'05, proceedings of the IEEE/ACM International Symposium on Cluster Computing and the Grid, Cardiff, UK, 2005.
  9. [DELH-04]B. Delhay, Clarysse, P., Bonnet, P., Grangeat, P., et Magnin, I. E., « Combined 3D object motion estimation in medical sequences », in International Conference on Image Processing, Singapore, Singapore, 2004, p. 1461-1464.
  10. [MILL-04a]J. Milles, Clarysse, P., Van Susterens, A., Croisille, P., Magnin, I. E., et Arts, T., « Automatic 2D segmentation of the left ventricle in tagged cardia MRI using motion », in IEEE International Symposium on Biomedical Imaging : From Nano to Macro, Arlington, VA, USA, 2004.
  11. [POLL-04]M. Pollari, Lotjonen, T., Makela, T., Pauna, N., Reilhac, A., et Clarysse, P., « Evaluation of cardiac PET-MRI registration methods using a numerical breathing phantom », in IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Arlington, Vancouver, USA, 2004, p. 1447-1450.
  12. [ZHU-03]Y. M. Zhu, Luo, J. H., Clarysse, P., et Magnin, I. E., « Correction des inhomogénéités d'intensité en IRM », in Conférences F. Lhermitte - 13e Rendez-Vous de l'ARSEP, Paris, France, 2003, p. 35.
  13. [PAUN-03]N. Pauna, Croisille, P., Costes, N., Reilhac, A., Makela, T., Cozar, O., Janier, M., et Clarysse, P., « A Strategy to quantitatively evaluate MRI/PET cardiac rigid registration methods using a Monte Carlo simulator », in Proceedings of FIMH'03 (Second International Workshop on functional Imaging and Modeling of the Heart), Lyon, France, 2003, vol. 2674, p. 194-204.
  14. [VINC-00a]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., et Magnin, I. E., « An elasticity-based model and its application to the estimation of the heart deformation in tagged MRI congres », in IEEE International Conference on Image Processing ICIP'00, Vancouver, Canada, 2000, vol. 1, p. 629–632.
  15. [VINC-00b]F. Vincent, Clarysse, P., Croisille, P., et Magnin, I. E., « Segmentation of the heart from MR image sequences using a 3D active model », in Biomedical Engineering Society Annual Meeting, Seattle, Washington, USA, 2000.
  16. [BENO-98]H. Benoit-Cattin, Planat, A., Joachimsmann, P., Baskurt, A., Clarysse, P., et Magnin, I. E., « On the coding of active quadtree mesh », in IEEE International Conference on Image Processing ICIP'98, Chicago, Illinois, USA, 1998, vol. 2, p. 895-898.
  17. [CLAR-97b]P. Clarysse, Friboulet, D., Magnin, I. E., et Revel, D., « Suivi temporel de surfaces déformables - Application à la surface endocardique du VG », in VIème Colloque 'de la recherche à la découverte' section 22 du CNRS, Reims, France, 1997.
  18. [CLAR-97d]P. Clarysse, Revel, D., et Magnin, I. E., « Segmentation d'images par résonance magnétique multi-phases et multi-coupes du coeur par une approche de régions déformables », in Rencontres Annuelles du Futuroscope 'les Techniques d'Imagerie Cardiovasculaire du Futur', Poitiers, France, 1997.
  19. [BOUD-97]A. Boudraa et Clarysse, P., « Fast fuzzy gray level image segmentation method », in World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, Nice, France, 1997, p. 686.
  20. [CLAR-96]P. Clarysse, « Recent and Future Trends in Cardiac Image Processing », in IEEE EMBS International Summer School on Biomedical Imaging, Ile de Berder, France, 1996.
  21. [CLAR-95b]P. Clarysse, Jaouen, O., Magnin, I. E., et Morvan, J. M., « Interpolation 3D des parois cardiaques à partir de données discrètes », in Jour. Thématiques GDR TdSI - GRAISHYM : Mouvement 3D d'objets non rigides, Lille, France, 1995, p. 4 pages.
  22. [CLAR-94c]P. Clarysse, « Evolution temporelle de la courbure 3D des surfaces des parois cardiaques », in V Colloque'Thérapeutique et médicaments, de la recherche à la découverte', section 22 du CNRS, Montpellier, France, 1994.
  23. [CLAR-93a]P. Clarysse, Friboulet, D., et Magnin, I. E., « Calcul de la courbure 3D des parois cardiaques en imagerie dynamique », in IVème Colloque 'Thérapeutique et Médicaments, de la recherche à la découverte', Section 22 du Comité National de la Recherche Scientifique, Strasbourg, France, 1993.

Book Chapter

  1. [CLAR-15g]P. Clarysse et Pousin, J., « Motion estimation and analysis », in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, London: Hoboken-Wiley-ISTE, 2015, p. 65-102.
  2. [BERN-15]O. Bernard, Clarysse, P., Dietenbeck, T., Friboulet, D., Jehan-Besson, S., et Pousin, J., « Extraction and segmentation of structures in image sequences », in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, P. Clarysse et Friboulet, D. Hoboken (USA) - London (UK): Wiley-ISTE, 2015, p. 3-64.
  3. [BERN-15]O. Bernard, Clarysse, P., Dietenbeck, T., Friboulet, D., Jehan-Besson, S., et Pousin, J., « Extraction and segmentation of structures in image sequences », in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, P. Clarysse et Friboulet, D. Hoboken (USA) - London (UK): Wiley-ISTE, 2015, p. 3-64.
  4. [CLAR-15h]P. Clarysse et Croisille, P., « Cardiac motion estimation in tagged MRI », in Multi-modality Cardiac Imaging: Processing and Analysis, London: Hoboken-Wiley-ISTE, 2015, p. 247-256.
  5. [CLAR-14]P. Clarysse et Pousin, J., « Estimation et analyse du mouvement », in Traitement et analyse d'images cardiaques, Paris: Hermes-Lavoisier, 2014, p. 83-116.
  6. [CLAR-14a]P. Clarysse et Croisille, P., « Estimation de mouvement en IRM marquée », in Traitement et analyse d'images cardiaques, Paris: Hermes-Lavoisier, 2014, p. 249-256.

Invited Conference

  1. [CLAR-13]P. Clarysse, « Imagerie cardiaque: de l'image à la quantification globale et régionale de l'anatomie, de la structure et de la fonction ». École STIC'2013, Nouvelles Technologies de l'Information et de la Communication, MONASTIR – TUNISIE, 2013.
  2. [CLAR-12]P. Clarysse et Friboulet, D., « Méthodes de segmentation et modélisation du ventricule gauche en ultrasons et IRM », Journée du Groupe de Recherche en Imagerie Cardiaque (GRIC) : Analyse d'images cardiaques, Journées Françaises de Radiologie. Paris, France, 2012.
  3. [CLAR-12a]P. Clarysse, Glatard, T., et Cervenansky, F., « Simulation d’images pour l’aide à l’évaluation en analyse d’images cardiaques - La plateforme d’imagerie virtuelle VIP », Consortium du projet ANR VIP. Journée GDR STIC-Santé sur l’évaluation de méthodes de segmentation en Imagerie Médicale, Paris, 2012.
  4. [CLAR-10e]P. Clarysse et Croisille, P., « Quantification du mouvement du coeur en IRM ». 1ère journée du Groupe de Recherche en Imagerie Cardiaque (GRIC), Marseille, 2010.
  5. [CLAR-09]P. Clarysse, « Analyse d'images cardiaques : de l'acquisition à la quantification », Séminaire Modélisation, simulation et imagerie du myocarde, Laboratoire MAP5 (Université Paris Descartes) et action CardioSense3D (INRIA). Paris, 2009.
  6. [CLAR-09a]P. Clarysse, « Analyse d'images médicales et modélisation: de l'acquisition à la quantification », Séminaire du GDR STIC-Santé, Thème F, Modélisation et simulation d'organes. Paris, 2009.
  7. [CLAR-09a]P. Clarysse, « Analyse d’images médicales et modélisation: de l’acquisition à la quantification ». Séminaire du GDR STIC-Santé, Thème F, Modélisation et simulation d'organes (2ème partie), 2009.
  8. [CLAR-09b]P. Clarysse, « Analyse d’images cardiaques : de l’acquisition à la quantification ». Séminaire ‘Modélisation, simulation et imagerie du myocarde’, organisé le laboratoire MAP5 (Université Paris Descartes) et l’action CardioSense3D de l’INRIA, Paris, 2009.
  9. [CLAR-08b]P. Clarysse, « Patient specific modeling and analysis of cardiac images », Seminars of the Computer Vision Center, Universitat Autònoma de Barcelona. Barcelona, 2008.
  10. [CLAR-03]P. Clarysse, « Applications en imagerie cardio-vasculaire de la fusion d'images », Journées de Recherche en Imagerie Médicale. Nantes, France, 2003.
  11. [CLAR-97h]P. Clarysse, Revel, D., et Magnin, I. E., « Segmentation d'images par résonance magnétique multi-phases et multi-coupes du coeur par une approche de régions déformable », Rencontres Annuelles du Futuroscope 'les Techniques d'Imagerie Cardiovasculaire du Futur'. Poitiers, France, 1997.

HDR

  1. [CLAR-05]P. Clarysse, « Analyse d'images cardiaques assistée par les modèles ». INSA Lyon / Université Claude-Bernard Lyon I, 2005.
    Axel L. (rap.), Ayache N. (rap.), Herment A. (rap.), Pousin J., Bittoun J., Revel D. et Magnin I.E.

Thesis

  1. [GREZ-11]L. Grèzes-Besset, « Détection et analyse du mouvement respiratoire à partir d’images fluoroscopiques en radiothérapie », INSA de Lyon, Lyon, 2011.
    Mme Jocelyne Troccaz Directeur de Recherche CNRS Rapporteur M. Jean-Yves Boire Professeur des Universités Rapporteur Mme Catherine Mennessier Enseignant Chercheur Examinatrice M. Albert Lisbona Physicien Médical Examinateur M. Patrick Clarysse Directeur de Recherche CNRS Directeur de thèse M. David Sarrut Chargé de Recherche CNRS Co-Directeur de thèse M. Loïc Dibout Ingénieur d’Application Elekta SAS Invité
  2. [VAND-10]J. Vandemeulebroucke, « Lung Motion Modelling and Estimation for Image Guided Radiation Therapy », INSA de Lyon, 2010.
    David Hawkes Professeur, UCL, Londres Rapporteur Dirk Vandermeulen Professeur, KUL, Louvain Rapporteur Grégoire Malandain Directeur de Recherche, INRIA Examinateur Denis Friboulet Professeur, INSA, Lyon Examinateur Jan Kybic Chargé de Recherche, CVUT, Prague Co-directeur de thèse David Sarrut Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse Patrick Clarysse Chargé de Recherche, CNRS Co-directeur de thèse

Miscellaneous

Magazine Article

  1. [CLAR-12a]P. Clarysse et Pousin, J., « Méthodes mathématiques pour l’analyse d’images médicales », ALS Magazine - Académie Lorraine des Sciences, p. 28-34, 2012.

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