CDD 1 an pour ingénieur débutant à partir de SEPT 2014: Développement d’outils logiciels pour la construction et le traitement d’une base d’images IRM et US

Mission

Le candidat se verra confier la construction de la base de données IRM/US, qui implique de:

1. concevoir un protocole de transfert des données échographiques et IRM des consoles d’acquisition vers la console de recalage des données (plateforme Koelis).
2. développer les outils logiciels associés pour lire les données et vérifier la compatibilité avec le logiciel (champs DICOM..)
3. tester et valider la chaine de recalage IRM/US
4. évaluer la qualité du recalage
5. dresser un état de l’art des méthodes de segmentation automatique la prostate et évaluer les algorithmes disponibles
6. concevoir une procédure standardisée pour l’annotation des données et la mise en correspondance avec la vérité histologique
7. extraire les caractéristiques discriminantes des images échographiques et IRM recalées.
8. documenter les développements réalisés et participer à la formation des utilisateurs

Activités principales

Nous recherchons un candidat qui puisse

1. concevoir et programmer de nouveaux outils logiciels (protocole de transfert),
2. prendre et main et adapter des outils logiciels existants (console Koelis, segmentation, outils d’extraction et de classification (CAD))
3. s’impliquer dans la démarche scientifique de test et validation expérimentale, par exemple en réalisant des examens IRM et échographiques sur des objets test.
4. suivre les séances d’annotation des images avec les médecins
5. participer aux études sur l’évaluation des performances des systèmes CAD en cours de développement

Compétences

• Programmation, de préférence Matlab
• Connaissances en Mathématiques & Statistiques
• Connaissances en Mesures Physiques
• Esprit scientifique : curiosité, créativité, et rigueur
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Le poste est idéal pour un/une ingénieur Génie Informatique souhaitant s’orienter vers le domaine médical, ou, pour un/une ingénieur de Génie Biomédical avec de solides compétences en développement informatique. Les candidatures d’ingénieurs de formation Bio-Statistiques et/ou Traitement d’Images seront également examinées avec intérêt.

Les échanges avec les médecins et scientifiques étant éminemment importants, le goût pour le travail d’équipe et la communication sont vivement appréciés.