Microarchitecture 3D du tissu cardiaque

  • Participants

I. Mirea (doctorante), F. Varray, Y.-M. Zhu, L. Fanton, I.E. Magnin

  • Collaborations nationales et internationales

Creatis, équipes 1,3 et 4 (F. Peyrin, M. Langer).

Metislab, Harbin (W.Y. Liu, Y.L.  Zhang, S.L. Wang (doctorant)).

  • Question

Quelle est l’organisation spatiale 3D des différents constituants du tissu cardiaque humain aux échelles cellulaire et tissulaire ?

  • Objectif

Accéder à la micro-architecture des constituants du tissu cardiaque de l’échelle cellulaire (micromètre) à celle de l’organe (centimètre).

  • Méthode
  1. Extraire des échantillons de tissus pariétal de cœur humain frais (ventricule gauche).
  2. Imager les échantillons prélevés via l’acquisition de 2500 projections RX Synchrotron, en contraste de phase et les reconstruire en 3D (80 Gb chacun) à une résolution micrométrique.
  3. Traiter les volumes reconstruits (segmentation multi-échelles).
  4. Analyser les volumes segmentés pour quantifier les paramètres de la microstructure 3D et accéder à l’agencement des composants du tissu.
  5. Définir de nouveaux bio-marqueurs.
  • Résultats et illustrations

  • Soutiens financiers

METISLAB (LIA CNRS-Inserm); Labex PRIMES ; INSA Lyon ; CREATIS ; HIT Harbin.

  • Références bibliographiques

F. Varray, Mirea, I., Langer, M., Peyrin, F., Fanton, L., and Magnin, I. E., « Extraction of the 3D Local Orientation of Myocytes in Human Cardiac Tissue Using X-ray Phase-Contrast Micro-Tomography and Multi-Scale Analysis », Medical Image Analysis (38) p. 117-132, 2017, (IF = 4, 56).

I.Mirea, L.Wang, F. Varray, YM Zhu, E.E Davila-Serrano, I.E. Magnin, “Statistical Analysis of Transmural Laminar Microarchitecture of the Human Left Ventricle”, ICSP, Chengdu, 2016, pp 53-56.

 I. Mirea, F. Varray, Y. M. Zhu, L. Fanton, M. Langer, P. Jouk, G. Michalowicz, Y. Usson, and I. E. Magnin "Very High-Resolution Imaging of Post-Mortem Human Cardiac Tissue using X-ray Phase Contrast Tomography", FIMH'15, Maastricht, LNCS 9126, pp. 172-179, 2015.

F. Varray, L. H. Wang, L. Fanton, Y. M. Zhu, and I. E. Magnin,  "High resolution extraction of local human cardiac fibre orientations", FIMH’13, London, LNCS 7945, pp. 150-157, 2013.

  • PI (Propriété intellectuelle)

Les données acquises à l’ESRF sont dans le domaine public après 3 ans.

 

Retour OBJECTIFS