- Participants
I. Mirea (doctorante), F. Varray, Y.-M. Zhu, L. Fanton, I.E. Magnin
- Collaborations nationales et internationales
Creatis, équipes 1,3 et 4 (F. Peyrin, M. Langer).
Metislab, Harbin (W.Y. Liu, Y.L. Zhang, S.L. Wang (doctorant)).
- Question
Quelle est l’organisation spatiale 3D des différents constituants du tissu cardiaque humain aux échelles cellulaire et tissulaire ?
- Objectif
Accéder à la micro-architecture des constituants du tissu cardiaque de l’échelle cellulaire (micromètre) à celle de l’organe (centimètre).
- Méthode
- Extraire des échantillons de tissus pariétal de cœur humain frais (ventricule gauche).
- Imager les échantillons prélevés via l’acquisition de 2500 projections RX Synchrotron, en contraste de phase et les reconstruire en 3D (80 Gb chacun) à une résolution micrométrique.
- Traiter les volumes reconstruits (segmentation multi-échelles).
- Analyser les volumes segmentés pour quantifier les paramètres de la microstructure 3D et accéder à l’agencement des composants du tissu.
- Définir de nouveaux bio-marqueurs.
- Résultats et illustrations
- Soutiens financiers
METISLAB (LIA CNRS-Inserm); Labex PRIMES ; INSA Lyon ; CREATIS ; HIT Harbin.
- Références bibliographiques
F. Varray, Mirea, I., Langer, M., Peyrin, F., Fanton, L., and Magnin, I. E., « Extraction of the 3D Local Orientation of Myocytes in Human Cardiac Tissue Using X-ray Phase-Contrast Micro-Tomography and Multi-Scale Analysis », Medical Image Analysis (38) p. 117-132, 2017, (IF = 4, 56).
I.Mirea, L.Wang, F. Varray, YM Zhu, E.E Davila-Serrano, I.E. Magnin, “Statistical Analysis of Transmural Laminar Microarchitecture of the Human Left Ventricle”, ICSP, Chengdu, 2016, pp 53-56.
I. Mirea, F. Varray, Y. M. Zhu, L. Fanton, M. Langer, P. Jouk, G. Michalowicz, Y. Usson, and I. E. Magnin "Very High-Resolution Imaging of Post-Mortem Human Cardiac Tissue using X-ray Phase Contrast Tomography", FIMH'15, Maastricht, LNCS 9126, pp. 172-179, 2015.
F. Varray, L. H. Wang, L. Fanton, Y. M. Zhu, and I. E. Magnin, "High resolution extraction of local human cardiac fibre orientations", FIMH’13, London, LNCS 7945, pp. 150-157, 2013.
- PI (Propriété intellectuelle)
Les données acquises à l’ESRF sont dans le domaine public après 3 ans.