Présentations et séminaires à CREATIS

Date Titre Lieu / Résumé
10/03/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Quelques exemples de post-traitement de maillages cardiaques avec VTK par Nicolas Duchateau.

Intégration continue : retour d'expérience suite à la mise en place d'un dashboard CDash s'assurant de la compilation multiplateforme et du passage d'une batterie de tests par Claire Mouto

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14/02/2017 - 08:45 Assemblée Générale du Laboratoire CREATIS

8h45 : Accueil

9h15-10h15 : Informations unités

-Informations générales (O. BEUF) (15’+15’)

-Présentation du budget exécuté 2016 et prévisionnel 2017 (S. VIGNON) (10’+5’)

- Règles et procédures (S. VIGNON) (10’+5’)

10h15-11h15 : Profils et projets de recherche des chercheurs et enseignants chercheurs recrutés en 2016

- Nicolas DUCHATEAU : Traitement d’images multi-modalités/dimensionnelles et modélisation (15’+5’)

10/02/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Une introduction à Docker par Sorina Pop.

Cas d'utilisation de Docker par Geoffroy Berret.

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27/01/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Tester la compilation de vos logiciels facilement avec Travis : l'exemple de vv par Thomas Baudier.

Système de Trig respiratoire sur une base Arduino : le temps réel à la rescousse de vos manips par Denis Grenier.

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13/01/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Using Python from Matlab par Simon Rit.

Finite-element modelling of the left ventricle using Abaqus and object-oriented programming in Matlab par Kenny Rumindo.

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16/12/2016 - 14:00 Fourier-based reconstruction of ultrafast sectorial images in ultrasound

Résumé :Three-dimensional echocardiography is one of the most widely used modality in real time heart imaging thanks to its noninvasive and low cost. However, the real-time property is limited because of the limited speed of sound. To increase the frame rate, plane wave and diverging wave in transmission have been proposed to drastically reduce the number of transmissions to reconstruct one image. In this thesis, starting with the 2D plane wave imaging methods, the reconstruction of 2D/3D echocardiographic sequences in Fourier domain using diverging waves is addressed.

09/12/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Modern C++, including news from C++14 ("auto" keyword, range based loop, etc.) par David Sarrut.

C++ HTML5 - le meilleur des deux mondes… / C++ HTML5 - the best of both worlds… par Bertrand David.

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07/12/2016 - 14:00 Nouveaux matériaux pour la conception de fantôme anthropomorphique pour la détection et la biopsie du cancer du sein
02/12/2016 - 13:30 Classification non supervisée de données spatio-temporelles multidimensionnelles. Applications à l'imagerie.

Avec l'augmentation considérable d'acquisitions de données temporelles dans les dernières décennies comme les systèmes GPS, les séquences vidéos ou les suivis médicaux de pathologies ; le besoin en algorithmes de traitement et d'analyse efficaces d'acquisition longitudinales n'a fait qu'augmenter. Dans cette thèse, nous proposons une extension du formalisme "mean-shift", classiquement utilisé en traitement d'images, pour le groupement de séries temporelles multidimensionnelles.

29/11/2016 - 15:30 MEMS-Based Transducers (CMUT) and Integrated Electronics for Medical Ultrasound Imaging
29/11/2016 - 15:00 Delay Multiply And Sum non-linear beamforming in ultrasound medical imaging
29/11/2016 - 10:00 Optimisation et pilotage de sondes parcimonieuses 2D pour l’imagerie ultrasonore 3D temps-réel

Résumé : "Aujourd’hui l’utilisation de l’échographie 3D en cardiologie est limitée car l’imagerie de la totalité du myocarde sur un cycle cardiaque, sans apnée, reste un défi technologique. Une solution consiste à réduire le nombre de capteurs dans les sondes échographiques matricielles afin d'alléger le procédé d’acquisition: ces sondes sont dites parcimonieuses.

28/11/2016 - 14:00 Soutenance de Thèse : Imagerie endoluminale multimodale IRM-optique pour la caractérisation et la stadification in vivo des anomalies tissulaires colorectales

Composition du jury :

M. Olivier BEUF, Directeur de Recherche, CREATIS CNRS UMR 5220 INSERM U1206

M. Walter BLONDEL, Professeur des Universités, Université de Lorraine

M. Jean-Marie BONNY, Directeur de Recherche, INRA de Clermont-Ferrand- U370 QUAPA

Mme Marine HUGONNARD, Maître de Conférences, VetAgro Sup

Mme Driffa MOUSSATA, Professeur des Universités, Praticien Hospitalier Université de Tours

M. Franck PILLEUL, Praticien Hospitalier, Centre Léon Bérard, Lyon

25/11/2016 - 10:00 Fast centerline detection and segmentation algorithm for anatomical tree structures

Kristı́na Lidayová is currently pursuing the Ph.D. at Uppsala University, Sweden. She received her BS degree in computer science and MS degree in mathematics from Comenius University, Bratislava, Slovakia in 2009 and 2012, respectively. Her current research interests include medical image analysis and segmentation.

Summary of the presentation :

18/11/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Utilisation du cluster à CREATIS par Eduardo Davila.

Gérer votre projet avec Redmine par Claire Mouton.

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17/11/2016 - 14:15 Soutenance de Thèse: Parcimonie structurée anisotrope pour l'estimation non paramétrique

Composition du Jury :

M.CARRE Philippe Professeur des Universités Rapporteur

M. CHAINAIS Pierre Maître de Conférences HDR Rapporteur

M. VAN DE VILLE Dimitri Professeur des Universités Examinateur

MME PERRIER Valérie Professeur des Universités Examinateur

M. FERRATY Frédéric Professeur des Universités Examinateur

M. NAVARRO Laurent Maître de Conférences Examinateur

MME CLAUSEL Marianne  Maître de Conférences Examinateur

M. DELACHARTRE Philippe Professeur des Universités Directeur de Thèse

15/11/2016 - 14:00 Atelier Git

Que vous travailliez sur un article ou sur le code d'un logiciel, seul ou avec des collaborateurs, un gestionnaire de versions tel que Git peut vous être très utile! Vous pouvez ainsi conserver un historique et facilement vous synchroniser avec d'autres contributeurs.

C'est pourquoi je vous convie à une initiation à Git le mardi 15 novembre de 14h à 16h. Vous pourrez venir y pratiquer les commandes de base (clone, add, commit, pull, push, status, log, help), seul puis à plusieurs.

07/11/2016 - 09:00 Passeport Informatique - 7 et 8 novembre

Le Passeport Informatique vise à donner à chaque membre CREATIS, ancien ou nouveau, les clés informatiques pour la vie et le travail au laboratoire. 2 matinées de 9h à 12h les 7 et 8 novembre 2016.

https://intranet.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/PasseportInformatique

04/11/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

La ligne de commande sous linux : quelques principes et des exemples simples par Fabrice Bellet.

Retour d'expérience : "_\{(.*)(?=\})\}" ou comment les expressions régulières facilitent la vie, démonstration via des exemples pratiques par Sami Qorchi.

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24/10/2016 - 14:00 «Correction of scattered radiation in multi-energy radiography and tomography»

L’imagerie à rayons X couplée aux détecteurs résolus en énergie permet de différencier les matériaux présents et d’estimer leurs contributions respectives. Cependant, ces techniques nécessitent des images très précises. La présence du rayonnement diffusé conduit à une perte du contraste spatial et un biais dans l’imagerie radiographique ainsi que des artefacts dans la tomodensitométrie (TDM). L’objectif principal de cette thèse était de développer une approche de correction du rayonnement diffusé adaptée à l’imagerie multi-énergies.

19/10/2016 - 10:00 MRI coils of the Future
11/10/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Reprise du CLUB des Développeurs. Venez exprimer vos attentes et vos propositions de contenu pour l'année à venir!

Gérer votre projet avec Redmine par Claire Mouton.

Utilisation du cluster à CREATIS par Eduardo Dávila.

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04/10/2016 - 14:00 Détection et caractérisation du cancer de la prostate par images IRM 1.5T multiparamétriques

Composition du jury :

Monsieur Olivier BASSET, Professeur des Universités - Université Claude Bernard Lyon 1

Monsieur Nacim BETROUNI, Chargé de Recherche - INSERM U 1189 (Rapporteur)

Monsieur Bruno GAS, Professeur des Universités - Université Pierre et Marie Curie, Paris (Rapporteur)

Monsieur Rémi FLAMARY, Maître de Conférences - Université de Nice Sophia Antipolis

Madame Carole LARTIZIEN-MENIERE, Chargée de Recherche HDR - CNRS UMR5220                ( Co-Directrice)

30/09/2016 - 10:00 Iterative tomographic X-ray phase reconstruction.

Titre :

Iterative tomographic X-ray phase reconstruction.

Date et heure :

Vendredi 30 Septembre 2016 à 10h00

Lieu :

Salle René CHAR, La Rotonde, INSA Lyon

Jury :

- BLEUET Pierre, HDR, CEA Leti (rapporteur)

28/09/2016 - 14:00 Proton Computed tomography

Titre :

Proton Computed tomography

Date et heure :

Mercredi 28 Septembre 2016 à 14h00

Lieu :

Salle René CHAR, La Rotonde, INSA Lyon

Jury :

- M. ROYLE Gary, Professeur des Universités, University College London (rapporteur)

23/09/2016 - 14:00 Computer aided diagnosis of epilepsy lesions based on multivariate and multimodality data analysis

Titre :

Computer aided diagnosis of epilepsy lesions based on multivariate and multimodality data analysis

Date et heure :

Vendredi 23 Septembre 2016 à 14h00

Lieu :

Amphithéâtre Claude CHAPPE, INSA Lyon

Jury :

21/09/2016 - 13:30 Imagerie médicale optique du métabolisme cérébral sain ou pathologique

Composition du jury

Monsieur Walter BLONDEL, Professeur des Universités ; Université de Lorraine

Monsieur Jacques DEROUARD, Professeur des Universités ; Université Grenoble 1

Monsieur Jean-Marc DINTEN, Ingénieur CEA ; CEA Grenoble 

Monsieur Sylvain GIOUX, Professeur des Universités ; Université de Strasbourg

Monsieur Norbert NOURY, Professeur des Universités ; UCBL 

20/09/2016 - 14:00 Three-dimensional image analysis of high resolution confocal microscopy data of the Drosophila melanogaster brain

Titre :

Three-dimensional image analysis of high resolution confocal microscopy data of the Drosophila melanogaster brain

Date et heure :

Mardi 20 Septembre 2016 à 14h00

Lieu :

Salle Réunion de CREATIS

Jury :

19/07/2016 - 14:00 Aspects of Data Quality and Interpretation in Medical Imaging
13/05/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Architecture du code pour projets de recherche en Matlab (I) - Comment organiser les expérimentations, tests, validations, l'analyse des résultats et la visualisation ? par Bruno Sciolla.

FiPy : Mate-la bien mon EDP !, un package Python pour aller plus loin que MATLAB pour les Equations aux Dérivées Partielles par Clément Douarre et David Rousseau.

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