Présentations et séminaires à CREATIS

Date Titre Lieu / Résumé
27/10/2017 - 15:00 Single-pixel imaging: development and applications of adaptive methods

Composition du jury :

BARANIUK Richard  - PR - University of Rice - Rapporteur

SOUSSEN Charles - PR - CentraleSupélec - Rapporteur

ARRIDGE Simon - PR - University College London - Examinateur

TARONI Paola - PR - Politecnico di Milano - Examinatrice

D’ANDREA Cosimo - MCF - Politecnico di Milano - Co-directeur de thèse

27/10/2017 - 15:00 Single-pixel imaging: development and applications of adaptive methods

Composition du Jury :

M. BARANIUK Richard Professeur des Universités Rapporteur

M. SOUSSEN Charles Professeur des Universités Rapporteur

M. ARRIDGE Simon Professeur des Universités Examinateur

MME TARONI Paola Professeur des Universités Examinateur

23/10/2017 - 10:30 Recalage de groupes d’images médicales 3D par extraction de points d’intérêt

Composition du Jury :

M. Adrien BARTOLI Professeur des Universités Rapporteur

M. Fabrice HEITZ Professeur des Universités Examinateur

M. Xavier PENNEC Directeur de Recherche Rapporteur

MME Jocelyne TROCCAZ Directeur de Recherche Examinateur

M. Sébastien VALETTE Chargé de Recherche Examinateur

05/10/2017 - 10:00 Traitement et simulations d’images d’IRM de perfusion pour la prédiction de l’évolution de la lésion ischémique dans l’AVC

Composition du Jury :

Mme. Su RUAN PR. Univ ROUEN, rapporteuse

M. Olivier MICHEL PR. Univ GRENOBLE, rapporteur

Mme Stéphanie ALLASSONNIERE PR. Ecole POLYTECHNIQUE, examinatrice

Mme Carole FRINDEL MCF, INSA LYON, co-encadrante

M. Emmanuel GRENIER DR. ENS LYON, co-directeur

M. David ROUSSEAU PR. Université d'ANGERS, Directeur de Thèse

 

19/09/2017 - 14:00 Analyse de la microstructure 3D du tissu cardiaque humain à l’aide de la micro-tomographie à rayons X par contraste de phase.

Composition du Jury :

 

M. Bart BIJNENS Professeur, Université POMPEU-FABRA Rapporteur

Mme Christine FERNANDEZ-MALOIGNE Professeur, Université de POITIERS Rapporteur

M. Theo ARTS Professeur, Université de MAASTRICHT Examinateur

M.  Patrick CLARYSSE Directeur de Recherche CNRS, laboratoire CREATIS Examinateur

M.Pierre-Simon JOUK PUPH, Université JOSEPH FOURIER Examinateur

19/09/2017 - 10:00 Where computational techniques meet clinical practice: understanding the working of the heart in health and disease

Contemporary research in cardiovascular medicine is aimed at both the understanding of the fundamental properties of the cardiovascular system and its changes with disease, as well as providing evidence-based guidelines towards best clinical practice. Linking basic understanding with clinical practice is the objective of translational biomedicine, in which "reality-driven" research is key, underlining the concept that direct human observations are essential for the study of hypotheses relevant to human reality [Mankoff S, Journal of Translational Medicine 2004].

11/09/2017 - 14:00 Unsupervised Models forWhite Matter Fiber-Bundles Analysis in Multiple Sclerosis

Composition du Jury :

Thiran Jean-Philippe                                                                      Rapporteur

Professeur, École polytechnique fédérale de Lausanne

Achard Sophie                                                                                Rapporteur

Chargé de Recherche CNRS, Université Grenoble Alpes

Cotton François                                                                              Examinateur

02/06/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

12h-13h

Développement ultra rapide d'une interface Matlab pour tester les paramètres numériques d'une fonction par Clément Daviller (développeur dans l'industrie puis doctorant à CREATIS).

Session interactive : lambda-calcul ou comment compiler des programmes avec du papier et votre crayon (à amener!) par Pierre Gueth.

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19/05/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

12h-13h

GitHub et l'intégration continue (Travis/Appveyor) par Eric Boix (ingénieur de recherche au LIRIS).

AddressSanitizer & ThreadSanitizer, des alternatives rapides à valgrind par Fabrice Bellet (ingénieur de recherche à CREATIS).

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19/05/2017 - 10:00 « Accelerated Clinical Prompt Gamma simulations for Proton Therapy »

The first part of this PhD program is the development, analysis and release of a variance reductionmethod for the simulation of prompt gammas (PGs) in clinical proton therapy simulations. Thevariance reduction method (named vpgTLE) is a two-stage track length estimation methoddeveloped to estimate the PG yield in voxelized volumes. As primary particles are propagatedthroughout the patient CT, the PG yields are computed at each step, resulting in a voxelized imageof PG production yield.

05/05/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

12h-13h

Retour sur les "bonnes" pratiques de partage de code dans l'équipe 3 par François Varray et Hervé Liebgott.

De l'intérêt du développement en Open Source, l'exemple de GDCM par Jean-Pierre Roux.

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18/04/2017 - 14:00 Simulation numérique de la propagation des ondes dans les tissus mous - Application à l’élastographie transitoire par US
10/04/2017 - 09:00 Journée des Doctorants de Première Année

09h00-09h20 PERROT Vincent : Imagerie ultrasonore rapide et modélisation du mouvement vectoriel de la paroi des vaisseaux et du flux (H.Liebgott, D. Vray) Équipe 3

09h20-09h40 POLICHETTI Maxime : Suivi spatio-temporel 3D de la cavitation par imagerie ultrasonore: application au guidage et contrôle de gestes de thérapie (C.Cachard) Équipe 3

07/04/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Recalage de corps entiers (une centaine de CT-scan 3D) par extraction de points d'intérêt via des optimisations CPU en C/C++ (OpenMP, instructions SIMD, ...) par Rémi Agier.

Comment la documentation peut ressusciter votre code (Elavisu) par Eduardo Davila.

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07/04/2017 - 11:00 Clinical quantitative susceptibility mapping (QSM): Biometal imaging and its emerging roles in patient care

Les travaux de recherche du Dr Wang sont centrés sur l'application de la mathématique, de la physique, de l’ingénierie électronique et de l'informatique dans le développement d'outils visant à améliorer le diagnostique clinique.

 http://vivo.med.cornell.edu/display/cwid-yiwang 

05/04/2017 - 10:30 Conception et développement d'une sonde portable universelle pour l’imagerie optoacoustique-ultrasonore 3D

 L'hybridation de l'imagerie optoacoustique et de l'imagerie ultrasonore pourrait fournir, en plus des informations morphologiques, des informations fonctionnelles et métaboliques des tissus. Cette thèse est principalement consacrée à la conception et à la caractérisation d'une sonde universelle pour l'imagerie volumétrique optoacoustique-ultrasons et le développement d'un algorithme de reconstruction adapté aux contraintes physiques provenant de la conception du système.

24/03/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Illustration de la Programmation Orientée Objet (POO) en Matlab au travers d'un gestionnaire de figures : création d'un singleton, initialisation des figures, création d’événements communs par Clément Daviller.

Liberté, légalité, efficacité : de Matlab à (num)Python, retour d'expérience par Fabien Millioz.

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23/03/2017 - 14:00 Séminaire : Estimation du risque de fracture dans le cas d'un os métastasé
10/03/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Quelques exemples de post-traitement de maillages cardiaques avec VTK par Nicolas Duchateau.

Intégration continue : retour d'expérience suite à la mise en place d'un dashboard CDash s'assurant de la compilation multiplateforme et du passage d'une batterie de tests par Claire Mouto

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14/02/2017 - 08:45 Assemblée Générale du Laboratoire CREATIS

8h45 : Accueil

9h15-10h15 : Informations unités

-Informations générales (O. BEUF) (15’+15’)

-Présentation du budget exécuté 2016 et prévisionnel 2017 (S. VIGNON) (10’+5’)

- Règles et procédures (S. VIGNON) (10’+5’)

10h15-11h15 : Profils et projets de recherche des chercheurs et enseignants chercheurs recrutés en 2016

- Nicolas DUCHATEAU : Traitement d’images multi-modalités/dimensionnelles et modélisation (15’+5’)

10/02/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Une introduction à Docker par Sorina Pop.

Cas d'utilisation de Docker par Geoffroy Berret.

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27/01/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Tester la compilation de vos logiciels facilement avec Travis : l'exemple de vv par Thomas Baudier.

Système de Trig respiratoire sur une base Arduino : le temps réel à la rescousse de vos manips par Denis Grenier.

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13/01/2017 - 12:00 CLUB des Développeurs

Using Python from Matlab par Simon Rit.

Finite-element modelling of the left ventricle using Abaqus and object-oriented programming in Matlab par Kenny Rumindo.

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16/12/2016 - 14:00 Fourier-based reconstruction of ultrafast sectorial images in ultrasound

Résumé :Three-dimensional echocardiography is one of the most widely used modality in real time heart imaging thanks to its noninvasive and low cost. However, the real-time property is limited because of the limited speed of sound. To increase the frame rate, plane wave and diverging wave in transmission have been proposed to drastically reduce the number of transmissions to reconstruct one image. In this thesis, starting with the 2D plane wave imaging methods, the reconstruction of 2D/3D echocardiographic sequences in Fourier domain using diverging waves is addressed.

09/12/2016 - 12:00 CLUB des Développeurs

Modern C++, including news from C++14 ("auto" keyword, range based loop, etc.) par David Sarrut.

C++ HTML5 - le meilleur des deux mondes… / C++ HTML5 - the best of both worlds… par Bertrand David.

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