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Mise en place d’une base de données FAIR interconnectée avec VIP

Objectifs

Ce stage traitera de problématiques de stockage et de traitement FAIR (localisable, accessible, interopérable et retrouvable) des données de recherche issues de la plateforme PILoT.

Pour cela, nous proposons de mettre en place une base de données de type Girder, qui permettra d’accueillir les données issues de PILoT et de gérer leurs droits d’accès conformément au souhait de leur propriétaires. Nous proposons d’extraire et publier les métadonnées pertinentes permettant de rendre ces données localisables et retrouvables. Enfin, pour faire le lien avec les traitements qui peuvent être lancés sur ces données, la base de données sera interconnectée avec la plateforme VIP.

Encadrement

Le stage sera principalement encadré par Laurent Mahieu-Williame, ingénieur de recherche au laboratoire Creatis et expert de la plateforme PILoT. Sorina Pop et Frédéric Cervenansky interviendront aussi pour les aspects liés à la mise en place de  base de données Girder et le portail VIP.

Durée : 5 à 6 mois

Compétences requises :

  • Bonnes compétences en informatique, programmation et systèmes Linux
  • Connaissances en bases de données et/ou traitement de données
  • Rigueur, esprit critique, intérêt pour la recherche

Profil recherché : Informatique, niveau Master ou 5ème année ingénieur

Contact : Sorina Pop, email : sorina.pop[at]creatis.insa-lyon.fr

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