Tumor ID: identification de tumeurs

Responsable du projet

A propos

Points forts

Plusieurs signatures radiomiques et radiogénomiques ont été développées pour la prédiction de la réponse aux traitements systémiques, tels que la chimiothérapie néoadjuvante du cancer du sein triple négatif ou des ostéosarcomes (en collaboration avec le CHU de Nantes et Cochin), ainsi que pour l’immunothérapie du cancer du poumon non à petites cellules (en collaboration avec le CRCL et le centre de lutte contre le cancer Georges-François Leclerc). D’autres applications ont été abordées, telles que : (i) le développement d’un outil d’aide au diagnostic assisté par ordinateur pour la caractérisation des tumeurs des tissus mous lipomateuses en collaboration avec le CHU Cochin et en partenariat avec Capgemini ; et (ii) la classification du génotype clinique et de l’histotype des tumeurs mammaires.

Tumor-ID a également initié le développement de la plateforme serveur/web AWESOMME (pilotée par F. Cervenansky et T. Diot) permettant une gestion multi-expert simplifiée et offrant la possibilité de créer des cohortes enrichies en annotations et en variabilité inter-expert à faible coût, facilitant ainsi une meilleure compréhension de la classification et de la prédiction des issues patients grâce à la recherche en apprentissage automatique via une interface conviviale pour les cliniciens. AWESOMME intègre les signatures radiomiques précédemment développées pour en faciliter la validation à grande échelle et est utilisée dans le cadre du projet INCa BOOST-dataS (piloté par l’Institut Gustave Roussy), auquel A. Bouhamama participe en tant que coordinateur du WP, visant à construire une base de données nationale multi-omique et biologique des ostéosarcomes.

En parallèle de la radiomique, nos développements se sont également concentrés sur une biopsie numérique de la tumeur à partir d’une IRM multiparamétrique quantitative. Grâce à un protocole d’acquisition IRM dédié et une méthode de reconstruction, nous pouvons cartographier un grand nombre de paramètres clés (tels que la cellularité, l’œdème, la micro-perfusion, l’hémorragie, la teneur en graisse, etc.) en plus de la mesure de l’oxygénation tumorale sans injection de produit de contraste. Cet aspect innovant a donné lieu à un dépôt de brevet international (PCT), géré par Inserm Transfert, et ouvre de nouveaux champs d’application que nous avons initiés:

• Radiothérapie adaptative, dont l’objectif est de fractionner spatialement la radiothérapie (dose painting) en fonction de la biologie tumorale en incluant des critères de radio-résistance (i) dans les tumeurs rares à mauvais pronostic telles que les sarcomes, à travers la thèse de doctorat de B. Allignet (MD en radiothérapie), financée par le programme FR-FT Doc. Ces résultats préliminaires ont été récompensés lors du concours i-PHD et un essai clinique interventionnel RIPH2 a été lancé ; (ii) via la thèse de doctorat de W. Dandachly sur les cancers de la tête et du cou, financée par l’ANR PRCE HERESP.
• Radiothérapie adaptative en cours de traitement : grâce à l’absence d’injection de produit de contraste et à une durée d’acquisition compatible, nous avons adapté et transféré le protocole IRM sur un système MRI-Linac 1,5T installé au CHU Lyon Sud (9).

Partenaires

• Waisse WAISSI (Laboratoire CRCL)

• Centre Léon Bérard à Lyon (CLB) 

Membres

• Benjamin LEPORQ
• Benoit ALLIGNET
• Olivier BEUF
• Amine BOUHAMAMA
• Walid DANDACHLY
• Frank PILLEUL

• Pauline MULEKI-SEYA